Taxonomie moléculaire du lymphome nodal de la zone marginale

Le matériel biologique tumoral déjà existant et codé et les données des patients liées à la santé seront collectés rétrospectivement à partir des biobanques institutionnelles et des dossiers des patients ou des dossiers médicaux électroniques après réception de l'approbation éthique. Chaque patient inscrit à l'étude se verra attribuer un code numérique d'identification unique lors de son inscription à l'étude. Le code d'identification unique sera utilisé pour enregistrer les données relatives à la santé et pour étiqueter les échantillons biologiques. Le matériel biologique codé sera transféré au centre de coordination de l'Institut d'oncologie de la Suisse méridionale et de l'Institut de recherche en oncologie de Bellinzone. Les données relatives à la santé seront collectées dans l'eCRF (OpenClinica). La qualité des données sera assurée par la génération de requêtes.

Les caractéristiques de base annotées comprendront la date du diagnostic, la date de la biopsie des ganglions lymphatiques, l'âge, le sexe, l'ECOG PS, le stade d'Ann Arbor, la LDH, le nombre et l'emplacement des sites extranodaux, l'atteinte et le pourcentage de la moelle osseuse, l'atteinte du sang périphérique, le nombre de sites nodaux, Symptômes B, ganglions lymphatiques de plus de 7 cm, Hb, plaquettes, lymphocytes, bêta-2-microglobuline, albumine, infection par le VHC, paraprotéine sérique et type.

Les caractéristiques de suivi annotées comprenaient la date de progression vers une maladie nécessitant un traitement, le type de traitement de première ligne, la date de début du traitement de première ligne, la date de progression après le traitement de première ligne, la date du traitement de deuxième ligne, le type de traitement de deuxième ligne, la date de transformation, date du décès, cause du décès, date du dernier suivi.

L'analyse des mutations, l'analyse du réarrangement des gènes d'immunoglobulines, l'analyse des aberrations du nombre de copies, l'analyse des variantes structurelles et le profil de méthylation de l'ADN seront effectués par séquençage de nouvelle génération de l'ADN génomique extrait de la biopsie des ganglions lymphatiques. L'expression des gènes sera évaluée par séquençage de nouvelle génération de l'ARN extrait de la biopsie des ganglions lymphatiques.