用于鉴定治疗 PSC-IBD 的宿主和微生物机制以及药物靶点的系统生物学方法 (PSC-Vanc)

原发性硬化性胆管炎 (PSC) 是炎症性肠病 (IBD) 的典型肝胆表现。 虽然很少见，但 PSC 与大量且不成比例的未满足需求相关；与年龄和性别匹配的 IBD 对照组相比，结直肠癌和结肠切除术的风险更高，全因死亡率更高。 不幸的是，没有任何药物疗法被证明可以减缓 PSC-IBD 的疾病进展，而肝移植是唯一可以挽救患者生命的干预措施。 PSC 和 IBD 之间的密切关联导致了几种致病假说，其中提出了失调的粘膜免疫反应。 值得注意的是，这项研究的研究人员最近在 PSC-IBD 中发现了不同的粘膜转录组学特征；关于胆汁酸代谢、胆汁酸信号传导和肠道生态失调的核心作用。 与此同时，来自其他小组的试验数据表明，口服万古霉素（一种不可吸收的肠道特异性抗生素）治疗可减轻结肠炎症并改善 PSC 中胆汁淤积的生化标志物。 然而，没有机制数据探索 PSC-IBD 中万古霉素治疗下宿主微生物的改变，也没有万古霉素对胆汁酸循环的影响。

在这项研究中，将通过大型三级转诊中心招募 15 名 PSC-IBD 患者，这些患者正在按照常规护理标准接受下消化道检查。 参与者将接受为期 4 周的口服万古霉素治疗，并在不同时间点收集粪便样本，以评估宏基因组、宏转录组和胆汁酸谱的变化。 将在基线和第 4 周（可弯曲乙状结肠镜检查）收集结肠活检，并进行 FACS 分选 RNA 测序，以确定结肠上皮细胞通路的变化。 将进行多组学数据整合，以揭示与口服万古霉素反应有关的预测概况、模型微生物网络和宿主转录组学变化的组合。 这项研究将为特定宿主分子和微生物途径的下游鉴定提供信息，这些途径有可能在临床实践中开发 PSC-IBD 的治疗靶点。