Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Multi-Omics og IPSC'er for at forbedre diagnosticering af sjældne intellektuelle handicap (MIDRID)

13. august 2024 opdateret af: University Hospital, Angers

Multi-Omics og IPSC'er for at forbedre diagnosen af ​​sjældne intellektuelle handicap

Baggrund Genetiske faktorer spiller en stor rolle i intellektuelt handicap (ID), men den underliggende årsag er ikke fastlagt i mange tilfælde.

Dette forslag er en fortsættelse af det tidligere interregionale projekt HUGODIMS, hvis formål var at udføre hel exome sekventering (WES) i 69 grundigt udvalgte simplex ID forældre-barn trioer. Takket være HUGODIMS-konsortiet blev den underliggende genetiske årsag til ID bestemt eller stærkt mistænkt i 48 tilfælde (69,5%), og 7 nye ID-gener blev identificeret.

Hypotese Efterforskere antager, at en tilgang, der kombinerer genomik, transkriptomik, metabolomik og morfologiske analyser udført på inducerede pluripotente stamceller (iPSC)-afledte neurale celler ville forbedre diagnosen af ​​ID. Det nuværende forslag er derfor et proof-of-koncept-projekt, der har til formål at vurdere relevansen og effektiviteten af ​​denne multi-omics-tilgang.

Mål og metoder Ti personer med ID rekrutteret gennem HUGODIMS, hvor WES ikke har kunnet identificere patogene varianter, vil blive inkluderet.

Arbejdsgangen er følgende:

  1. Helgenomsekventering (WGS) (Nantes) af disse 10 negative trioer.
  2. Bioinformatiske analyser

  3. I 3 WGS negative tilfælde, 3 positive kontroller med tydelige mutationer i CAMK2a (et nyt ID-gen identificeret takket være HUGODIMS) og 3 sunde negative kontroller:

    1. Afledning af inducerede pluripotente stamceller (iPSC)-afledte neurale progenitorer (iPSC-kernefacilitet i Nantes)
    2. Målrettede og ikke-målrettede metabolomiske analyser udført på iPSC-afledte neuronale celler (Angers)
    3. RNA-sekventering udført på de 9 cellelinjer (Rennes)
    4. Morfologiske analyser af differentierede neuronale cellelinjer afledt af 3 berørte individer og 3 positive kontroller, der bærer CMK2a-mutationer (Tours)
    5. Integration og validering af data fra multi-omics og morfologiske tilgange

Forventede resultater og virkning Efterforskere forventer, at denne tilgang, der kombinerer multi-omics og iPSC, vil bidrage til at forbedre diagnose og forståelse af genetisk ID af ukendt årsag

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Faktiske)

7

Fase

  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Frankrig
      • Angers, Frankrig
        • CHU Angers
      • Bron, Frankrig
        • HCL Lyon
      • Dijon, Frankrig
        • CHU de Bourgogne
      • Nantes, Frankrig
        • CHU Nantes
      • Poitiers, Frankrig
        • CHU Poitiers
      • Rennes, Frankrig
        • CHU Rennes

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

2 år til 25 år (Barn, Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • 3 Whole Genome Sequencing negative tilfælde
  • 3 positive kontroller, der bærer forskellige mutationer i CAMK2a

Ekskluderingskriterier:

  • intet informeret samtykke/afslag

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Diagnostisk
  • Tildeling: N/A
  • Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
  • Maskning: Ingen (Åben etiket)

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
Eksperimentel: Blodprøve
Blodprøve til analyser
Andet: Blodprøve
kombinerer genomik, transkriptomik, metabolomik og morfologiske analyser udført på inducerede pluripotente stamceller (iPSC)-afledte neurale celler

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
At evaluere relevansen og effektiviteten af ​​en multi-omics tilgang til diagnosticering af ID af ukendt genetisk oprindelse.
Tidsramme: Dag 1
Helgenomsekventering: de novo varianter i ikke-kodende regioner af genomet, WGS vil blive udført ved hjælp af HiSeq X Five System 5; Bionformatik analyse af WGS data; neuronale progenitorer afledt af iPSC
Dag 1

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Vurderingen af ​​metabolomiske konsekvenser af CAMK2a-mutationer i humane neuronale progenitorer og differentierede neuronale cellelinjer
Tidsramme: Dag 1
Koblet til højopløsnings massespektrometri ; Transkriptomiske analyser: kvaliteten af ​​RNA'et vil blive evalueret med Bioanalyzer (Agilent) på basis af RIN (RNA-integritetsnummer) samt ved at tage højde for DV200, dvs. procentdelen af ​​RNA-fragmenter med mere end 200 nukleotider. målrettede metabolomiske analyser vil blive udført ved hjælp af en metode baseret på ultrahøjtydende væskekromatografi Flow-injektionsanalyse-tandem massespektrometri til kvantificering af acylcarnitiner, glycerophospholipider, sphingolipider og sukker, hvorimod væskekromatografi
Dag 1
Vurderingen af ​​morfologiske konsekvenser af CAMK2a-mutationer i humane neuronale progenitorer og differentierede neuronale cellelinjer
Tidsramme: Dag 1
immunocytokemi og proteinekspressionstilgange ved hjælp af konfokal mikroskopi og Western blotting med antistoffer, der er specifikke for proteiner udtrykt i neuroner (MAP2, Tubulin beta 3, PSD95, SNAP25), astrocytter (GFAP) eller oligodendrocytter (Gal-C)
Dag 1

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

University Hospital, Angers

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

9. januar 2019

Primær færdiggørelse (Faktiske)

11. februar 2020

Studieafslutning (Faktiske)

11. februar 2020

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

10. august 2018

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

14. august 2018

Først opslået (Faktiske)

17. august 2018

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

14. august 2024

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

13. august 2024

Sidst verificeret

1. august 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 49RC17_0224

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sjældne intellektuelle handicap

Kliniske forsøg med Blodprøve

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Canada

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner