Rett-oireyhtymän ja siihen liittyvien sairauksien biopankki

Tällä hetkellä tehokkaita hoitoja RTT-, MECP2 Dup- tai Rett-sairauksiin puuttuu. Tutkijat ovat edistyneet merkittävästi RTT:ssä viimeisen yhdentoista vuoden aikana, joten tämä tutkimus edustaa keskittymistä MECP2-geenin mutaatioihin tai päällekkäisyyksiin ja siihen liittyviin sairauksiin, mukaan lukien ne, joilla on fenotyyppinen päällekkäisyys. RTT:n ymmärtäminen on edennyt huomattavan hyvin Rett Syndrome Natural History Clinical Protocol (NHS) -protokollan kautta ja vastaavasti eteneminen perustieteen alalla on edennyt vastaavalla menestyksellä. Näin ollen kliinisen ja perustieteen edistyminen on johtanut kliinisten tutkimusten ja muiden translaatiotutkimusten perustamiseen, jotka lupaavat uusia kliinisiä tutkimuksia tulevaisuudessa. Prosessin aikana tutkijat tulivat kuitenkin tietoisiksi muista MECP2:een ja RTT:hen liittyvistä häiriöistä, jotka eivät olleet tiedossa alkuperäisen ehdotuksen syntyhetkellä, ja he olivat edelleen vaikuttuneita RTT:tä sairastavien henkilöiden merkittävästä kliinisestä vaihtelusta, jota ei voida selittää mutaatioiden eroilla. yksin. Itse asiassa vaihtelu yksilöiden välillä, joilla on identtiset mutaatiot, on saanut tutkijat etsimään lisäselityksiä. Ensimmäisen hakemuksen yhteydessä (2002), vain kolme vuotta sen jälkeen, kun geeni, MECP2, tunnistettiin molekyylilinkiksi RTT:hen, tutkijat eivät olleet tietoisia MECP2-mutaatioihin tai niihin liittyviin, mutta varsin hyvin liittyviin kliinisten häiriöiden vaihteluista. erilainen MECP2 Dup. Jokaiselle häiriölle on tunnusomaista merkittävät hermoston kehityksen piirteet, jotka liittyvät joko MECP2-geenin muutoksiin tai fenotyyppeihin, jotka muistuttavat läheisesti RTT-potilailla havaittuja. Lisäksi CDKL5:n ja FOXG1:n mutaatioista johtuva fenotyyppinen päällekkäisyys RTT:n kanssa oli myös tutkimatta. Tutkijat ehdottavat, että tässä uudessa tutkimuksessa hyödynnetään sekä klassisen että muunnelman RTT:n ymmärtämisessä saavutettua huomattavaa edistystä ja lisätään tähän liittyvät sairaudet, MECP2 Dup ja Rett:hen liittyvät sairaudet, mukaan lukien CDKL5, FOXG1 ja henkilöt, joilla on MECP2-mutaatioita, joilla ei ole RTT. Luonnonhistoriakomponentin kautta suoritettavan pitkittäisen kliinisen arvioinnin yhteydessä tutkijat keräävät järjestelmällisesti kaikkien halukkaiden osallistujien veren ja eristävät plasman, DNA:n ja RNA:n. Kaikkia Natural History Study -tutkimukseen osallistujia pyydetään antamaan näytteitä ensimmäisellä vierailulla, kun taas näytteitä kerätään toistuvasti osasta osallistujia, jotta voidaan etsiä muutoksia ajan myötä. Jotta sairastuneiden ja sairastumattomien yksilöiden erottavat tekijät voitaisiin tunnistaa, sekä potentiaalia luonnehtia geenimuutosten periytyvyyttä ja mahdollisia seurauksia perheissä, otetaan näytteitä sairastumattomilta perheenjäseniltä. Lisäksi yksilöiden alajoukosta, joka on valittu ainutlaatuisten kliinisten ominaisuuksien vuoksi, kerätään ihobiopsiat ja/tai karvatupet solulinjojen muodostamiseksi. Tutkijat pyytävät kaikkia näytteitä toimittavia henkilöitä suostumaan mahdolliseen tulevaan koko genomin sekvensointiin, jotta he voivat arvioida näiden sairauksien geneettisiä muuntajia.

Nämä materiaalit säilytetään keskusvarastossa (Greenwood Genetics Laboratory). Näiden näytteiden päätarkoituksena on toimia kestävinä materiaaleina tulevia analyysejä varten, mutta kaikille näytteille tehdään joukko määriteltyjä analyysejä. Rett-oireyhtymän kohortista kerätyille näytteille tutkijat suorittavat X-kromosomin inaktivaatiotutkimuksia ja arvioivat yleisiä polymorfismeja aivoperäisessä neurotrofisessa tekijässä (BDNF) ja määrittävät näiden tunnettujen tekijöiden vaikutuksen taudin vakavuuteen. MECP2 Dup -kohorttitutkijat karakterisoivat plasman tulehdusmarkkereita ja korreloivat ne kliinisten ominaisuuksien kanssa. Myös MECP2 Dup -kohorttitutkijat suorittavat yksityiskohtaisen genomisen raja-arvon ja geenisisältöanalyysin ja korreloivat tämän taudin vaikeusasteen kanssa. Samanlainen genomisen raja-arvojen ja geenisisällön analyysi suoritetaan ihmisille, joilla on FOXG1-kopioiminen. Lopuksi pilottitutkimuksessa tutkijat tekevät aineenvaihdunnan profiloinnin kaikista sairauksista kärsiville ihmisille ja arvioivat aineenvaihdunnan piirteitä, jotka korreloivat sairauden vaikeusasteen kanssa, ja metabolisia ominaisuuksia, jotka ovat yhteisiä tai ainutlaatuisia näiden häiriöiden välillä. Tämä työ tarjoaa kestävän resurssin tulevaa analysointia varten, laajentaa genotyyppi/fenotyyppi-korrelaatioiden ymmärtämistä, tunnistaa muita taudin vaikeuteen vaikuttavia biologisia tekijöitä sekä tarjoaa puitteet sairauden tilan ja vaikeusasteen biomarkkerien kehittämiselle.