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Molekulare Diagnostik bakterieller Infektionen und Antibiotikaresistenzen in Blutproben und Rektalabstrichen mithilfe fortschrittlicher NGS-Sequenzierungsmethoden (ARES_NGS)

13. März 2024 aktualisiert von: IRCCS Sacro Cuore Don Calabria di Negrar
Hierbei handelt es sich um eine experimentelle, medikamenten- und gerätefreie, gemeinnützige Studie an biologischen Proben, die in der Tropica Biobank des DITM gelagert werden. Ziel des Projekts ist es, die Leistungsfähigkeit NGS-basierter Assays zu überprüfen, die im Bereich der Mikrobiologie eingesetzt werden können. Die klinischen Evaluierungsuntersuchungen der NGS-Technologie werden an einer ausreichenden Anzahl klinischer Blutproben und Rektalabstrichen durchgeführt. Die Analysen werden mit den standardmäßigen mikrobiologischen Methoden verglichen, die in der DITM-Diagnoseroutine verwendet werden.

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Studientyp

Interventionell

Einschreibung (Geschätzt)

100

Phase

  • Unzutreffend

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

    • Verona
      • Negrar, Verona, Italien, 37024
        • Rekrutierung
        • IRCCS Sacro Cuore Don Calabria hospital
        • Kontakt:
        • Hauptermittler:
          • Elena Pomari
        • Unterermittler:
          • Pierantonio Orza
        • Unterermittler:
          • Francesca Perandin

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Proben von Patienten, bei denen Blutkulturen und MDR-Überwachungstests (Multi Drug Resistance) in Rektaltupfern im IRCCS Sacro Cuore Don Calabria Hospital durchgeführt wurden
  • Proben, für die die Information und Zustimmung zur Aufbewahrung biologischer Proben zu Forschungszwecken bei der Tropica Biobank oder unterzeichnet wurde
  • Proben, für die es trotz aller zumutbaren Bemühungen nicht möglich war, die Unterschrift der Informationen und die Zustimmung zur Aufbewahrung biologischer Proben für Forschungszwecke bei der Tropica Biobank zu erhalten (z. B. Patienten auf der Intensivstation, immobilisierte Patienten, die nicht in der Lage sind zu gebärden oder schwere Bewusstseinsstörungen aufweisen).

Ausschlusskriterien:

  • Fehlen von Daten zur Positivität oder Negativität der interessierenden Keime
  • Keine gelagerten Reststoffe

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Hauptzweck: Diagnose
  • Zuteilung: N / A
  • Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
  • Maskierung: Keine (Offenes Etikett)

Waffen und Interventionen

Teilnehmergruppe / Arm
Intervention / Behandlung
Sonstiges: NGS-Analyse
Es werden restliche anonymisierte Proben verwendet, die bei -80 °C in der Tropica Biobank des DITM gelagert werden und für die zuvor am DITM eine diagnostische Analyse auf Keiminfektion durch Blutkultur und MDR-Überwachung in routinemäßigen diagnostischen Rektalabstrichen durchgeführt wurde. An diesen Restproben wird eine DNA-Extraktion (mit anschließender Qualitäts- und Quantifizierungsanalyse der Nukleinsäure) für nachfolgende NGS-Analysen durchgeführt.
Eine in der GENRES-Studie entwickelte Analysepipeline mit NGS-Technologie wird zur Identifizierung infizierender Mikroorganismen und der von ihnen getragenen Arzneimittelresistenz verwendet. Zu diesem Zweck wird eine Sequenzierungsmethode identifiziert und übernommen, mit der Gensequenzen mit einer Länge von ca. 75 bp und auf der Illumina MiSeq-Plattform gewonnen werden können. Darüber hinaus werden IT-Software und bioinformatische Analysen mit spezifischen Qualitätskontrollparametern (Vor- und Nachausrichtung der Lesevorgänge) identifiziert und übernommen, um ein IVD-System zu entwickeln, das ein komplettes Paket an Sequenzierungskits und Software umfasst.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Vorhandensein von Mikroorganismen (positiv/negativ)
Zeitfenster: Grundlinie
Anwesenheit von Mikroorganismen durch NGS-Technologie identifiziert.
Grundlinie
Identifizierung von Mikroorganismen
Zeitfenster: Grundlinie
Identifizierung von Mikroorganismen mithilfe der NGS-Technologie.
Grundlinie

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Identifizierung von Genmutationen, die eine Antibiotikaresistenz vermitteln (resistent/suszeptibel)
Zeitfenster: Grundlinie
Ergebnisse (resistent/anfällig), die mithilfe der NGS-Technologie bei der Identifizierung von Genmutationen erzielt wurden, die eine Resistenz gegen Antibiotika vermitteln.
Grundlinie

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

28. Juni 2022

Primärer Abschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2024

Studienabschluss (Geschätzt)

1. Dezember 2024

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

6. März 2024

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

13. März 2024

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

20. März 2024

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

20. März 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

13. März 2024

Zuletzt verifiziert

1. März 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Andere Studien-ID-Nummern

  • 2022-13

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

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