Mikrofluidyka i transkryptomika u pacjentów po przeszczepie narządów

Dwa szczegółowe cele badania są następujące: 1) Dowód słuszności koncepcji składający się z dwóch części. Po pierwsze, plan badań polega na udowodnieniu, że limfocyty T, które bardzo często biorą udział w odpowiedzi immunologicznej: populacje CD2, CD3, CD4 i CD8, mogą zostać przechwycone. Komórki te zostaną przechwycone, poddane lizie, a ich genomika mRNA zostanie zmapowana. Druga część weryfikacji koncepcji będzie polegać na wystawieniu populacji CD2, CD3, CD4 i CD8 ex vivo na różne stężenia takrolimusu w surowicy — podstawowego leku immunosupresyjnego stosowanego w przeszczepach narządów miąższowych. Ekspozycja trzech typów komórek na różne stężenia takrolimusu wykaże, że istnieją testy, które mogą wykrywać transkrypty mRNA odpowiadające stanom niedostatecznej, optymalnej i nadmiernej immunosupresji. Następnie będzie mierzona ilościowa produkcja IL2 przez trzy typy komórek w różnych warunkach immunosupresyjnych. Dzięki tym 2 częściom pierwszego szczegółowego celu badania zostanie zademonstrowana technika, która może łatwo i łatwo wyizolować populacje komórek będących przedmiotem zainteresowania od pacjentów po przeszczepach i może uchwycić, w jaki sposób te populacje komórek reagują na immunosupresję w różnych stężeniach. 2) Drugim szczegółowym celem badania jest przeprowadzenie tego profilowania genomowego biorców przeszczepu nerki. W tej części badania będą dwie kohorty. Kohorta zidentyfikowana jako grupa „potencjalna” i kohorta oznaczona jako grupa „wydarzenie”. W przypadku kohorty prospektywnej krew będzie pobierana od pacjentów w określonych punktach czasowych. W szczególności próbki krwi będą pobierane przed przeszczepem, gdy pacjenci zgłaszają się do szpitala w celu przeszczepienia, następnie w dniach 0, 1, 2, 3 i 7 po przeszczepie nerki (+/- 1 dzień) oraz w dniu 14, 21 i 28 (+/-3 dni). Próbki krwi zostaną ponownie pobrane w miesiącach 2, 3, 6, 9 i 12 (+/- 1 tydzień). W przypadku drugiej grupy próbki krwi zostaną pobrane w czasie „zdarzeń”, takich jak odrzucenie, infekcja itp., i zastosują tę samą serię testów do ich krwi. W przypadku tej grupy pobieranie krwi zostanie przeprowadzone w czasie 0 (+/- 1 dzień), następnie w tygodniu (+/- 2 dni) oraz w jednym, dwóch i trzech miesiącach (+/- 1 tydzień) po czasie 0. Od jednego pacjenta zostanie pobranych pięć próbek krwi. Dla wszystkich pacjentów zostanie porównane standardowo zebrane informacje kliniczne o pacjencie – funkcja przeszczepu, odrzucenie, infekcja, poziomy immunosupresji – z wynikami naszej transkryptomiki. Zwieńczeniem projektu będzie odkrycie, w jaki sposób genomika określonych typów limfocytów T może dokładniej odzwierciedlać stan rzeczywistej immunosupresji pacjenta, odpowiadając fenotypom klinicznym o wysokim, optymalnym i niskim poziomie immunosupresji, a tym samym umożliwić klinicystom zajmującym się przeszczepami bardziej inteligentne i dokładniejsze podawanie leków immunosupresyjnych leki.

Badanie to będzie obejmowało pobieranie próbek krwi od pacjentów po przeszczepie nerki w czasie, w którym w innym przypadku pobrano by u nich krew do standardowej opieki klinicznej. Uzyskana zostanie zgoda na badanie ich krwi, ale pacjent nie będzie odczuwał dodatkowego bólu ani niedogodności związanych z badaniem. W koordynacji ze sprzętem i materiałami używanymi obecnie w badaniach na oddziale urazów i intensywnej terapii, badacze zorganizują gromadzenie i prowadzenie laboratoriów w sposób efektywny czasowo i minimalnie kosztowny