브리티시 컬럼비아의 맞춤형 종양유전체학(POG) 프로그램

발암은 매우 복잡한 과정이므로 조직학적 암 하위 유형(예: 폐 또는 유방의 선암종) 내에서도 암 행동 및 치료에 대한 반응에 상당한 변동성이 있습니다. 개별 환자에 대한 분석은 검사된 모든 암에 대해 고유한 분자 시그니처를 보여줍니다. 종종 여러 경로가 질병의 성장과 진행에 관여하며 지배적인 과정은 사람마다 다르며 아마도 한 사람 내에서 질병의 다른 부위 내에서도 다를 수 있습니다. 또한 이러한 변이는 치료에 대한 반응으로 진화합니다.

질병을 촉진하는 유전적 이상을 인식하면 표적 치료가 용이해집니다. 이것은 특정 유전적 돌연변이 또는 전좌가 표적 화학요법제로 성공적으로 치료된 암의 여러 작은 하위 그룹에서 입증되었습니다. 인식된 많은 돌연변이 및 이상과 함께 DNA 및 RNA에 인코딩된 유전자 서명의 개인화된 평가는 중요한 진단 정보를 제공할 수 있으며 잠재적으로 적절한 종양 경로에 대한 지시된 치료를 가능하게 하여 화학 요법 선택을 안내하는 데 도움이 되는 정보를 제공합니다.

우리의 초기 파일럿 프로젝트는 우리 기관(환자 100명 포함)에서 이 접근 방식의 타당성을 입증했습니다. 우리는 이제 환자를 식별 및 동의하고, 게놈 및 전사체를 시퀀싱하고, 이상을 분석 및 보고하고, 임상적으로 관련된 시간 프레임에서 잠재적인 실행 가능한 표적을 식별하는 것이 가능하다는 것을 알고 있습니다.

POG(Personalized OncoGenomics) 프로그램은 2012년부터 BC주 전역에서 운영되고 있습니다. 초기 2년 단계에서는 전이성 또는 치료 불가능한 암 환자를 식별, 동의 및 임상적으로 공인된 실험실에서 게놈 시퀀싱을 위해 생검할 수 있는 인프라 및 작업 흐름을 확립했습니다(Laskin et al., 2015). POG 프로그램의 다음 단계(2014 - 2017)에는 BC Cancer의 의료 종양 전문의의 83명(80%)이 POG에 동의하고 환자를 등록하도록 교육받은 강력한 교육 및 참여 프로세스가 포함되었습니다. 이는 BC 주의 종양학 커뮤니티가 암 유전체학과 이러한 데이터가 개별 환자에게 어떻게 적용될 수 있는지에 대한 폭넓은 교육을 받았다는 것을 의미합니다. 2017년부터 이 프로그램은 Vancouver Cancer Centre의 1상 임상 시험 부서에 통합되었으며 CCTG CAPTUR 연구(Skamene et al., 2018 ). POG와 같은 WGTA는 캐나다 전역에서 암 게놈 데이터 공유를 위한 국가 프로그램인 MOHCCN(Terry Fox Marathon of Hope Cancer Center Network)을 만드는 원동력이 되었습니다.

이 POG 프로그램의 가장 중요한 주제는 특정 암 표현형의 기초가 되는 유전 패턴에 대한 심오한 통찰력을 생성하고 귀중한 예후 및 예측 정보를 제공할 수 있는 체세포암 돌연변이 및 세포 경로 이상에 대한 포괄적인 목록을 작성하는 것입니다.

적격 피험자는 새로운 종양 생검(일반적으로 5개의 코어가 필요함), 정상적인 비교를 위한 혈액 샘플 및 사용 가능한 경우 보관 종양과 같은 여러 샘플을 분석합니다. 또한 파라핀 내장 소재 사용을 고려할 수 있을 정도로 기술이 향상되었습니다. 포괄적인 DNA 및 RNA 염기서열 분석이 수행된 후 심도 있는 생물정보학적 분석을 수행하여 암 "동인"이 될 수 있는 체세포 돌연변이, 유전자 발현 변화 또는 기타 이상을 식별하거나 실행 가능한(진단) 또는 약물 대상을 제공할 수 있습니다. POG 팀은 매주 만나 환자에 대한 자세한 게놈 보고서를 논의하고, 필요한 경우 추가 검증 테스트를 고려하고, 연구 질문에 대해 토론합니다. 임상의(일반적으로 5 - 10명)는 이러한 결과를 기반으로 적절한 전신 요법에 대해 합의합니다. 가능할 때마다 피험자는 임상 시험과 일치합니다.