Molekulare Diagnostik bakterieller Infektionen und Antibiotikaresistenzen in Blutproben und Rektalabstrichen mithilfe fortschrittlicher NGS-Sequenzierungsmethoden (ARES_NGS)
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Phase
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
Verona
-
Negrar, Verona, Italien, 37024
- Rekrutierung
- IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
-
Kontakt:
- Elena Pomari
- Telefonnummer: +390456013111
- E-Mail: elena.pomari@sacrocuore.it
-
Hauptermittler:
- Elena Pomari
-
Unterermittler:
- Pierantonio Orza
-
Unterermittler:
- Francesca Perandin
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Proben von Patienten, bei denen Blutkulturen und MDR-Überwachungstests (Multi Drug Resistance) in Rektaltupfern im IRCCS Sacro Cuore Don Calabria Hospital durchgeführt wurden
- Proben, für die die Information und Zustimmung zur Aufbewahrung biologischer Proben zu Forschungszwecken bei der Tropica Biobank oder unterzeichnet wurde
- Proben, für die es trotz aller zumutbaren Bemühungen nicht möglich war, die Unterschrift der Informationen und die Zustimmung zur Aufbewahrung biologischer Proben für Forschungszwecke bei der Tropica Biobank zu erhalten (z. B. Patienten auf der Intensivstation, immobilisierte Patienten, die nicht in der Lage sind zu gebärden oder schwere Bewusstseinsstörungen aufweisen).
Ausschlusskriterien:
- Fehlen von Daten zur Positivität oder Negativität der interessierenden Keime
- Keine gelagerten Reststoffe
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Diagnose
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Keine (Offenes Etikett)
Anzahl der Arme
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / ArmTeilnehmergruppe / Arm |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
|
Sonstiges: NGS-Analyse
Es werden restliche anonymisierte Proben verwendet, die bei -80 °C in der Tropica Biobank des DITM gelagert werden und für die zuvor am DITM eine diagnostische Analyse auf Keiminfektion durch Blutkultur und MDR-Überwachung in routinemäßigen diagnostischen Rektalabstrichen durchgeführt wurde.
An diesen Restproben wird eine DNA-Extraktion (mit anschließender Qualitäts- und Quantifizierungsanalyse der Nukleinsäure) für nachfolgende NGS-Analysen durchgeführt.
|
Eine in der GENRES-Studie entwickelte Analysepipeline mit NGS-Technologie wird zur Identifizierung infizierender Mikroorganismen und der von ihnen getragenen Arzneimittelresistenz verwendet.
Zu diesem Zweck wird eine Sequenzierungsmethode identifiziert und übernommen, mit der Gensequenzen mit einer Länge von ca. 75 bp und auf der Illumina MiSeq-Plattform gewonnen werden können.
Darüber hinaus werden IT-Software und bioinformatische Analysen mit spezifischen Qualitätskontrollparametern (Vor- und Nachausrichtung der Lesevorgänge) identifiziert und übernommen, um ein IVD-System zu entwickeln, das ein komplettes Paket an Sequenzierungskits und Software umfasst.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Vorhandensein von Mikroorganismen (positiv/negativ)
Zeitfenster: Grundlinie
|
Anwesenheit von Mikroorganismen durch NGS-Technologie identifiziert.
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Grundlinie
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Identifizierung von Mikroorganismen
Zeitfenster: Grundlinie
|
Identifizierung von Mikroorganismen mithilfe der NGS-Technologie.
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Grundlinie
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Identifizierung von Genmutationen, die eine Antibiotikaresistenz vermitteln (resistent/suszeptibel)
Zeitfenster: Grundlinie
|
Ergebnisse (resistent/anfällig), die mithilfe der NGS-Technologie bei der Identifizierung von Genmutationen erzielt wurden, die eine Resistenz gegen Antibiotika vermitteln.
|
Grundlinie
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 2022-13
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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