Krążące DNA nowotworu w chłoniakach z obwodowych komórek T (CIRCULATE)

W tym obserwacyjnym prospektywnym badaniu kohortowym chcemy przetestować zastosowanie małoinwazyjnej biopsji płynnej (osocza krwi) do wykrywania ctDNA u pacjentów z nowo zdiagnozowaną lub nawrotową/oporną na leczenie PTCL. U każdego włączonego pacjenta diagnostyczna biopsja tkanki zawierającej guz, a także wyjściowa próbka osocza zostaną poddane sekwencjonowaniu nowej generacji (NGS) w celu zidentyfikowania mutacji somatycznych specyficznych dla nowotworu. Celem NGS będzie identyfikacja zmian genomicznych w genach, o których wiadomo, że są powiązane z PTCL. Biopsja guza zostanie oceniona pod kątem zmian w 172 genach, o których wiadomo, że są zmienione przez docelowe NGS w komórkach T, a także w innych nowotworach hematologicznych. Ponadto będziemy używać testu klonalności limfocytów T TCRB + TCRG firmy Invivoscribe firmy Invivoscribe do identyfikacji klonalnych rearanżacji genów w łańcuchu beta i łańcuchu gamma receptora komórek T (dwa geny). Badanie to zostanie przeprowadzone na biopsjach pobranych w ramach standardowej oceny diagnostycznej PTCL i nie będą wykonywane żadne dalsze biopsje inwazyjne.

Na podstawie analizy NGS dla każdego pacjenta zostanie zaprojektowany cyfrowy test reakcji łańcuchowej polimerazy kropelkowej (ddPCR). Metoda ddPCR będzie wykorzystywana do wykrywania ctDNA w osoczu w chwili postawienia diagnozy oraz później w określonych punktach czasowych podczas leczenia i w okresie obserwacji.

W tych samych określonych punktach czasowych zostaną wykonane skany PET/CT do późniejszej analizy porównawczej. U pacjentów z PTCL rutynowo wykonuje się badania PET/CT przed rozpoczęciem leczenia, w jego trakcie, na końcu oraz po przeszczepieniu hematopoetycznych komórek macierzystych. W ramach rutynowych badań kontrolnych regularnie wykonuje się tomografię komputerową co 6 miesięcy przez pierwsze 2 lata obserwacji po leczeniu i co roku przez ostatnie 3 lata 5-letniego okresu obserwacji. W tym badaniu chcemy wykonać 4 skany PET/CT zamiast 4 regularnych tomografii komputerowej, które wykonuje się w ciągu pierwszych 2 lat rutynowej obserwacji.

Aktywny udział pacjenta (tj. pobieranie krwi do analizy ctDNA i skanów PET/CT) ma trwać do 27 miesięcy od włączenia. Kontrola przeżycia w celu analizy przeżycia będzie prowadzona przez okres do 5 lat od włączenia.

Stawiamy hipotezę, że zastosowany w tym badaniu test ddPCR oparty na NGS, wykorzystujący informacje o nowotworze i osoczu, zapewni bardzo czułe i specyficzne narzędzie do prognozowania, oceny odpowiedzi i wykrywania nawrotu u pacjentów z PTCL.