Zastosowanie NGS w zakażeniu wodobrzuszem

Marskość wątroby jest częstą poważną chorobą przewlekłą. Na marskość wątroby na całym świecie choruje około 123 milionów pacjentów, a każdego roku z powodu marskości wątroby umiera około 1 miliona osób. Odsetek zakażeń bakteryjnych u hospitalizowanych pacjentów z marskością wątroby wynosi od 25% do 46%, wśród których najczęstszym typem zakażenia u pacjentów z marskością wątroby jest samoistne bakteryjne zapalenie otrzewnej (SBP). Po wczesnej i rozsądnej diagnozie i leczeniu śmiertelność pacjentów z marskością wątroby i SBP można zmniejszyć z ponad 90% do około 20%. Dlatego szybka i dokładna diagnoza jest bardzo pomocna w poprawie rokowania u pacjentów z marskością wątroby i SBP. Jednak obecnie tradycyjne metody wykrywania są czasochłonne przy niskim wskaźniku wykrywalności i nie pozwalają na wykrycie bakterii wewnątrzkomórkowych i niektórych innych rodzajów patogenów.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) to stosunkowo nowa technologia wykrywania, która może wykrywać informacje o sekwencji kwasu nukleinowego w sposób wysokowydajny i na dużą skalę. Może wykrywać patogeny kompleksowo, szybko i dokładnie. W ostatnich latach NGS stopniowo przekształcił się z narzędzia badawczego w metodę diagnostyczną. Wiele badań wykazało, że NGS ma lepszą wartość aplikacyjną w zakażeniach krwi, chorobach zakaźnych oczu, chorobach zakaźnych ośrodkowego układu nerwowego i chorobach zakaźnych układu oddechowego. Wciąż jednak brakuje badań nad zastosowaniem NGS do wykrywania mikroorganizmów chorobotwórczych w wodobrzuszu. Dlatego też, porównując sekwencję nowej generacji (NGS) i tradycyjną technologię detekcji w wykrywaniu patogenów w wodobrzuszu, niniejsze badanie miało na celu ocenę wartości NGS w diagnostyce patogenetycznej zakażenia wodobrzuszem.