MTB cfDNA -tasot TBP:ssä

Tuberkuloosi (TB) on yksi suurimmista maailmanlaajuisista terveysuhkista, jonka maailmanlaajuisen ilmaantuvuuden arvioidaan olevan 9,87 miljoonaa vuonna 2020, ja se on toiseksi yleisin tartuntatautien aiheuttama kuolinsyy COVID-19:n jälkeen. Lukuun ottamatta keuhkovaurioita, joka on tuberkuloosin yleisin ilmentymä, ekstrapulmonaalinen tuberkuloosi (EPTB) vaikutti 22,3 %:iin Hongkongin tuberkuloosipotilaista, ja siihen liittyi huonompi hoitotulos kuin keuhkotuberkuloosi. EPTB:stä TB-keuhkopussin tulehdus (TBP) on yleisin muoto, jonka osuus on 41,2 % Hongkongissa ja noin 50 % kahdessa monikeskustutkimuksessa.

Muiden EPTB-tyyppien tapaan TBP:n mikrobiologinen diagnoosi on usein vaikeaa johtuen infektoituneiden elinten pausibasillaarisesta osallisuudesta (pienen bakteerimäärän aiheuttama TB-sairaus). Siksi merkittävä osa potilaista sai empiiristä anti-TB-hoitoa, joka perustui yhteensopiviin kliinisiin esityksiin (eksudatiivinen keuhkopussin effuusio ja kohonnut adenosiinideaminaasitaso keuhkopussin nesteessä), diagnostisten tutkimusten tulosten ja vaihtoehtoisten kliinisten selitysten puuttuessa. Perinteiset diagnostiset TBP:n diagnostiset testit haponkestävän basillivärin (AFB) ja keuhkopussin nesteen viljelmän avulla eivät ole riittävän herkkiä, ja viljelyn pitkä läpimenoaika viivästyttäisi alkuperäistä kliinistä hoitoa. Vaikka positiivista histologista granulomatoottisen tulehduksen löydöstä keuhkopussin biopsiasta pidetään diagnostisena vastineena TBP:lle, keuhkopussin biopsian, erityisesti verenvuodon ja sisäelinten vaurion, menettelytapariski on edelleen huolenaihe [9]. Hongkongin ekstrapulmonaalisen tuberkuloosin historiallisesta kohortista vain 10,6 % ja 39,7 % TBP:stä diagnosoitiin viljelmän ja histologian perusteella. Samoin molekyylitestien tehokkuus EPTB:ssä on myös rajallinen, oletettavasti alhaisen bakteerikuorman ja MTB DNA-tason vuoksi. Systemaattisessa katsauksessa Xpert® MTB/RIF:n (Xpert; Cepheid; Sunnyvale, CA, USA) yhdistetty herkkyys ja spesifisyys MTB DNA:n havaitsemiseen keuhkopussin nesteessä viljelmää vastaan ​​oli 50,9 % ja 99,2 % TBP:ssä. Alhaisen herkkyyden vuoksi negatiivinen Xpert-tulos ei ole luotettava TBP:n poissulkemiseen. Xpertin uusin versio, Xpert® MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra), kehitettiin parantamaan tuberkuloosidiagnoosin herkkyyttä ja tehostamaan rifampisiiniresistenssin tunnistamista. Sen diagnostinen käyttökelpoisuus TBP:ssä on kuitenkin edelleen epäoptimaalinen. Mekkaoui ym. raportoivat, että Xpert Ultran herkkyys ja spesifisyys pleuranesteessä olivat 66,7 % ja 99,5 %. Toisessa tutkimuksessa, jossa Christopher ym. vertaili Xpert Ultran ja Xpertin diagnostista suorituskykyä EPTB:llä, Xpert Ultralla oli suurempi herkkyys kuin Xpertillä (53,8 % vs 46,2 %) pleuranesteelle MTB-viljelmää ja yhdistelmävertailustandardia vastaan, mutta se ei saavuttanut tilastollinen merkitsevyys.

Nestemäisen biopsian muotona keuhkopussin nesteessä oleva MTB-soluton DNA (MTB cfDNA) voi edustaa nopeaa, uutta ja käyttökelpoista vaihtoehtoa TBP:n diagnosoimiseksi. Tämän uuden työkalun avulla potilaiden ei ehkä tarvitse tehdä keuhkopussin biopsiaa TBP-diagnoosin määrittämiseksi. Yang ym. raportoivat, että MTB cfDNA:n ja Xpertin herkkyys oli 79,5 % ja Xpert 38,5 % käyttämällä ennalta määritettyä yhdistettyä vertailustandardia (sisältäen yskösviljelmän, ysköksen Xpertin, keuhkopussin effuusioviljelmän, keuhkopussin effuusio Xpert tai keuhkopussin biopsian tulokset), kun taas herkkyys kasvaisi 96,6 %:iin ja 79,7 %:iin keuhkopussin nesteen Xpert- ja/tai viljelypositiivisissa TBP-näytteissä. Syy MTB cfDNA:n erilaisiin herkkyyksiin diagnosoitaessa TBP:tä yhdistelmäpäätepisteiden ja mikrobiologisten menetelmien perusteella oli epäselvä, vaikka se saattaa johtua erilaisesta MTB-bakteerikuormasta, joka heijastuu keuhkopussin nesteen viljelmän tilasta. Tästä huolimatta tämä suotuisa tulos voidaan kääntää yli 60 % tarpeettomien invasiivisten keuhkopussin biopsioiden välttämiseksi, jos MTB cfDNA:ta pidetään kultaisena standardina TBP:n diagnosoinnissa.

Ennen kuin MTB cfDNA:n mittaus otetaan käyttöön TBP:n diagnosoinnissa, MTB cfDNA -tason ja MTB-viljelmäpositiivisen TBP:n, MTB-viljelmänegatiivisen TBP:n ja erityyppisten ei-TBP-keuhkopussin effuusion välinen korrelaatio on arvioitava perusteellisesti. Oletamme, että MTB cfDNA päihittää MTB-kulttuurin TBP:n diagnosoinnissa; joilla on korkea yhteensopivuus MTB cfDNA -tason ja TBP-diagnoosin välillä, korkealla, keskitasolla ja matalalla MTB-cfDNA-tasolla MTB-viljelmäpositiivisessa TBP:ssä, MTB-viljelmänegatiivisessa TBP:ssä ja ei-TB-keuhkopussin effuusiossa. Tällainen yhteensopivuus on kriittinen askel sen diagnostisen tarkkuuden validoimiseksi ennen kliiniseen käyttöön ottamista.

On olemassa tietoja, jotka viittaavat suoliston mikrobiotan ja tuberkuloosialttiuden väliseen vuorovaikutukseen. Suoliston mikrobiotan ja TBP:n välistä yhteyttä ei kuitenkaan ole tutkittu

Tämän tutkimuksen tavoitteena on korreloida MTB cfDNA -tasoja keuhkopussin effuusion eri syihin ja arvioida eri testien diagnostista suorituskykyä TBP:n diagnosoinnissa.