Bättre avgränsning av BCL11B-relaterad fenotyp och epigenetisk signatur.

Utredarna strävar efter att bättre förstå och avgränsa det genetiska syndromet BCL11B (a.k.a. Intellektuell utvecklingsstörning med dysmorfa ansiktsuttryck, talförseningar och T-cellsabnormalitetssyndrom eller IDSFTA).

Denna genetiska störning beskrevs i juni 2017 i American Journal of Human Genetics (PMID 28575647).

Sedan denna första publicering av 23 individer som bär på den patogena mutationen BCL11B har en annan individ rapporterats i litteraturen (PMID 30549423).

Dessutom fokuserade den första artikeln på den kliniska beskrivningen samt effekten av patogena BCL11B-variationer i kromatinreglering.

Utredarna försöker bättre definiera fenotypen av individer med patogena varianter av BCL11B, för att bättre förstå intellektuell funktion såväl som styrkor och svagheter med intellektuell funktion genom att samla in standardiserade neuropsykologiska bedömningar som redan utförts såsom WPPSI/WISC och WAIS. För detta ändamål kommer utredarna att samla in kliniska och neuropsykologiska data som redan utförts inom ramen för vården.

Utredarna syftar också till att samla de cerebrala MRI-skanningar som redan utförts för att bättre avgränsa de cerebrala anomalierna som observerats hos individer och om sekvensen anpassas kommer utredarna att utföra VBM-studier.

Slutligen kommer utredarna att försöka identifiera en epigenetisk signatur i denna genetiska sjukdom. För detta ändamål kommer utredarna att samla in genomiskt DNA från perifert blod som redan samlats in för genetisk analys och skicka en anonymiserad sats av prover till vår samarbetspartner, Dr. Bekim Sadicovik. Dr. Bekim Sadicovik och hans team kommer att jämföra de epigenetiska markörerna av DNA-metyleringstyp med motsvarande köns- och ålderskontroller. Om specifika prober är onormalt metylerade i BCL11B-individer kommer detta att bestämma en sjukdomsspecifik epigenetisk signatur. Utredarna kommer sedan att kunna föreslå en epigenetisk signatur för individer med okarakteriserade BCL11B-variationer (klass 3, VUS). Denna metod kommer att göra det möjligt att definiera om variationen är ansvarig för sjukdomen eller inte utan att gå igenom funktionsanalyssteg som är svåra att implementera rutinmässigt.

De förväntade fördelarna är en bättre förståelse av BCL11B-sjukdomen, nycklar till neuropsykologisk rehabilitering, en bättre förståelse av mänskliga hjärnfunktioner, möjligheten att föreslå en epigenetisk signatur för personer hos vilka det inte är möjligt att avgöra om en variation i BCL11B-genen är patologisk. eller inte