Das Biorepository für Scripps Health (BIF)

Biorepository-Proben werden in einer Vielzahl von Forschungsstudien verwendet, die bei der Diagnose und/oder Behandlung von Patienten helfen sollen, einschließlich der möglichen Identifizierung therapeutischer Ziele oder genetischer Identifikatoren von Krebs und möglicherweise anderen Krankheiten. Im Verlauf der verschiedenen Studien können verschiedene Technologien eingesetzt werden, darunter Genexpression, Genotypisierung, DNA- und RNA-Sequenzierung sowie Protein- und Metabolitenanalyse. Ein beispielhaftes Projekt, das derzeit in Betracht gezogen wird, ist eines, bei dem Scripps Genomic Medicine die DNA-Sequenz der Tumoren beider Patienten vergleicht und ihrer Keimbahn-DNA, um genetische Unterschiede zwischen den beiden zu identifizieren. Diese Unterschiede könnten dazu beitragen, spezifische Wege zu identifizieren, die den Tumor und die Krankheit regulieren, und so möglicherweise wertvolle Informationen für die Behandlung dieses einzelnen Patienten sowie anderer Patienten mit ähnlichen genetischen Merkmalen liefern. Darüber hinaus könnten Unterschiede zwischen Tumor und Keimbahn, die bei mehreren Patienten beobachtet wurden, dabei helfen, therapeutische Ziele zu identifizieren, die krebsspezifisch sind. Ein zweites beispielhaftes Projekt, das derzeit läuft, ist eines, bei dem Scripps Genomic Medicine eine RNA-Sequenzierung durchführt, um „Fusionsgene“ zu identifizieren, bei denen es sich um Hybridgene handelt, die aus zwei zuvor getrennten Genen gebildet wurden und eine Art genetische Mutation darstellen, die bei bestimmten Arten von Genen identifiziert wurde Krebsarten, einschließlich Prostata- und Brustkrebs, und bestimmte Formen von Leukämie. Die Identifizierung neuer Fusionsgene könnte wertvolle Erkenntnisse sowohl für Behandlungsprotokolle als auch für neue therapeutische Ziele liefern.

Ziel dieses Projekts ist die Erweiterung und Verbesserung des bereits innerhalb der Scripps Genomic Medicine (SGM)-Gruppe etablierten Bio-Repositoriums. Derzeit konzentriert sich die Sammlung auf die Sammlung vorwiegend von Prostatatumoren und Blut als entsprechendem Normalgewebe. Die aktuelle Sammlung ist mit pathologischen Informationen und begrenzten medizinischen Informationen versehen, die vom Patienten während des Einwilligungsprozesses gesammelt wurden. Es werden keine postoperativen Informationen gesammelt. Wir glauben, dass die Sammlung verbessert werden kann, indem (i) der Tumorsammlungsprozess geändert wird, (ii) die Mittel zur Einwilligung der Patienten vereinfacht werden, sodass sie auf der allgemeinen chirurgischen Einwilligung beruht, und (iii) nicht identifizierte medizinische Daten verwendet werden, die bereits in der Studie konsolidiert sind Krebsregister als Mittel zur Annotation der Gewebeproben.