Scripps Healthin biovarasto (BIF)

Biovarastonäytteitä hyödynnetään erilaisissa tutkimuksissa, joiden tarkoituksena on auttaa potilaiden diagnosoinnissa ja/tai hoidossa, mukaan lukien syöpien ja mahdollisesti muiden sairauksien mahdollisten terapeuttisten kohteiden tai geneettisten tunnisteiden tunnistaminen. Erilaisten tutkimusten aikana voidaan käyttää erilaisia ​​teknologioita, kuten geenien ilmentymistä, genotyypitystä, DNA- ja RNA-sekvensointia, proteiini- ja metaboliittianalyysiä. Esimerkkinä parhaillaan harkittavana on hanke, jossa Scripps Genomic Medicine vertaa molempien potilaan kasvainten DNA-sekvenssiä. ja niiden ituradan DNA:ta tunnistamaan näiden kahden väliset geneettiset erot. Nämä erot voivat auttaa tunnistamaan tiettyjä reittejä, jotka säätelevät kasvainta ja sairautta, mikä johtaa mahdollisesti arvokkaaseen tietoon kyseisen yksittäisen potilaan sekä muiden potilaiden, joilla on samanlaiset geneettiset ominaisuudet, hoitoon. Lisäksi useilla potilailla havaitut erot kasvaimen ja ituradan välillä voivat auttaa tunnistamaan syöpäspesifisiä terapeuttisia kohteita. Toissijainen esimerkkiprojekti, joka on parhaillaan käynnissä, on hanke, jossa Scripps Genomic Medicine suorittaa RNA-sekvensoinnin tunnistaakseen "fuusiogeenejä", jotka ovat hybridigeenejä, jotka on muodostettu kahdesta aiemmin erillisestä geenistä ja jotka ovat eräänlainen geneettinen mutaatio, joka on tunnistettu tietyntyyppisissä syövät, mukaan lukien eturauhas- ja rintasyöpä, sekä tietyt leukemian muodot. Uusien fuusiogeenien tunnistaminen voisi tarjota arvokkaita näkemyksiä sekä hoitomenetelmistä että uusista terapeuttisista kohteista.

Tämän hankkeen tavoitteena on laajentaa ja parantaa Scripps Genomic Medicine (SGM) -ryhmässä jo perustettua biovarastoa. Tällä hetkellä kokoelma on keskittynyt pääasiassa eturauhaskasvaimien ja veren keräämiseen vastaavana normaalikudoksena. Nykyinen kokoelma on merkitty patologisilla tiedoilla ja rajoitetulla lääketieteellisellä tiedolla, joka on kerätty potilaalta suostumusprosessin aikana; leikkauksen jälkeisiä tietoja ei kerätä. Uskomme, että keräämistä voidaan tehostaa (i) muuttamalla kasvainten keruuprosessia, (ii) yksinkertaistamalla potilaiden suostumuksen antamistapoja siten, että se perustuu yleiseen kirurgiseen suostumukseen ja (iii) käyttämällä tunnistamattomia lääketieteellisiä tietoja, jotka on jo konsolidoitu Syöpärekisteri keinona merkitä kudosnäytteitä.