Programa de Oncogenômica Personalizada (POG) da Colúmbia Britânica

A carcinogênese é um processo imensamente complexo, de modo que mesmo dentro de um subtipo histológico de câncer - por exemplo, adenocarcinoma do pulmão ou da mama - existe uma variabilidade significativa no comportamento do câncer e na resposta à terapia. Análises de pacientes individuais demonstram assinaturas moleculares únicas para cada câncer examinado. Freqüentemente, vários caminhos diferentes estão envolvidos no crescimento e progressão da doença e o processo dominante varia de pessoa para pessoa e talvez até mesmo dentro de diferentes locais da doença dentro de uma pessoa. Também essas variações evoluem em resposta ao tratamento.

O reconhecimento de aberrações genéticas que promovem doenças facilita o tratamento direcionado; isso foi demonstrado em vários pequenos subgrupos de cânceres nos quais mutações ou translocações genéticas específicas foram tratadas com sucesso com agentes quimioterápicos direcionados. Com muitas mutações e aberrações reconhecidas, a avaliação personalizada da assinatura genética codificada no DNA e no RNA pode fornecer informações diagnósticas importantes e potencialmente permitir a terapia direcionada para a via oncológica apropriada, fornecendo informações para ajudar a orientar as escolhas de quimioterapia

Nosso projeto piloto inicial demonstrou a viabilidade dessa abordagem em nossa instituição (com 100 pacientes). Agora sabemos que é possível identificar e consentir pacientes, sequenciar o genoma e o transcriptoma, analisar e relatar anormalidades e identificar possíveis alvos acionáveis ​​em um período de tempo clinicamente relevante.

O programa OncoGenomics Personalizado (POG) está em operação em toda a província de BC desde 2012. A fase inicial de dois anos estabeleceu a infraestrutura e o fluxo de trabalho pelos quais pacientes com cânceres metastáticos ou incuráveis ​​poderiam ser identificados, consentidos e biopsiados para sequenciamento genômico em um laboratório clinicamente credenciado (Laskin et al., 2015). A próxima fase do programa POG (2014 - 2017) incluiu um forte processo educacional e de engajamento, de modo que 83 (80%) dos oncologistas médicos do BC Cancer foram treinados para consentir e inscrever pacientes no POG. Isso significa que a comunidade oncológica em BC tem uma ampla educação em genômica do câncer e como esses dados podem ser aplicados a pacientes individuais. Desde 2017, o programa foi integrado à unidade de ensaios clínicos de fase 1 do Vancouver Cancer Centre e o foco mudou para usar os pacientes e dados do estudo para abordar ensaios clínicos terapêuticos mais focados, como o estudo CCTG CAPTUR (Skamene et al., 2018 ). O WGTA semelhante ao POG tem sido a força motriz por trás da criação da rede Terry Fox Marathon of Hope Cancer Center (MOHCCN), que é um programa nacional de compartilhamento de dados genômicos do câncer em todo o Canadá.

O tema abrangente deste Programa POG é criar uma catalogação abrangente de mutações somáticas do câncer e anormalidades da via celular que possam gerar insights profundos sobre padrões genéticos subjacentes a fenótipos específicos de câncer e fornecer informações prognósticas e preditivas valiosas.

Indivíduos elegíveis terão várias amostras analisadas: uma biópsia de tumor fresco (normalmente são necessários 5 núcleos), uma amostra de sangue para comparação normal e tumores de arquivo quando disponíveis. Além disso, a tecnologia melhorou tanto que podemos considerar o uso de materiais embebidos em parafina. O sequenciamento abrangente de DNA e RNA é realizado seguido por uma análise bioinformática aprofundada para identificar mutações somáticas, alterações na expressão gênica ou outras anormalidades que possam ser "condutores" do câncer ou fornecer alvos acionáveis ​​(diagnósticos) ou drogáveis. A equipe do POG se reúne todas as semanas para discutir os relatórios genômicos detalhados dos pacientes, considerar testes de validação adicionais quando necessário e debater questões de pesquisa. Os médicos (normalmente 5 a 10) chegam a um consenso sobre quais terapias sistêmicas podem ser apropriadas com base nesses resultados. Sempre que possível, os indivíduos são combinados com ensaios clínicos.