Performances de DendrisCHIP®OA dans les infections osseuses et articulaires (DENDRIS)

Les infections osseuses et articulaires (ICB) avec et sans matériel prothétique (genou, hanche et épaule) sont complexes à diagnostiquer et à traiter, justifiant la création de centres experts par le ministère de la Santé (CRIOAc).

En cas d'BJI avec matériel, le diagnostic repose sur un ensemble de critères cliniques, bactériologiques, cytologiques et radiologiques connus sous le nom de critères EBJIS 2021 (European Bone & Joint Infections Society). Pour l'arthrite septique, le diagnostic repose sur la bactériologie et la cytologie.

Actuellement, un patient avec suspicion d'BJI reste hospitalisé pendant au moins 5 jours avec des antibiotiques parentéraux, jusqu'aux résultats de la culture bactériologique. Si le diagnostic bactériologique est négatif et la suspicion clinique d'infection faible, le traitement est arrêté au moins 7 jours après l'intervention. Si le diagnostic microbiologique est positif, le choix du thérapeutique dépendra de l’espèce bactérienne isolée. La microbiologie reste donc essentielle, et le délai d'obtention des résultats microbiologiques est crucial pour adapter le traitement antibiotique.

Les techniques de culture microbiologique restent la référence, mais sont chronophages (3 à 14 jours), et nécessitent un personnel qualifié, avec un risque de résultats faussement négatifs dans 5 à 10 % des cas (antibiothérapie préalable, microorganismes atypiques ou fastidieux). Ces limites diagnostiques entraînent des difficultés de prise en charge, avec des conséquences majeures en termes de morbidité, de qualité de vie et de coûts de traitement.

Les méthodes moléculaires syndromiques (métagénomique, Cartouches Unyvero, Nested-PCR Biofire®), qui pourraient améliorer le diagnostic microbiologique, sont actuellement en cours d'évaluation, mais présentent un certain nombre d'inconvénients qui font de ces tests des méthodes complémentaires dans les laboratoires spécialisés (coût, productivité, panels insuffisants). , etc.).

La plateforme DendrisCHIP®OA a démontré sa capacité à proposer une identification moléculaire en routine des micro-organismes actuels impliqués dans le BJI, en moins de 5 heures, avec la détection de gènes de résistance mecA sur des séries de 16 à 64 échantillons. Le DendrisCHIP®OA est marqué CE et a déjà fait l'objet d'une première publication évaluant ses performances dans un centre unique.

D'autre part, l'innovation apportée par cette technologie est l'analyse par intelligence artificielle grâce au logiciel DendriSOFT, qui prend en compte la variabilité biologique. Cette base de données est constamment enrichie par l'auto-apprentissage.

La recherche sera réalisée sur une période de 6 mois pour inclure 100 patients dans cinq centres d'inclusion (CRIOAc) en Ile de France, avec un minimum de 2 patients traités pour BJI par semaine et par centre d'inclusion.

L'objectif principal de cette étude est d'évaluer les performances diagnostiques du DendrisCHIP®OA dans la détection des pathogènes reconnus dans son panel et la détection du gène mecA par rapport aux techniques microbiologiques de routine utilisées dans les centres d'inclusion participant à l'étude.

Les objectifs secondaires sont :

• documenter les écarts à l’aide de techniques alternatives (PCR spécifique, séquençage)
• comparer les délais (du prélèvement à la validation biologique) entre la technique microbiologique de routine et DendrisCHIP®OA
• évaluer l'impact sur la prise en charge thérapeutique du patient (modification du traitement antibiotique)
• pour évaluer les performances diagnostiques du DendrisCHIP®OA sur un sous-groupe de patients à culture négative présentant des signes cliniques d'infection.