Facteurs pronostiques des bactériémies à Escherichia Coli : score de gravité et implications thérapeutiques (SEPTICOLI)

Ce projet sera mené en collaboration entre l'ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS et le groupe de recherche Infection, Antimicrobiens, Modélisation et Évolution (IAME), mandat conjoint de l'Université Paris DIDEROT, de l'Université Paris Nord et de l'INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE (INSERM).

Cette étude est une étude observationnelle prospective multicentrique non interventionnelle, qui inclura jusqu'à 500 patients de 7 hôpitaux.

Centres d'études :

Sept hôpitaux affiliés au groupe de recherche IAME et inclus dans le réseau ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS y participeront. Les sept hôpitaux sont tous des CHU de Paris ou de la proche couronne du réseau ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS. Ils représentent un total de 4 230 lits adultes en soins aigus. Au total, 780 E. coli BSI sont survenues dans ces centres en 1 an avec 15 % de souches productrices de BLSE.

Cette étude inclura des patients adultes hospitalisés dans l'un des sept centres participants sur la base des critères d'inclusion et d'exclusion énumérés ci-dessous. Au total, 14 investigateurs cliniques (IC) et investigateurs en microbiologie (IM) seront responsables de l'inclusion des patients et de la collecte des données dans chacun des 7 centres d'étude.

Visites.

Deux visites seront organisées :

Visite 1 : jour de l'inclusion du patient dans l'étude (= jour des résultats de la première hémoculture positive)

Visite 2 : jour où le patient quitte l'hôpital ou jour 28 après la visite 1 s'il est toujours hospitalisé.

Lors de la visite 1, la souche E. coli responsable de la BSI ainsi que tout autre échantillon positif seront conservés et envoyés à un laboratoire central pour séquençage complet du génome des souches E. coli (Laboratoire IAME, Université Paris DIDEROT). Les chercheurs analyseront les caractéristiques moléculaires des souches à l'aide de techniques de séquençage à haut débit pour tenter de mettre en évidence des facteurs de virulence et compareront les résultats avec les données cliniques.

Points finaux

Le critère d'évaluation principal de ce travail est la mort au jour 28 (ou visite 2).

Plusieurs paramètres secondaires seront étudiés au jour 28, y compris la durée du séjour à l'hôpital et le besoin de soins intensifs.

Statistiques

Pour le critère d'évaluation principal, les enquêteurs analyseront les facteurs de risque associés au décès au jour 28 (oui/non) à l'aide d'une régression logistique. Les facteurs de risque cliniques atteignant une valeur P < 0,10 seront ensuite entrés dans le modèle de régression logistique multivariée. Une méthode de rétrosélection sera utilisée pour obtenir un modèle dans lequel tous les facteurs de risque cliniques ont une valeur P < 0,05. Dans un deuxième temps, le lien entre la mort et divers facteurs bactériologiques sera étudié selon une approche similaire. Troisièmement, une régression logistique multivariée finale sera effectuée en ajoutant des facteurs bactériens au modèle final avec des facteurs de risque cliniques et en effectuant une analyse en arrière. Les chercheurs effectueront également une analyse exploratoire pour étudier l'association entre tous les gènes d'E. coli et la mort, dans un modèle ajusté avec les facteurs cliniques importants tels que définis ci-dessus.

Les enquêteurs utiliseront les résultats de l'analyse multivariée pour élaborer un score de gravité clinique pour E. coli BSI, appelé COLISCORE. L'objectif du COLISCORE est de prédire la gravité et l'évolution des patients à l'admission et d'aider les premières décisions de prise en charge du clinicien. Ce score doit être simple et facile à utiliser au lit du patient.