Définir le rôle du microbiome cutané dans les événements indésirables liés au système immunitaire (SKINBIOTA)

Le mélanome est le cancer de la peau le plus dangereux, responsable du plus grand nombre de décès par cancer de la peau. Le pronostic du mélanome métastatique s'est considérablement amélioré ces dernières années grâce aux progrès de l'immunothérapie. Le développement de molécules bloquant certains « checkpoints » immunologiques (points de contrôle exercés par le CTLA-4 (Cytotoxic T lymphocytes Associated protein 4) et PD-1 (Programmed cell Death protein 1) a permis d'obtenir une amélioration significative de la survie globale (OS) des patients traités pour un mélanome métastatique. L'ipilimumab, un anticorps bloquant CTLA-4, est la première immunothérapie commercialisée, démontrant pour la première fois une réponse thérapeutique, cependant chez un petit nombre de patients (10 à 15%) et avec une toxicité importante (25% de grade 3-4) . Par la suite, une seconde génération d'inhibiteurs de points de contrôle plus efficaces (30 à 40% de bonne réponse) et moins toxiques, les anticorps anti-PD-1 (pembrolizumab et nivolumab), ont rapidement obtenu une AMM dans le traitement de première ligne du traitement du mélanome métastatique et récemment en situation adjuvante après curage ganglionnaire afin de limiter le risque de récidive. Cependant, malgré ces avancées, un certain nombre de patients ne répondent pas au traitement et il reste difficile de prédire cette réponse thérapeutique. De plus, les patients traités par ICI présentent souvent des effets indésirables cutanés d'origine immunitaire se manifestant par des éruptions cutanées, des dermatites, des nécrolyses épidermiques et, dans certains cas, par des dépigmentations cutanées de type vitiligo, témoignant du développement d'une immunogénicité spécifique vis-à-vis des mélanocytes, cellules provoquant mélanome, et responsable d'une décoloration de la peau. Plusieurs études ont rapporté qu'une modification de certaines bactéries du microbiote digestif était prédictive de la réponse antitumorale à l'immunothérapie, tandis que d'autres étaient prédictives de l'apparition de toxicités auto-immunes importantes liées aux ICI (colite). Plusieurs études de phase 1 ont évalué l'impact de la prise de probiotiques ou de greffes fécales sur la réponse tumorale de patients recevant une immunothérapie contre le cancer (NCT 03819296 ; NCT03817125 ; NCT03643289). Ainsi par ces nouveaux concepts, il serait intéressant d'évaluer la composition du microbiote cutané chez des patients traités par immunothérapie anti-PD-1 pour la prise en charge d'un mélanome métastatique et développant au cours de leur suivi un vitiligo ; effet secondaire prédictif de l'amélioration de la survie. Ces données seront comparées à celles obtenues chez des patients atteints de vitiligo commun. Cela sera examiné sur des écouvillons cutanés de patients prélevés sur des sites lésionnels et non lésionnels. Fonctionnellement, nous caractériserons les voies microbiennes à l'aide du séquençage shotgun des génomes microbiens et de la méta-transcriptomique (séquençage ARN des communautés microbiennes de la peau).