- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT05581160
Vurder ydeevnen af metagenomisk sekvensering i diagnosticering af STI (NGS-IST) (NGS-IST)
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Seksuelt overførte infektioner (STI'er) er blevet et stort globalt folkesundhedsproblem og er blandt de mest almindelige infektioner. Den øgede antibiotikaresistens, især hos Neisseria gonorrhoeae og Mycoplasma genitalium, giver anledning til bekymring. I øjeblikket er diagnosen af STI'er baseret på specifikke test af patogen, hovedsageligt ved standardkultur, der tillader en antibiotisk modtagelighedstest, genamplifikationstest, der muligvis muliggør søgning efter resistensgener og serologier.
Next-Generation-Sequencing (NGS) er baseret på påvisning og analyse af ethvert DNA og RNA til stede i den undersøgte prøve med en høj grad af følsomhed, denne metode muliggør præcis identifikation af ikke-menneskelige sekvenser uanset deres bakterielle, virale eller parasitologiske oprindelse, for at påvise resistensgener og for at karakterisere stammerne.
Vi foreslår at vurdere ydeevnen af NGS til diagnosticering af STI'er. Vi vil følge en kohorte på 207 PrEP-brugere fra Saint-Antoine Hospital hver 3. måned i 1 år til dette formål.
Hovedformålet med undersøgelsen vil være at vurdere ydeevnen af NGS-diagnostik af Chlamydia trachomatis og Neisseria gonorrhoeae sammenlignet med referenceteknikker.
De sekundære mål vil være (i) at evaluere udførelsen af diagnosen ved NGS af de andre STI'er sammenlignet med referenceteknikkerne, (ii) at evaluere interessen og følsomheden af en 3-steds poolet prøve "urin, hals og endetarm" til diagnosticering af STI'er, (iii) at beskrive den naturlige historie af kolonisering med Mycoplasma genitalium og forekomsten af resistens eller pres fra antibiotikaudvælgelse og (iv) at evaluere prævalensen af midler, der normalt ikke søges ved screening for STI (HSV-1) , HSV-2, Haemophilus ducreyi, Campylobacter sp, Shigella sp, Clostridioides difficile, Entamoeba histolytica).
Forbedret diagnosticering af STI'er og resistens vil muliggøre bedre patientbehandling.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Laure SURGERS, MD
- Telefonnummer: +33 1 71 97 01 19
- E-mail: laure.surgers@aphp.fr
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Hayette Rougier, MSc
- Telefonnummer: +33 149 28 24 05
- E-mail: hayette.rougier.sat@aphp.fr
Studiesteder
-
-
-
Paris, Frankrig, 75012
- Rekruttering
- Service des Maladies Infectieuses et Tropicales Hôpital Saint-Antoine
-
Kontakt:
- Laure SURGERS, MD
- Telefonnummer: +33 1 71 97 01 19
- E-mail: laure.surgers@aphp.fr
-
Paris, Frankrig, 75020
- Rekruttering
- Service des Maladies Infectieuses et Tropicales Hôpital Tenon
-
Kontakt:
- Martin Siguier, MD
- Telefonnummer: +3301156017444/45
- E-mail: martin.siguier@aphp.fr
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Alder ≥ 18 år
- MSM
- PrEP-brugere
- Accept af studiebegrænsninger
- Tilsluttet eller begunstiget af en social sikringsordning eller statslig lægehjælp
- Underskrift på samtykkeerklæring til deltagelse i undersøgelsen
Ekskluderingskriterier:
- Sprogbarriere gør det umuligt at stille spørgsmål.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Våben og indgreb
Deltagergruppe / Arm |
Intervention / Behandling |
---|---|
Eksperimentel: 12-måneders prospektiv multicenter langsgående kohorte med den biologiske prøveindsamling.
Dette er en enkeltarms interventionsundersøgelse.
Efter accept af undersøgelsen (underskrift af informeret samtykkeformular) inkluderes patienter i enkeltarmsinterventionsstudiet i en periode på 12 måneder med opfølgningsbesøg hver 3. måned og mellembesøg i tilfælde af symptomernes tilstedeværelse eller seksuelle kontakter med partnere med kønssygdomme (svarende til standardbehandling for PrEP-brugerne).
|
Forslag om undersøgelsen til alle kvalificerede voksne patienter, der kommer til præ-eksponeringsprofylakse (PrEP) konsultationer fra Infectious Diseases Department of Saint-Antoine og Tenon Hospitaler (med levering af en patients information og underskrift af en informeret samtykkeformular). Under hvert besøg (D0, M3, M6, M9, M12 og mellemliggende besøg) vil patienter blive bedt om at:
Diagnosen af STI'er (NG og MG) vil blive udført ved hjælp af 2 teknikker: referenceteknikken og Next-Generation-Sequencing (NGS) teknikken. En serumprøve vil blive indsamlet under rutinepleje. Alle prøver vil efter analysen blive opbevaret under -80°C. |
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
At evaluere ydeevnen af NGS metagenomisk diagnose af Chlamydia trachomatis (Ct) og Neisseria gonorrhoeae (Ng) sammenlignet med referenceteknikker.
Tidsramme: 12 måneder
|
Sensitivitet, specificitet, positive og negative prædiktive værdier af NGS sammenlignet med referenceteknikker for Ng og Ct.
|
12 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
At evaluere udførelsen af diagnosen ved NGS af de andre STI'er sammenlignet med referenceteknikkerne.
Tidsramme: 12 måneder
|
Sensitivitet, specificitet, positive og negative prædiktive værdier af NGS sammenlignet med referenceteknikker for andre seksuelt overførte infektioner (STI'er).
|
12 måneder
|
Beskriv epidemiologien af cirkulerende stammer ved molekylær typning.
Tidsramme: 12 måneder
|
Samlet antal tilfælde af Ct, Ng, midler, der normalt ikke screenes for i STI-screening sammenlignet med antallet af forsøgspersoner på tidspunktet for deres inklusion i studiekohorten, med 95 % konfidensinterval.
|
12 måneder
|
Estimer forekomsten og beskriv den naturlige historie af kolonisering af Mycoplasma genitalium (Mg).
Tidsramme: 12 måneder
|
Antal nye tilfælde Mycoplasma genitalium (Mg) sammenlignet med antallet af forsøgspersoner fulgt i studiekohorten pr. måneds opfølgning.
|
12 måneder
|
Estimer forekomsten af forekomst af Mycoplasma genitalium-resistens under antibiotikaudvælgelsestryk.
Tidsramme: 12 måneder
|
Antal nye tilfælde af Mycoplasma genitalium (Mg) sammenlignet med antallet af forsøgspersoner fulgt i studiekohorten pr. måneds opfølgning under antibiotikaudvælgelsestryk.
|
12 måneder
|
Karakteriser cirkulerende Neisseria gonorrhoeae (Ng) kloner.
Tidsramme: 12 måneder
|
Samlet antal tilfælde af cirkulerende Neisseria gonorrhoeae (Ng) kloner sammenlignet med antallet af forsøgspersoner på tidspunktet for deres optagelse i undersøgelseskohorten, med 95 % konfidensinterval.
|
12 måneder
|
Karakteriser de cirkulerende serotyper af Chlamydia trachomatis (Ct).
Tidsramme: 12 måneder
|
Samlet antal tilfælde af cirkulerende serotyper af Chlamydia trachomatis (Ct) sammenlignet med antallet af forsøgspersoner på tidspunktet for deres optagelse i studiekohorten, med 95 % konfidensinterval.
|
12 måneder
|
Estimer forekomsten af stoffer, der normalt ikke screenes for i STI-screening (HSV-1, HSV-2, HPV, Mycoplasma hominis, Ureaplasma sp, Haemophilus ducreyi, Campylobacter sp, Shigella sp, Clostridium difficile, Entamoeba histolytica).
Tidsramme: 12 måneder
|
Antal nye tilfælde af midler, der normalt ikke testes for i STI-screening sammenlignet med antallet af forsøgspersoner fulgt i studiekohorten pr. måneds opfølgning.
|
12 måneder
|
Bestem de faktorer, der er forbundet med STI-hændelser.
Tidsramme: 12 måneder
|
Hazard ratio af determinanter (faktorer) associationer med STI tilfælde forekomsten.
|
12 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Studiestol: Karine Lacombe, Pr, PhD, IPLESP INSERM UMR-S1136
- Ledende efterforsker: Laure Surgers, MD, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales Hôpital Saint-Antoine
- Ledende efterforsker: Martin Siguier, MD, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales et Tenon Hôpital
- Studieleder: Christophe Rodriguez, MD, INSERM U955 Eq18 CHU Henri Mondor
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Abdool Karim Q, Abdool Karim SS, Frohlich JA, Grobler AC, Baxter C, Mansoor LE, Kharsany AB, Sibeko S, Mlisana KP, Omar Z, Gengiah TN, Maarschalk S, Arulappan N, Mlotshwa M, Morris L, Taylor D; CAPRISA 004 Trial Group. Effectiveness and safety of tenofovir gel, an antiretroviral microbicide, for the prevention of HIV infection in women. Science. 2010 Sep 3;329(5996):1168-74. doi: 10.1126/science.1193748. Epub 2010 Jul 19. Erratum In: Science. 2011 Jul 29;333(6042):524.
- Molina JM, Charreau I, Chidiac C, Pialoux G, Cua E, Delaugerre C, Capitant C, Rojas-Castro D, Fonsart J, Bercot B, Bebear C, Cotte L, Robineau O, Raffi F, Charbonneau P, Aslan A, Chas J, Niedbalski L, Spire B, Sagaon-Teyssier L, Carette D, Mestre SL, Dore V, Meyer L; ANRS IPERGAY Study Group. Post-exposure prophylaxis with doxycycline to prevent sexually transmitted infections in men who have sex with men: an open-label randomised substudy of the ANRS IPERGAY trial. Lancet Infect Dis. 2018 Mar;18(3):308-317. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30725-9. Epub 2017 Dec 8.
- Chaix ML, Charreau I, Pintado C, Delaugerre C, Mahjoub N, Cotte L, Capitant C, Raffi F, Cua E, Pialoux G, Tremblay C, Meyer L, Molina JM; ANRS IPERGAY Study Group. Effect of On-Demand Oral Pre-exposure Prophylaxis With Tenofovir/Emtricitabine on Herpes Simplex Virus-1/2 Incidence Among Men Who Have Sex With Men: A Substudy of the ANRS IPERGAY Trial. Open Forum Infect Dis. 2018 Nov 8;5(11):ofy295. doi: 10.1093/ofid/ofy295. eCollection 2018 Nov.
- Deschamps O, Ortonne N, Hue S, Rodriguez C, Deschodt C, Hirsch G, Colin A, Gregoire L, Delfau-Larue MH, Chosidow O, Wolkenstein P, Ingen-Housz-Oro S. Acute exanthemas: a prospective study of 98 adult patients with an emphasis on cytokinic and metagenomic investigation. Br J Dermatol. 2020 Feb;182(2):355-363. doi: 10.1111/bjd.18166. Epub 2019 Aug 9.
- Fourati S, Rodriguez C, Hezode C, Soulier A, Ruiz I, Poiteau L, Chevaliez S, Pawlotsky JM. Frequent Antiviral Treatment Failures in Patients Infected With Hepatitis C Virus Genotype 4, Subtype 4r. Hepatology. 2019 Feb;69(2):513-523. doi: 10.1002/hep.30225. Epub 2019 Jan 5.
- Hernando Rovirola C, Spiteri G, Sabido M, Montoliu A, Gonzalez V, Casabona J, Cole MJ, Noori T, Unemo M. Antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae isolates from foreign-born population in the European Gonococcal Antimicrobial Surveillance Programme. Sex Transm Infect. 2020 May;96(3):204-210. doi: 10.1136/sextrans-2018-053912. Epub 2020 Feb 4.
- Hoornenborg E, Coyer L, Achterbergh RCA, Matser A, Schim van der Loeff MF, Boyd A, van Duijnhoven YTHP, Bruisten S, Oostvogel P, Davidovich U, Hogewoning A, Prins M, de Vries HJC; Amsterdam PrEP Project team in the HIV Transmission Elimination AMsterdam (H-TEAM) Initiative. Sexual behaviour and incidence of HIV and sexually transmitted infections among men who have sex with men using daily and event-driven pre-exposure prophylaxis in AMPrEP: 2 year results from a demonstration study. Lancet HIV. 2019 Jul;6(7):e447-e455. doi: 10.1016/S2352-3018(19)30136-5. Epub 2019 Jun 6.
- Looker KJ, Elmes JAR, Gottlieb SL, Schiffer JT, Vickerman P, Turner KME, Boily MC. Effect of HSV-2 infection on subsequent HIV acquisition: an updated systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis. 2017 Dec;17(12):1303-1316. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30405-X. Epub 2017 Aug 23.
- Nieuwenhuis RF, Ossewaarde JM, Gotz HM, Dees J, Thio HB, Thomeer MG, den Hollander JC, Neumann MH, van der Meijden WI. Resurgence of lymphogranuloma venereum in Western Europe: an outbreak of Chlamydia trachomatis serovar l2 proctitis in The Netherlands among men who have sex with men. Clin Infect Dis. 2004 Oct 1;39(7):996-1003. doi: 10.1086/423966. Epub 2004 Sep 8.
- Ong JJ, Baggaley RC, Wi TE, Tucker JD, Fu H, Smith MK, Rafael S, Anglade V, Falconer J, Ofori-Asenso R, Terris-Prestholt F, Hodges-Mameletzis I, Mayaud P. Global Epidemiologic Characteristics of Sexually Transmitted Infections Among Individuals Using Preexposure Prophylaxis for the Prevention of HIV Infection: A Systematic Review and Meta-analysis. JAMA Netw Open. 2019 Dec 2;2(12):e1917134. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2019.17134.
- Rodriguez C, Jary A, Hua C, Woerther PL, Bosc R, Desroches M, Sitterle E, Gricourt G, De Prost N, Pawlotsky JM, Chosidow O, Sbidian E, Decousser JW; Multidisciplinary Necrotizing Fasciitis Study Group. Pathogen identification by shotgun metagenomics of patients with necrotizing soft-tissue infections. Br J Dermatol. 2020 Jul;183(1):105-113. doi: 10.1111/bjd.18611. Epub 2019 Dec 2.
- Rodriguez C, Gricourt G, Ndebi M, Demontant V, Poiteau L, Burrel S, Boutolleau D, Woerther PL, Calvez V, Stroer S, Pawlotsky JM. Fatal Encephalitis Caused by Cristoli Virus, an Emerging Orthobunyavirus, France. Emerg Infect Dis. 2020 Jun;26(6):1287-1290. doi: 10.3201/eid2606.191431.
- Sitterle E, Rodriguez C, Mounier R, Calderaro J, Foulet F, Develoux M, Pawlotsky JM, Botterel F. Contribution of Ultra Deep Sequencing in the Clinical Diagnosis of a New Fungal Pathogen Species: Basidiobolus meristosporus. Front Microbiol. 2017 Mar 7;8:334. doi: 10.3389/fmicb.2017.00334. eCollection 2017.
- Unemo M, Shafer WM. Antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae in the 21st century: past, evolution, and future. Clin Microbiol Rev. 2014 Jul;27(3):587-613. doi: 10.1128/CMR.00010-14.
- Van Praet JT, Steyaert S, Vandecasteele S, Van Den Bergh B, Mahieu H, De Buyser S, Grootaert V, Descheemaeker P, Reynders M. Mycoplasma genitalium acquisition and macrolide resistance after initiation of HIV pre-exposure prophylaxis in men who have sex with men. Sex Transm Infect. 2020 Sep;96(6):396-398. doi: 10.1136/sextrans-2019-054335. Epub 2020 Jan 2.
- Wilson MR, Sample HA, Zorn KC, Arevalo S, Yu G, Neuhaus J, Federman S, Stryke D, Briggs B, Langelier C, Berger A, Douglas V, Josephson SA, Chow FC, Fulton BD, DeRisi JL, Gelfand JM, Naccache SN, Bender J, Dien Bard J, Murkey J, Carlson M, Vespa PM, Vijayan T, Allyn PR, Campeau S, Humphries RM, Klausner JD, Ganzon CD, Memar F, Ocampo NA, Zimmermann LL, Cohen SH, Polage CR, DeBiasi RL, Haller B, Dallas R, Maron G, Hayden R, Messacar K, Dominguez SR, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis. N Engl J Med. 2019 Jun 13;380(24):2327-2340. doi: 10.1056/NEJMoa1803396.
- Wilson MR, Naccache SN, Samayoa E, Biagtan M, Bashir H, Yu G, Salamat SM, Somasekar S, Federman S, Miller S, Sokolic R, Garabedian E, Candotti F, Buckley RH, Reed KD, Meyer TL, Seroogy CM, Galloway R, Henderson SL, Gern JE, DeRisi JL, Chiu CY. Actionable diagnosis of neuroleptospirosis by next-generation sequencing. N Engl J Med. 2014 Jun 19;370(25):2408-17. doi: 10.1056/NEJMoa1401268. Epub 2014 Jun 4.
- Surgers L, Chiarabini T, Royer G, Rougier H, Mercier-Darty M, Decre D, Valin N, Woerther PL, Decousser JW, Girard PM, Lacombe K, Boyd A. Evidence of Sexual Transmission of Extended-Spectrum beta-Lactamase-Producing Enterobacterales: A Cross-sectional and Prospective Study. Clin Infect Dis. 2022 Oct 29;75(9):1556-1564. doi: 10.1093/cid/ciac218.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Skøn)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- IMEA62
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Chlamydia Trachomatis-infektion
-
D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology...Aktiv, ikke rekrutterendeInfertilitet | Chlamydia Trachomatis-infektion | Antichlamydia antistoffer | Tubal Factor InfertilitetDen Russiske Føderation
-
Region ÖstergötlandUkendtChlamydia Trachomatis Genital Infektion | Chlamydia Trachomatis-infektion i anus og endetarmSverige
-
University Hospital of North NorwayHelse NordAfsluttetSeksuelt overførte sygdomme | Chlamydia TrachomatisNorge
-
Binx Health LimitedAfsluttetGonoré | Chlamydia TrachomatisForenede Stater
-
Hologic, Inc.AfsluttetGonoré | Chlamydia TrachomatisForenede Stater
-
Evofem Inc.Clinical Research Management, Inc.Afsluttet
-
Statens Serum InstitutImperial College LondonAfsluttetChlamydia TrachomatisDet Forenede Kongerige
-
Gen-Probe, IncorporatedTrukket tilbageChlamydia TrachomatisForenede Stater
-
Centers for Disease Control and PreventionState University of New York - Downstate Medical CenterAfsluttetChlamydia Trachomatis | Neisseria GonorrhoeaeForenede Stater
-
Maastricht University Medical CenterNational Institute for Public Health and the Environment (RIVM); ZonMw:... og andre samarbejdspartnereAfsluttetChlamydia Trachomatis-infektionHolland