Prognostiske faktorer ved Escherichia coli blodstrømsinfeksjoner: alvorlighetsgrad og terapeutiske implikasjoner (SEPTICOLI)

Dette prosjektet vil bli utført som et samarbeid mellom ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS (eller Paris undervisningssykehus) og forskningsgruppen Infection, Antimicrobials, Modeling and Evolution (IAME), en felles avtale fra Paris DIDEROT University, Paris Nord University og INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RCHERCHE MEDICAL (INSERM).

Denne studien er en prospektiv multisentrisk ikke-intervensjonell observasjonsstudie, som vil omfatte opptil 500 pasienter fra 7 sykehus.

Studiesentre:

Syv sykehus tilknyttet IAME-forskningsgruppen og inkludert i ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS-nettverket vil delta. De syv sykehusene er alle undervisningssykehus for tertiær omsorg fra Paris eller de nære forstedene, en del av nettverket ASSISTANCE PUBLIQUE HOPITAUX DE PARIS. De utgjør totalt 4230 akuttomsorgssenger for voksne. Totalt 780 E. coli BSI forekom i disse sentrene i løpet av 1 år med 15 % av ESBL-produserende stammer.

Denne studien vil inkludere voksne pasienter innlagt på et av de syv deltakende sentrene basert på inklusjons- og eksklusjonskriteriene som er oppført nedenfor. Totalt 14 kliniske etterforskere (CI) og mikrobiologiske etterforskere (MI) vil være ansvarlige for pasientenes inkludering og datainnsamling i hvert av de 7 studiesentrene.

Besøk.

Det vil bli arrangert to besøk:

Besøk 1: dagen for pasientens inkludering i studien (=dagen for resultatene av den første positive blodkulturen)

Besøk 2: dag pasienten forlater sykehuset eller dag 28 etter besøk 1 hvis de fortsatt er innlagt.

Ved besøk 1 vil E. coli-stammen som er ansvarlig for BSI samt enhver annen positiv prøve bli konservert og sendt til et sentrallaboratorium for full genomsekvensering av E. coli-stammene (IAME Laboratory, University Paris DIDEROT). Etterforskerne vil analysere de molekylære egenskapene til stammer ved å bruke sekvenseringsteknikker med høy gjennomstrømning for å prøve å fremheve virulensfaktorer og vil sammenligne resultatene med kliniske data.

Endepunkter

Det primære endepunktet for dette arbeidet er død på dag 28 (eller besøk 2).

Flere sekundære endepunkter vil bli studert på dag 28, inkludert lengden på sykehusoppholdet og behovet for intensivbehandling.

Statistikk

For det primære endepunktet vil etterforskerne analysere risikofaktorene knyttet til død på dag 28 (ja/nei) ved hjelp av logistisk regresjon. De kliniske risikofaktorene som oppnår en P-verdi < 0,10 vil deretter legges inn i den multivariate logistiske regresjonsmodellen. En baklengs seleksjonsmetode vil bli brukt for å få en modell der alle kliniske risikofaktorer har en P-verdi < 0,05. For det andre vil sammenhengen mellom død og ulike bakteriologiske faktorer bli studert ved å bruke en lignende tilnærming. For det tredje vil en endelig multivariat logistisk regresjon bli utført som legger til bakterielle faktorer til den endelige modellen med kliniske risikofaktorer og utfører en bakoveranalyse. Etterforskerne vil også utføre en utforskende analyse for å studere sammenhengen mellom alle E. coli-genene og død, i en modell justert med de viktige kliniske faktorene som definert ovenfor.

Etterforskerne vil bruke resultatene fra den multivariate analysen til å utarbeide en klinisk alvorlighetsgrad for E. coli BSI, kalt COLISCORE. Målet med COLISCORE er å forutsi pasientens alvorlighetsgrad og utfall ved innleggelse og hjelpe klinikerens første ledelsesbeslutninger. Denne poengsummen skal være enkel og lett å bruke ved pasientens seng.