Czynniki prognostyczne zakażeń krwi wywołanych przez Escherichia coli: stopień nasilenia i implikacje terapeutyczne (SEPTICOLI)

Projekt ten będzie prowadzony we współpracy między ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS (lub paryskimi szpitalami klinicznymi) a grupą badawczą ds. infekcji, środków przeciwdrobnoustrojowych, modelowania i ewolucji (IAME). NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM).

To badanie jest prospektywnym, wieloośrodkowym, nieinterwencyjnym badaniem obserwacyjnym, które obejmie do 500 pacjentów z 7 szpitali.

Centra naukowe:

Uczestniczy w nim siedem szpitali zrzeszonych w grupie badawczej IAME i należących do sieci ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS. Siedem szpitali to szpitale dydaktyczne trzeciego stopnia z Paryża lub pobliskich przedmieść, będące częścią sieci ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS. Stanowią one łącznie 4230 łóżek dla dorosłych przeznaczonych do intensywnej opieki. Łącznie w tych ośrodkach wystąpiło 780 BSI E. coli w ciągu 1 roku, przy czym 15% szczepów wytwarzających ESBL.

Badanie to obejmie dorosłych pacjentów hospitalizowanych w jednym z siedmiu uczestniczących ośrodków w oparciu o kryteria włączenia i wyłączenia wymienione poniżej. Łącznie 14 badaczy klinicznych (CI) i badaczy mikrobiologicznych (MI) będzie odpowiedzialnych za włączenie pacjentów i gromadzenie danych w każdym z 7 ośrodków badawczych.

Odwiedziny.

Zorganizowane zostaną dwie wizyty:

Wizyta 1: dzień włączenia pacjenta do badania (=dzień wyniku pierwszego dodatniego posiewu krwi)

Wizyta 2: dzień, w którym pacjent opuszcza szpital lub 28 dzień po Wizycie 1, jeśli pacjent jest nadal hospitalizowany.

Podczas wizyty 1 szczep E. coli odpowiedzialny za BSI, jak również wszelkie inne próbki dodatnie zostaną zakonserwowane i przesłane do centralnego laboratorium w celu pełnego sekwencjonowania genomu szczepów E. coli (IAME Laboratory, University Paris DIDEROT). Badacze przeanalizują charakterystykę molekularną szczepów przy użyciu wysokowydajnych technik sekwencjonowania, aby spróbować wyróżnić czynniki wirulencji i porównają wyniki z danymi klinicznymi.

Punkty końcowe

Pierwszorzędowym punktem końcowym tej pracy jest śmierć w dniu 28 (lub wizyta 2).

Wiele drugorzędowych punktów końcowych zostanie zbadanych w dniu 28, w tym długość pobytu w szpitalu i potrzeba intensywnej terapii.

Statystyka

W przypadku pierwszorzędowego punktu końcowego badacze przeanalizują czynniki ryzyka związane ze zgonem w dniu 28 (tak/nie) za pomocą regresji logistycznej. Kliniczne czynniki ryzyka osiągające wartość P < 0,10 zostaną następnie wprowadzone do wielowymiarowego modelu regresji logistycznej. Metoda selekcji wstecznej zostanie zastosowana w celu uzyskania modelu, w którym wszystkie kliniczne czynniki ryzyka mają wartość P <0,05. Po drugie, przy użyciu podobnego podejścia zbadany zostanie związek między śmiercią a różnymi czynnikami bakteriologicznymi. Po trzecie, zostanie przeprowadzona ostateczna wielowymiarowa regresja logistyczna, dodając czynniki bakteryjne do ostatecznego modelu z klinicznymi czynnikami ryzyka i przeprowadzając analizę wsteczną. Badacze przeprowadzą również analizę eksploracyjną w celu zbadania związku między wszystkimi genami E. coli a śmiercią, w modelu dostosowanym do ważnych czynników klinicznych, jak zdefiniowano powyżej.

Badacze wykorzystają wyniki analizy wielowymiarowej do opracowania klinicznej ciężkości BSI E. coli, zwanej COLISCORE. Celem COLISCORE jest przewidywanie stopnia zaawansowania choroby i wyniku leczenia przy przyjęciu oraz pomoc klinicyście w podejmowaniu wstępnych decyzji dotyczących postępowania. Wynik ten powinien być prosty i łatwy do wykorzystania przy łóżku pacjenta.