GIST : Évaluation des mutations tumorales et de l'exposition au plasma TKI

Le traitement des patients néerlandais GIST est centralisé : presque tous les patients sont référés à l'un des cinq centres collaborateurs formant le consortium néerlandais GIST, UMCG, NKI-AvL, Radboud UMC, Erasmus MC et LUMC. Pour optimiser davantage le traitement de tous les patients, ces centres ont mis en place un plan de diagnostic et de traitement standard qui assure la collecte de données phénotypiques et thérapeutiques homogènes pour la bio-banque de données. Le consortium est soutenu par et travaille en étroite collaboration avec les organisations néerlandaises de patients atteints de sarcome et de GIST.

Une bio-banque prospective et longitudinale sera mise en place. Les données concernant la multi-morbidité, la pharmacocinétique des médicaments et les données génotypiques tumorales en série seront collectées de manière prospective auprès de tous les (nouveaux) patients GIST pendant le traitement par TKI. Notre plan de soins standard comprend une analyse de mutation tumorale primaire, effectuée par des laboratoires de pathologie sur place. À chaque visite de suivi pendant le traitement, du sang sera prélevé pour évaluer l'exposition au plasma TKI et pour effectuer une analyse de mutation sur l'ADN tumoral en circulation. Tous les patients seront suivis pour la progression de la tumeur RECIST 1.1 évaluée par tomodensitométrie et invités à subir une biopsie tumorale à la progression pour détecter les mutations de résistance secondaires.

Le développement d'un modèle prédictif de la résistance secondaire à l'imatinib basé sur le phénotype du patient et le génotype de la tumeur, sera réalisé en analysant les patients GIST avec une maladie évolutive sous imatinib (patients index ; n = 30) dans notre bio-banque de données. Ces patients seront appariés 1:1 avec des patients non progressifs traités pendant la même durée que les patients index. En ce qui concerne les patients index, une analyse des mutations ciblées sur les gènes de nouvelle génération sera effectuée sur du matériel tumoral d'archives et sur une biopsie tumorale à la progression pour identifier les mutations secondaires uniques du patient. Les mutations qui seront étudiées sont : KIT exon 9, exon 11, exon 13, exon 14, exon 17 et exon 18 ; PDGFRA exon 12, exon 14 et exon 18 et BRAF exon 10 et exon 15.

Une analyse approfondie concernant l'analyse des mutations dans l'ADN tumoral circulant et l'évaluation de la concentration du médicament imatinib sera effectuée pour ces 60 patients.