Anvendelse av NGS ved ascitesinfeksjon

Levercirrhose er en vanlig alvorlig kronisk sykdom. Det er rundt 123 millioner pasienter med levercirrhose over hele verden, og rundt 1 million mennesker dør av levercirrhose hvert år. Andelen bakteriell infeksjon hos innlagte pasienter med levercirrhose er mellom 25 % og 46 %, blant disse er spontan bakteriell peritonitt (SBP) den vanligste infeksjonstypen hos pasienter med levercirrhose. Etter tidlig og rimelig diagnose og behandling kan dødeligheten av cirrhotiske pasienter med SBP reduseres fra mer enn 90 % til ca. 20 %. Derfor er rask og nøyaktig diagnose til stor hjelp for å forbedre prognosen for cirrhotiske pasienter med SBP. Imidlertid er de tradisjonelle deteksjonsmetodene for tiden tidkrevende med lav deteksjonshastighet, og kan ikke oppdage intracellulære bakterier og noen andre typer patogener.

Neste generasjons sekvensering (NGS) er en relativt ny deteksjonsteknologi som kan oppdage nukleinsyresekvensinformasjonen på en storstilt måte. Den kan oppdage patogenene omfattende, raskt og nøyaktig. NGS har de siste årene gradvis gått over fra et forskningsverktøy til en diagnostisk metode. Mange studier har vist at NGS har bedre bruksverdi ved blodbaneinfeksjoner, øyeinfeksjonssykdommer, infeksjonssykdommer i sentralnervesystemet og luftveisinfeksjoner. Det mangler imidlertid fortsatt forskning på bruk av NGS for påvisning av patogene mikroorganismer i ascites. Derfor, ved å sammenligne neste generasjons sekvens (NGS) og tradisjonell deteksjonsteknologi i påvisning av patogener i ascites, hadde denne studien som mål å evaluere verdien av NGS i den patogene diagnosen ascitesinfeksjon.