Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Multi-Omics a IPSC pro zlepšení diagnostiky vzácných mentálních postižení (MIDRID)

13. srpna 2024 aktualizováno: University Hospital, Angers

Pozadí Genetické faktory hrají hlavní roli u mentálního postižení (ID), ale základní příčina není v mnoha případech určena.

Tento návrh navazuje na předchozí meziregionální projekt HUGODIMS, jehož cílem bylo provést sekvenování celého exomu (WES) v 69 důkladně vybraných simplexních ID rodič-dítě. Díky konsorciu HUGODIMS byla základní genetická příčina ID stanovena nebo vysoce suspektní ve 48 případech (69,5 %) a bylo identifikováno 7 nových ID genů.

Hypotéza Vyšetřovatelé předpokládají, že přístup kombinující genomiku, transkriptomiku, metabolomiku a morfologické analýzy prováděné na nervových buňkách odvozených z indukovaných pluripotentních kmenových buněk (iPSC) by zlepšil diagnostiku ID. Současný návrh je proto projektem pro ověření konceptu, jehož cílem je posoudit relevanci a účinnost tohoto multi-omického přístupu.

Cíle a metody Bude zahrnuto deset jedinců s ID rekrutovaných prostřednictvím HUGODIMS, u kterých se WES nepodařilo identifikovat patogenní varianty.

Pracovní postup je následující:

  1. Sekvenování celého genomu (WGS) (Nantes) těchto 10 negativních trií.
  2. Bioinformatické analýzy

  3. Ve 3 negativních případech WGS 3 pozitivní kontroly nesoucí odlišné mutace v CAMK2a (nový ID gen identifikovaný díky HUGODIMS) a 3 zdravé negativní kontroly:

    1. Odvození neurálních progenitorů odvozených z indukovaných pluripotentních kmenových buněk (iPSC) (základní zařízení iPSC v Nantes)
    2. Cílené a necílené metabolomické analýzy prováděné na neuronových buňkách odvozených od iPSC (Angers)
    3. Sekvenování RNA prováděné na 9 buněčných liniích (Rennes)
    4. Morfologické analýzy diferencovaných neuronových buněčných linií odvozených od 3 postižených jedinců a 3 pozitivních kontrol nesoucích mutace CMK2a (Tours)
    5. Integrace a validace dat z multiomických a morfologických přístupů

Očekávané výsledky a dopad Výzkumníci očekávají, že tento přístup kombinující multi-omics a iPSC pomůže zlepšit diagnostiku a pochopení genetického ID neznámé příčiny

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Podmínky

Intervence / Léčba

Typ studie

Intervenční

Zápis (Aktuální)

7

Fáze

  • Nelze použít

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

  • Francie
      • Angers, Francie
        • CHU Angers
      • Bron, Francie
        • HCL Lyon
      • Dijon, Francie
        • CHU de Bourgogne
      • Nantes, Francie
        • CHU Nantes
      • Poitiers, Francie
        • CHU Poitiers
      • Rennes, Francie
        • CHU Rennes

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

2 roky až 25 let (Dítě, Dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Popis

Kritéria zahrnutí:

  • 3 Negativní případy sekvenování celého genomu
  • 3 pozitivní kontroly nesoucí odlišné mutace v CAMK2a

Kritéria vyloučení:

  • žádný informovaný souhlas/odmítnutí

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: Diagnostický
  • Přidělení: N/A
  • Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
  • Maskování: Žádné (otevřený štítek)

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
Experimentální: Vzorek krve
Vzorek krve pro analýzy
Jiný: Vzorek krve
kombinující genomiku, transkriptomiku, metabolomiku a morfologické analýzy prováděné na neurálních buňkách odvozených z pluripotentních kmenových buněk (iPSC)

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Vyhodnotit relevanci a účinnost multiomického přístupu k diagnostice ID neznámého genetického původu.
Časové okno: 1. den
Sekvenování celého genomu: de novo varianty v nekódujících oblastech genomu, WGS bude prováděno pomocí HiSeq X Five System 5; Bionformatická analýza dat WGS; neuronální progenitory odvozené z iPSC
1. den

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Hodnocení metabolomických důsledků mutací CAMK2a v lidských neuronových progenitorech a diferencovaných neuronových buněčných liniích
Časové okno: 1. den
Ve spojení s hmotnostní spektrometrií s vysokým rozlišením; Transkriptomické analýzy: kvalita RNA bude hodnocena pomocí Bioanalyzeru (Agilent) na základě RIN (číslo integrity RNA) a také se zohledněním DV200, tj. procenta fragmentů RNA s více než 200 nukleotidy Non- cílené metabolomické analýzy budou prováděny metodou založenou na ultra-výkonné kapalinové chromatografii Průtoková injekční analýza-tandemová hmotnostní spektrometrie pro kvantifikaci acylkarnitinů, glycerofosfolipidů, sfingolipidů a cukru, zatímco kapalinová chromatografie
1. den
Hodnocení morfologických důsledků mutací CAMK2a v lidských neuronových progenitorech a diferencovaných neuronových buněčných liniích
Časové okno: 1. den
imunocytochemie a přístupy k expresi proteinů pomocí konfokální mikroskopie a Western blottingu s protilátkami specifickými pro proteiny exprimované v neuronech (MAP2, Tubulin beta 3, PSD95, SNAP25), astrocytech (GFAP) nebo oligodendrocytech (Gal-C)
1. den

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

University Hospital, Angers

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

9. ledna 2019

Primární dokončení (Aktuální)

11. února 2020

Dokončení studie (Aktuální)

11. února 2020

Termíny zápisu do studia

První předloženo

10. srpna 2018

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

14. srpna 2018

První zveřejněno (Aktuální)

17. srpna 2018

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

14. srpna 2024

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

13. srpna 2024

Naposledy ověřeno

1. srpna 2024

Více informací

Termíny související s touto studií

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 49RC17_0224

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Vzácné mentální postižení

Klinické studie na Vzorek krve

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Lithuania

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit