ブリティッシュ コロンビア州の個別化オンコゲノミクス (POG) プログラム

発がんは非常に複雑なプロセスであり、肺や乳房の腺がんなどの組織学的がんサブタイプ内でさえ、がんの挙動や治療への反応に大きなばらつきがあります。 個々の患者の分析は、検査されたすべての癌に固有の分子シグネチャを示しています。 多くの場合、複数の異なる経路が病気の成長と進行に関与しており、支配的なプロセスは人によって異なり、おそらく同じ人の病気の異なる部位内でさえも異なります. 同様に、これらの変動は治療に応じて進化します。

疾患を促進する遺伝子異常を認識することで、標的治療が容易になります。これは、特定の遺伝子変異または転座が標的化学療法剤でうまく治療された癌のいくつかの小さなサブグループで実証されています。 多くの認められた突然変異と異常により、DNA と RNA にエンコードされた遺伝子シグネチャーの個別化された評価は、重要な診断情報を提供し、適切な腫瘍経路への直接治療を可能にする可能性があり、それによって化学療法の選択を導くのに役立つ情報を提供します。

私たちの最初のパイロットプロジェクトは、私たちの施設（100人の患者）でこのアプローチの実現可能性を実証しました。 現在、患者の特定と同意、ゲノムとトランスクリプトームの配列決定、異常の分析と報告、臨床的に適切な時間枠での潜在的な実行可能な標的の特定が可能であることがわかっています。

Personalized OncoGenomics (POG) プログラムは、2012 年から BC 州全体で運用されています。 最初の 2 年間のフェーズでは、転移性または不治のがん患者を特定し、同意を得て、臨床的に認定されたラボでゲノム配列決定のために生検するためのインフラストラクチャとワークフローを確立しました (Laskin et al., 2015)。 POG プログラムの次のフェーズ (2014 ～ 2017 年) には、BC Cancer の腫瘍内科医の 83 人 (80%) が同意して患者を POG に登録するように訓練されるなど、強力な教育および関与プロセスが含まれていました。 これは、BC 州の腫瘍学コミュニティが、がんゲノミクスと、これらのデータを個々の患者に適用する方法について幅広い教育を受けていることを意味します。 2017 年以降、このプログラムはバンクーバーがんセンターの第 1 相臨床試験ユニットに統合され、焦点は研究患者とデータを使用して、CCTG C​​APTUR 研究などのより焦点を絞った臨床治療試験に取り組むことに移行しました (Skamene et al., 2018 ）。 POG のような WGTA は、カナダ全土で癌ゲノム データを共有するための国家プログラムである希望癌センター ネットワーク (MOHCCN) のテリー フォックス マラソンの創設の原動力となっています。

この POG プログラムの包括的なテーマは、特定のがん表現型の根底にある遺伝子パターンに関する深い洞察を生み出し、貴重な予後および予測情報を提供できる体細胞がん変異および細胞経路異常の包括的な目録を作成することです。

適格な被験者は、いくつかのサンプルを分析します：新鮮な腫瘍生検（通常、5つのコアが必要です）、正常な比較のための血液サンプル、および利用可能な場合のアーカイブ腫瘍。 また、パラフィン包埋材料の使用を検討できるように技術が向上しました。 包括的な DNA および RNA シーケンシングが実行され、続いて詳細なバイオインフォマティクス分析が行われ、体細胞変異、遺伝子発現の変化、または癌の「ドライバー」である可能性のある他の異常を特定したり、実行可能 (診断) または薬の開発につながる可能性のある標的を提供したりします。 POG チームは毎週集まり、患者の詳細なゲノム レポートについて話し合い、必要に応じて追加の検証テストを検討し、研究上の疑問について議論します。 臨床医 (通常は 5 ～ 10 人) は、これらの結果に基づいて適切な全身療法について合意に達します。 可能な限り、被験者は臨床試験に合わせられます。