Dépistage du CCR à l'aide de mSEPT9 (septine méthylée 9) dans la population chinoise (RESEPT)

1. Arrière plan

   Le cancer colorectal (CCR) est la troisième tumeur maligne la plus fréquente du système gastro-intestinal. Un dépistage régulier, une détection précoce et un traitement précoce du cancer colorectal peuvent permettre une meilleure prévention et même une meilleure guérison. Actuellement, 60 à 70 % des patients atteints de CCR ne sont diagnostiqués qu'à un stade avancé et seuls 11,8 % des cas sont détectés à un stade précoce. Il est donc urgent de réduire la mortalité par CCR en améliorant le taux de dépistage précoce. En Chine, le test de recherche de sang occulte dans les selles (FOBT) et la coloscopie sont actuellement disponibles pour le dépistage précoce du CCR. La RSOS est largement utilisée en raison de son faible coût et de son caractère non invasif, cependant, son taux de faux positifs est relativement élevé en raison de nombreux facteurs interférents. Le FOBT, test immunochimique fécal (FIT), plus avancé, a considérablement amélioré la spécificité du test par rapport à la méthode chimique traditionnelle et sa conformité est élevée, mais il est toujours soumis à l'influence d'autres maladies intestinales, ce qui entraîne une faible valeur prédictive positive. En revanche, l'observance de la coloscopie est faible en raison de son caractère invasif, de son coût et du risque de complications.

   Ces dernières années, le test de méthylation du gène SEPT9 basé sur le plasma s'est avéré être une méthode prometteuse pour la détection précoce du CCR. De nombreuses études cliniques ont démontré que le gène SEPT9 méthylé est un biomarqueur utile pour la détection précoce du CCR. À l'heure actuelle, l'Epi proColon 2.0 CE d'Epigenomics est le seul test commercialisé de méthylation du gène SEPT9 dans le monde. Ce produit a obtenu l'approbation de la certification CE de l'Union européenne, de la FDA chinoise et de la FDA argentine. Il a terminé la soumission des données cliniques clés à la FDA américaine, avec une attente raisonnable de l'approbation de la FDA américaine bientôt. Des services basés sur le test de méthylation du gène SEPT9 sont également fournis dans des laboratoires cliniques tels que quest, Arup, compagnon de DX et gamma dynacare avec le code de procédure médicale commun (code CPT) 81401. En Chine, BioChain (Beijing) Science and Technology, Inc, un partenaire solide d'Epigenomics AG, a développé son propre test de méthylation du gène SEPT9 avec l'accord d'Epigenomics AG.

2. Estimation de la taille de l'échantillon

   Sur la base de l'équation N = Z2 * (P (1-p)) / E2 pour le taux de détection de positivité connu, les enquêteurs ont calculé le nombre d'échantillons nécessaires pour l'essai, dans lequel N représente la taille de l'échantillon, Z est un paramètre statistique ( Z = 1,96 pour un intervalle de confiance à 95 % ); E représente l'erreur (5 % a été choisi dans cette étude) et P représente la probabilité (taux de détection positif putatif). Les enquêteurs ont choisi 0,75 pour la valeur P sur la base de la littérature existante sur la sensibilité SEPT9. Le nombre de cas de CCR est calculé à 288 sur la base de l'équation ci-dessus. Les enquêteurs visent à collecter des informations complètes pour 300 cas en raison de l'incomplétude des informations et de la perte de suivi. etc. Sur la base de l'estimation selon laquelle le CCR représente 30 % des patients ambulatoires et hospitalisés à haut risque dans les hôpitaux chinois, le nombre total de patients dans l'essai ne devrait pas être inférieur à 1 000 cas. Les investigateurs visent à recruter 1200 cas dans cet essai en tenant compte d'un taux de perte de suivi de 20 %.

   Le nombre réel final de cas pour cet essai était de 1031, en raison d'une perte de suivi, de tests ou de données cliniques incomplets, ou d'échantillons qui ne répondaient pas aux critères de test.

3. Regroupement de sujets

   Tous les patients ne seront pas regroupés avant le prélèvement sanguin pour le test SEPT9, et des échantillons de sang seront obtenus pour tous les sujets qui répondaient aux critères de sélection. Tous les techniciens sont aveugles aux informations cliniques des sujets. Afin d'étudier la faisabilité de la détection conjointe avec le test SEPT9 et d'autres tests de dépistage, des tests d'antigène carcino-embryonnaire (CEA) et FIT seront effectués à la volonté des patients participants et au jugement des médecins. Cette partie des données sera utilisée dans une analyse rétrospective après la fin de l'essai.

   Lorsque tous les tests prévus sont terminés, tous les sujets seront divisés en trois groupes en fonction du diagnostic et de la pathologie de la coloscopie, le groupe CRC, le groupe de maladies précancéreuses et le groupe d'autres maladies, dans lequel le groupe CRC est composé de patients atteints de stade 0-IV CRC, le groupe de maladies précancéreuses comprend les patients atteints d'adénome et de polypes, et le groupe d'autres maladies comprend les patients d'autres maladies intestinales, d'autres cancers et les sujets sans signe de maladie.

4. Procédure d'essai

   La formation sera terminée avant le début de l'essai, y compris la procédure de fonctionnement du test et l'utilisation des kits et des instruments. Cet essai est une étude randomisée en simple aveugle. Tous les patients doivent signer le consentement éclairé avant le prélèvement sanguin de 10 ml. Les échantillons seront traités et le test SEPT9 sera effectué conformément aux instructions destinées aux utilisateurs. Tous les sujets recevront une coloscopie et/ou un examen pathologique pour confirmer le diagnostic, et les résultats du test SEPT9 seront décidés en fonction des instructions aux utilisateurs. Une analyse statistique sera effectuée sur la base des résultats du test SEPT9 et de la coloscopie et/ou de l'examen pathologique.

5. Prélèvement et stockage des échantillons

1) prélèvement d'échantillons :

1. échantillon doit être prélevé auprès de patients ambulatoires ou hospitalisés et les informations sur l'échantillon doivent être enregistrées dans des formulaires de prélèvement d'échantillons.
2. prélèvement d'échantillon : 10 mL de sang périphérique (décagulant K2EDTA uniquement).
3. Afin d'assurer l'exactitude du test, la collecte d'échantillons doit être effectuée strictement sur la base des exigences ci-dessus, sinon cela peut affecter la précision du test.

2) Méthode de stockage et de transport des échantillons : Stocker et transférer les échantillons selon les instructions d'utilisation du kit

6, essai SEPT9

Le test de méthylation du gène SEPT9 (méthode de la sonde de fluorescence PCR) est composé de deux étapes. Tout d'abord, l'ADN acellulaire dans le plasma est extrait à l'aide du kit de traitement du plasma, suivi d'une conversion au bisulfite, dans laquelle la cytosine non méthylée sera convertie tandis que la cytosine méthylée ne le sera pas. Deuxièmement, une PCR en temps réel utilisant de l'ADN converti au bisulfite (bisDNA) comme matrice sera effectuée pour déterminer l'amplification de la matrice. L'agent de blocage PCR et les sondes spécifiques à la méthylation peuvent fonctionner ensemble pour faire la distinction entre l'ADN méthylé et non méthylé. La bêta-actine sera utilisée comme contrôle interne pour évaluer la qualité de l'ADN plasmatique et la validité de l'amplification par PCR. Des contrôles positifs et négatifs seront fournis dans le kit en tant que contrôles de qualité et seront exécutés parallèlement aux échantillons à chaque fois.

7, analyse des données et statistiques

Les données du test SEPT9 et les données de la coloscopie de tous les sujets seront collectées et analysées, les paramètres suivants seront calculés :

Sensibilité Spécificité Cohérence valeur prédictive positive (VPP) valeur prédictive négative (VPN)

8, éthique

Le plan budgétaire de l'essai clinique sera soumis au comité d'éthique des hôpitaux participants pour examen avant le début de l'essai clinique. L'étude ne sera initiée qu'après approbation par les commissions. Tous les sujets signeront le consentement éclairé avant le prélèvement sanguin et seront informés de l'utilisation du plasma et des résultats des tests.

9, progrès de la recherche

2014.02-2014.04 Confirmation des protocoles d'essais cliniques et formation du personnel pour le prélèvement et le test des échantillons

2014.04-2014.08 Soumission de la demande d'essai clinique au comité d'éthique pour approbation dans quatre hôpitaux

2014.08-2015.04 Commencer le recrutement des patients et la collecte d'informations générales sur les sujets

2014.10-2015.04 Prélèvement d'échantillons et tests

2015.04-2015.07 Recueillir et suivre les informations sur la coloscopie et/ou la pathologie

2015.07-2015.09 Traitement des données, statistiques et analyse

2015.10 Clôture du recrutement des patients et fin de l'essai

10,Budget

Les coûts comprennent les dépenses de recrutement de 1200 sujets, les frais de location d'équipement, les coûts du matériel de test, les frais de traitement des échantillons, les coûts de main-d'œuvre, les coûts d'indemnisation des patients, les frais de voyage et de conférence, les frais de publication et de propriété intellectuelle (PI). Toutes les dépenses seront couvertes par BioChain, car cet essai est initié et organisé par BioChain.

11,Publication et propriétés intellectuelles

1. prévoient de publier 2 à 3 articles dans des revues indexées par le SCI (Science Citation Index), 3 à 4 articles dans des revues nationales chinoises.
2. envisagez de déposer un brevet

12, gestion des données

La qualité des données des essais cliniques est la base de l'évaluation des résultats. Pour s'assurer de la réalité et de la fiabilité des résultats expérimentaux, les chercheurs ont mis en place une série de principes de gestion des données. Les enquêteurs expliqueront en détail les principes de gestion des données dans cette étude dans ce qui suit à partir de la composition et de la responsabilité du comité de gestion des données et du contenu de la gestion des données.

13.Équipe et personnel de recherche

Afin d'éviter les erreurs possibles causées par la différence d'incidence de la maladie et le ratio de patients dans différents hôpitaux, quatre hôpitaux de Pékin seront choisis pour le recrutement des patients dans cet essai clinique. Les patients de ces quatre hôpitaux étant principalement originaires du nord de la Chine, la population étudiée est représentative de l'épidémiologie de la maladie dans cette partie du pays. Des médecins et techniciens du service des maladies gastro-intestinales, d'endoscopie et de chirurgie générale des quatre hôpitaux participeront à l'essai, il s'agit de :

Hôpital du Collège médical de l'Union de Pékin (Pékin) Hôpital général militaire de Pékin (Pékin) Hôpital du cancer Académie chinoise des sciences médicales (Pékin) Hôpital du cancer de Pékin (Pékin)