Abbott RealTime hepatiitti C -viruksen (HCV) genotyyppi II -testin kliininen suorituskyky

Hepatiitti C -virus (HCV) -infektio, kirroosin, hepatosellulaarisen karsinooman (HCC) ja maksansiirron johtava aiheuttaja, vaikuttaa noin 170 miljoonaan yksilöön maailmanlaajuisesti. Siksi HCV-tartunnan ehkäisy ja HCV-infektion varhainen puuttuminen ovat kiireellisiä, jotta voidaan vähentää tai pysäyttää maksaan liittyvää sairastuvuutta ja kuolleisuutta. Peginterferonin ja ribaviriinihoidon yhdistelmästä on tullut krooninen hepatiitti C (CHC) -potilaiden nykyinen hoitostandardi, ja kokonaiskestoinen virologinen vaste (SVR) on 54-63 % ja suotuisampi vasteaste potilailla, joilla on genotyypin 2/3 infektio. kuin ne, joilla on genotyyppi 1/4 infektio. Siksi tarkka HCV-genotyypin arviointi ennen hoitoa on ensiarvoisen tärkeää yksilöllisen hoidon helpottamiseksi HCV:n vasteen ohjaavan hoidon ja spesifisesti kohdistetun antiviraalisen hoidon aikakaudella (STAT-C).

Tällä hetkellä suoraa HCV:n geneettistä sekvensointia sekä 5'-kääntämättömälle terminaalialueelle (5'UTR) että ei-rakenteelliselle 5B-alueelle (NS5B) ja sitä seuraavaa fylogeneettistä puuanalyysiä pidetään kultaisena standardina HCV:n genotyypin ja alatyypin määrittämisessä. Se on kuitenkin aikaa vievää ja vaatii erityisiä laboratorioasetuksia. Useita kaupallisesti saatavilla olevia käänteishybridisaatioita tyyppispesifisellä koetinmäärityksellä (Inno-LiPA II) tai yksinkertaistettua 5'UTR-alueen suoraa sekvensointia käytettiin korvaamaan kahden alueen sekvensointimenetelmä (Trugene HCV 5' NC -genotyypityspakkaus). Siitä huolimatta tiedot yleisestä diagnostisesta tarkkuudesta vaihtelivat.

Abbott RealTime HCV Genotype II on in vitro -käänteistranskriptiopolymeraasiketjureaktio (RT-PCR) -määritys, jolla määritetään HCV:n genotyyppi(t) plasmassa ja HCV-tartunnan saaneiden henkilöiden seerumissa. Geneettisen samankaltaisuuden perusteella HCV on luokiteltu kuuteen päägenotyyppiin (1-6) ja lukuisiin alatyyppeihin. HCV-genotyyppi ennustaa HCV-infektoituneiden potilaiden vastetta peginterferonin ja ribaviriinin yhdistelmähoitoon. Abbott RealTime HCV Genotype II -määritys käyttää Abbott m2000sp -laitetta näytteiden käsittelyyn ja Abbott m2000rt -laitetta monistamiseen ja havaitsemiseen. Lisäksi Abbott m2000sp tarjoaa automaattisen näytteensiirron ja määritysreagenssien reaktiokokoonpanon Abbott 96-kuoppaisella optisella reaktiolevyllä.

Tutkijat pyrkivät arvioimaan tällä hetkellä saatavilla olevien kaupallisten HCV-genotyyppipakkausten (Abbott RealTime HCV Genotype II) yleistä diagnostista tarkkuutta käyttämällä kultastandardina 5'UTR- ja NS5A-geenin monistusta ja suoraa sekvensointia.