Identifikace genomických lokusů určující náchylnost k rozvoji vysoké krátkozrakosti (ASSOMYP)

Myopie je celosvětově rozšířená refrakční oční porucha a je nejčastější zrakovou vadou u člověka. Je odpovědná za velký zdravotní problém, který postihuje přibližně 25 % západní populace. Vysoká myopie je nejzávažnější formou myopického spektra a je definována zvýšením refrakční vady nad -5 dioptrií. Trpí tím asi 2,5 % běžné populace, přičemž sekundární komplikace jsou u těchto pacientů zodpovědné za 4. příčinu právní slepoty. Fyziopatologie krátkozrakosti zůstává neznámá a mechanismy vedoucí k onemocnění jsou s největší pravděpodobností složité a mísí se v nich získané environmentální a genetické faktory. Náš tým v předchozí studii shromáždil a analyzoval důležitou sérii vysoce myopických rodin: Analýzy dědičnosti, segregace a vazeb modelující režim přenosu lokalizovaly dvě hlavní genomové oblasti spojené s vysokou náchylností k myopii na chromozomu 7q36 a chromozomu 7p15. Několik lokusů bylo popsáno jinými týmy pracujícími na stejném tématu mezi různými lidskými populacemi. Velmi nedávné přehodnocení 55 rodin vedlo k vymezení komplexního segregačního modelu fenotypu vysoké myopie, který si nárokuje oligopolygenní způsob přenosu. Tyto výsledky společně vyjadřují potřebu shromáždit více případů a nahradit vazebné studie již provedenými asociačními studiemi, aby se zvýšila schopnost detekce příslušných lokusů.

Nalezení jednoho nebo více genomových lokusů zapojených do vysoké náchylnosti k myopii; polygenní model a analýza asociací je považována za referenční metodu k dešifrování účasti více, málo působících lokusů. Pro genotypizaci budou použity DNA markery SNP/CNV s vysokou hustotou pokrývající celý genom.

Budou shromažďovány fenotypy včetně oftalmologického hodnocení, etnogeografického původu a familiárních údajů, aby bylo možné další stratifikaci nebo shlukování.

Výpočet statistické síly asociační analýzy provedené za účelem minimalizace počtu falešně pozitivních asociací a získání 80% detekční síly ukázal, že je potřeba analyzovat 400 vysoce krátkozrakých subjektů a 400 kontrol.

K překonání problémů s náborem bude využita spolupráce mezi Centrem klinického vyšetřování (CIC) a oftalmologickými klinikami. Extrakce DNA a genotypizace budou prováděny v jednotce Institut national de la santé et de la recherche (INSERM-UPS) v Toulouse pomocí zařízení pro genotypování mikročipů "Toulouse's Génopole".