Microfluidica e trascrittomica nei pazienti sottoposti a trapianto di organi solidi

I due obiettivi specifici dello studio di ricerca sono i seguenti: 1) Proof of concept con due parti. In primo luogo, il piano di studio è dimostrare che le cellule T che sono molto comunemente coinvolte nella risposta immunitaria: le popolazioni CD2, CD3, CD4 e CD8 possono essere catturate. Queste cellule saranno catturate, lisate e la loro genomica di mRNA sarà mappata. La seconda parte della prova del concetto comporterà l'esposizione ex vivo delle popolazioni CD2, CD3, CD4 e CD8 a varie concentrazioni sieriche di tacrolimus, il principale farmaco immunosoppressore cardine nel trapianto di organi solidi. L'esposizione dei tre tipi di cellule alle varie concentrazioni di tacrolimus dimostrerà che esistono test in grado di rilevare i trascritti di mRNA corrispondenti a stati sotto, ottimali e sovra immunosoppressi. Verrà quindi misurata la produzione quantitativa di IL2 dei tre tipi cellulari nelle varie condizioni immunosoppressive. Con queste 2 parti del primo obiettivo specifico dello studio, sarà stata dimostrata una tecnica che può isolare prontamente e facilmente le popolazioni cellulari di interesse dai pazienti trapiantati e può catturare come queste popolazioni cellulari rispondono all'immunosoppressione a varie concentrazioni. 2) Il secondo obiettivo specifico dello studio di ricerca è l'esecuzione di questo profilo genomico su pazienti trapiantati di rene. Per questa parte dello studio, ci saranno due coorti. Una coorte identificata come gruppo "prospettico" e una coorte etichettata come gruppo "evento". Per la potenziale coorte, il sangue verrà prelevato dai pazienti in momenti specifici. Nello specifico, i campioni di sangue saranno prelevati nel contesto pre-trapianto quando i pazienti si presentano in ospedale per il trapianto, quindi al giorno 0, 1, 2, 3 e 7 post-trapianto di rene (+/- 1 giorno) e al giorno 14, 21 e 28 (+/-3 giorni). I campioni di sangue saranno prelevati nuovamente ai mesi 2, 3, 6, 9 e 12 (+/- 1 settimana). Per il secondo gruppo, i campioni di sangue verranno prelevati al momento degli "eventi", come rigetto, infezione, ecc., e applicheranno la stessa serie di test al loro sangue. Per questo gruppo, i prelievi di sangue verranno eseguiti al tempo 0 (+/-1 giorno), quindi a una settimana (+/-2 giorni) e dopo uno, due e tre mesi (+/-1 settimana) 0. Saranno raccolti cinque campioni di sangue per paziente. Per tutti i pazienti, ci sarà un confronto delle informazioni cliniche standard raccolte sul paziente - funzione dell'innesto, rigetto, infezione, livelli di immunosoppressione - con i risultati della nostra trascrittomica. Il culmine del progetto comporterà la rivelazione di come la genomica dei tipi specifici di cellule T possa riflettere in modo più preciso il vero stato immunosoppresso di un paziente corrispondendo a fenotipi clinici immunosoppressivi alti, ottimali e bassi, e quindi consentire ai medici del trapianto di somministrare immunosoppressivi in ​​modo più intelligente e accurato farmaci.

Questo studio comporterà l'ottenimento di campioni di sangue sui pazienti sottoposti a trapianto di rene nel momento in cui altrimenti avrebbero prelevato il sangue per le cure cliniche standard. Sarà ottenuto il consenso per il test sul loro sangue, ma i pazienti non soffriranno alcun ulteriore dolore o disagio del test. In coordinamento con le attrezzature e le forniture attualmente utilizzate dalla ricerca del dipartimento di traumatologia e terapia intensiva, gli investigatori organizzeranno la raccolta e la gestione dei laboratori in modo efficiente in termini di tempo e minimamente costoso