Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Akut fertőző betegségek precíziós diagnosztikája; Neurogyulladásos kohorsz (PDAID)

2021. május 7. frissítette: University of California, San Francisco

A metagenomikus újgenerációs szekvenálás klinikai megvalósítása az akut fertőző betegségek precíziós diagnosztizálására; Neurogyulladásos kohorsz

Ennek a tanulmánynak az a célja, hogy klinikailag validált metagenomikus következő generációs szekvenálási (mNGS) vizsgálatot alkalmazzanak a kórházi betegek akut fertőző betegségeinek diagnosztizálására szolgáló precíziós gyógyászat bemutatására. 2016 júniusa és 2017 júniusa között 200 pácienst vesznek fel több kaliforniai és Kalifornián kívüli kórházból. A betegeket értékelni fogják, hogy meghatározzák az mNGS vizsgálatnak a diagnosztikai eredményre, a kórházi költségekre és a klinikai eredményekre gyakorolt ​​hatását.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Befejezve

Részletes leírás

Ennek a tanulmánynak az a célja, hogy klinikailag validált metagenomikus következő generációs szekvenálási (mNGS) vizsgálatot alkalmazzon a precíziós gyógyszer bemutatására a kórházi betegek akut fertőző betegségeinek diagnosztizálására, azzal a céllal, hogy közvetlenül befolyásolja a klinikai ellátást és javítsa a betegek mortalitását. Ezt a diagnosztikai tesztet korábban a Clinical Laboratory Improvement Módosítások (CLIA) által tanúsított laboratóriumban, a Kaliforniai Egyetem San Francisco Klinikai Mikrobiológiai Laboratóriumában validálták. 2016 júniusa és 2017 júniusa között a nyomozók 200 beteget vesznek fel több kaliforniai kórházból (Kaliforniai Egyetem, San Francisco; University of California, Los Angeles; University of California, Davis; Children's Hospital Los Angeles) és Kalifornián kívül (Children's National). Medical Center, Children's Hospital Colorado, St. Jude Children's Research Hospital) mNGS-tesztelés céljából, és értékelje a vizsgálatra gyakorolt ​​hatást a diagnosztikai eredményre, a kórházi költségekre és a klinikai eredményekre.

Tanulmány típusa

Beavatkozó

Beiratkozás (Tényleges)

214

Fázis

  • Nem alkalmazható

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi helyek

    • California
      • Davis, California, Egyesült Államok, 95616
        • University of California, Davis Medical Center
      • Los Angeles, California, Egyesült Államok, 90027
        • Children's Hospital Los Angeles
      • Los Angeles, California, Egyesült Államok, 90095
        • University Of California, Los Angeles Medical Center
      • San Francisco, California, Egyesült Államok, 94116
        • University of California, San Francisco Medical Center
    • Colorado
      • Denver, Colorado, Egyesült Államok, 80045
        • Children's Hospital Colordao
    • District of Columbia
      • Washington, District of Columbia, Egyesült Államok, 20010
        • Children's National Medical Center
    • Tennessee
      • Nashville, Tennessee, Egyesült Államok, 37212
        • St. Jude Children's Research Hospital

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

1 perc (FELNŐTT, OLDER_ADULT, GYERMEK)

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Tanulmányozható nemek

Összes

Leírás

Kizárások:

  • 5150 vagy 5250 pszichiátriai fogvatartott betegek
  • Foglyok
  • A Kaliforniai Egyetem alkalmazottai/hallgatói vagy a vizsgálatban részt vevő bármely kulcsfontosságú munkatárs közeli munkatársai
  • Ambuláns és/vagy krónikus betegségben szenvedő betegek

Befogadás:

Demográfiai kritériumok

  1. Kor: bármilyen (korhatár nélkül)
  2. Nyelv: bármilyen (tolmácsszolgáltatás igénybevételével a hozzájárulás megszerzéséhez)

A következő esetekben a fertőző szindrómák közé tartozik az agyhártyagyulladás, az agyvelőgyulladás, a láz, a szepszis és a tüdőgyulladás:

Klinikai kritériumok

  1. Kórházi felvétel vagy átszállítás feltételezett fertőző szindróma diagnosztizálásával vagy fertőző szindrómát magában foglaló klinikai megjelenéssel, az alábbiak szerint:

    • Meningitis: 38°C feletti láz és rendellenes képalkotás vagy CSF pleocytosis (CSF fehérvérsejtszám (WBC) > 5 /mm^3) +/- nyakmerevség, +/- fejfájás, +/- görcsroham
    • Encephalitis: pleocytosis és a következők legalább egyike: megváltozott mentális állapot, görcsrohamok, új gócos neurológiai leletek, kóros EEG, akut agyi rendellenességek a neuroimaging során
  2. A tünetekért felelős nem fertőző etiológiájú diagnózis nem ismert
  3. Beiratkozás időpontja: a tünetek megjelenésétől számított 7 napon belül, vagy a feltételezett fertőző szindróma kezdeti megjelenése vagy akut exacerbációja.

Példakritériumok

  1. agy-gerincvelői folyadék rendelkezésre áll a tünetek megjelenésétől számított 7 napon belül ÉS a kórházi felvételt vagy átadást követő 3 napon belül, kivéve, ha a klinikai állapot hirtelen romlása, a pleocytosis vagy más laboratóriumi paraméterek súlyosbodása által meghatározott akut exacerbáció bizonyítéka.
  2. Minimum 600 mikroliter (uL) klinikai minta, 4 Celsius-fokon (C) legfeljebb 5 napig tárolva (ideális esetben -70 Celsius fokon lefagyasztva a begyűjtést követő 24 órán belül)
  3. Legfeljebb 3 fagyasztási-olvadási ciklus

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Elsődleges cél: DIAGNOSZTIKAI
  • Kiosztás: NA
  • Beavatkozó modell: SINGLE_GROUP
  • Maszkolás: EGYIK SEM

Fegyverek és beavatkozások

Résztvevő csoport / kar
Beavatkozás / kezelés
Kísérleti: mNGS-vizsgálatra bevont betegek
Meningitisben és/vagy encephalitisben szenvedő betegeket vonnak be ebbe a vizsgálatba, hogy elemezzék az mNGS klinikai hasznosságát a kórokozók kimutatására. Ehhez a vizsgálathoz nincs kontrollcsoport (a vizsgálók retrospektív diagramok áttekintésével és klinikai térítési dokumentumokkal azonosítják a múltbeli kontrollokat).
Ez a vizsgálat egy laboratóriumilag validált metagenomikus teszt a vírusok, baktériumok, gombák és paraziták átfogó kimutatására klinikai mintákban.
Más nevek:
  • Szekvencia alapú ultragyors kórokozó azonosítás (SURPI)+
  • UCSF metagenomikus következő generációs szekvenálási tesztelés

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
A legalább egy szolgáltatói választ tartalmazó esetek teljes száma
Időkeret: a beteg vizsgálatba való felvételét követő 1 hónapon belül
A nyomozók az mNGS vizsgálat hatását a klinikai felmérések és a CMSB (Clinical Microbial Sequencing Board) visszajelzései és megbeszélései alapján értékelik, amelyet esetenként legalább 1 szolgáltatói válasz alapján mérnek.
a beteg vizsgálatba való felvételét követő 1 hónapon belül

Másodlagos eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Klinikai eredmények: A cerebrospinális folyadékgyűjtéstől az mNGS-eredményekig eltelt idő
Időkeret: a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt
A nyomozók áttekintik az orvosi feljegyzéseket, hogy meghatározzák a kezdeti megjelenés időpontját, és megmérjék az mNGS-eredményekhez szükséges időt.
a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt
Klinikai eredmények: A tartózkodás időtartama
Időkeret: a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt
A nyomozók áttekintik az orvosi feljegyzéseket, hogy meghatározzák a tartózkodás hosszát, beleértve a rehabilitációs intézményekbe való kibocsátást.
a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt
Klinikai eredmények: végső diagnózis kategória
Időkeret: a felvételtől az ügy végső felülvizsgálatának időpontjáig (1 hónappal az elbocsátás után vagy legfeljebb egy évig)
A nyomozók áttekintik az orvosi feljegyzéseket a végső diagnózis megállapítása érdekében, miután minden diagnosztikai vizsgálatot elvégeztek, beleértve a metagenomikus Next-Gen szekvenálást és adott esetben a boncolást.
a felvételtől az ügy végső felülvizsgálatának időpontjáig (1 hónappal az elbocsátás után vagy legfeljebb egy évig)
Klinikai eredmények: Az mNGS összhangja a cerebrospinális folyadék kórokozóin végzett egyéb molekuláris tesztekkel
Időkeret: a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt
Az mNGS eredményeket a hagyományos konkordancia-teszttel hasonlították össze. A hagyományos tesztelés magában foglalta mind az egyes betegek kivizsgálása során elrendelt teszteket, mind a cerebrospinális folyadék (CSF) mNGS-leleteinek megerősítését.
a felvételtől az elbocsátást követő 1 hónapig minden egyes beteg esetében a vizsgálati időszak alatt

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Publikációk és hasznos linkek

A vizsgálattal kapcsolatos információk beviteléért felelős személy önkéntesen bocsátja rendelkezésre ezeket a kiadványokat. Ezek bármiről szólhatnak, ami a tanulmányhoz kapcsolódik.

Általános kiadványok

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2016. június 1.

Elsődleges befejezés (Tényleges)

2017. július 31.

A tanulmány befejezése (Tényleges)

2017. július 31.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2016. szeptember 13.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2016. szeptember 19.

Első közzététel (Becslés)

2016. szeptember 21.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2021. május 27.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2021. május 7.

Utolsó ellenőrzés

2021. május 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

IGEN

IPD terv leírása

A vizsgálatból származó összes genomiális/metagenomikus szekvenálási adat elérhető lesz a NIH Sequence Read Archive vagy az NIH genotípusok és fenotípusok adatbázisában (dbGaP), attól függően, hogy humán szekvenciaadatokat tartalmaznak-e. A nyomozók kérésre az azonosítás nélküli kiegészítő klinikai, laboratóriumi és radiográfiai adatokat is elérhetővé kívánják tenni.

IPD megosztási időkeret

A klinikai vizsgálati jelentést 2018 júniusáig benyújtják közzétételre.

Az IPD megosztását támogató információ típusa

  • CSR

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Igen

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Klinikai vizsgálatok a Agyvelőgyulladás

Klinikai vizsgálatok a mNGS a kórokozók kimutatására

3
Iratkozz fel