유잉 육종 환자의 조직 샘플 내 바이오마커

목표:

• Ewing 육종 종양 표본에서 준비한 게놈 DNA의 특정 유전자좌에서 GGAA-현미부수체 다형성의 스펙트럼을 설명합니다.
• 질병에 걸리지 않은 유럽 및 아프리카 정상 게놈 DNA와 비교하여 Ewing 육종 종양 표본에서 준비한 게놈 DNA에서 GGAA-현미부수체 다형성에 차이가 있는지 확인합니다.
• Ewing의 육종 종양 표본에서 준비한 게놈 DNA의 특정 위치에서 GGAA-마이크로새틀라이트 다형성이 COG 프로토콜 AEWS0031에서 치료받은 환자의 질병 결과와 상관관계가 있는지 확인합니다.
• 전체 게놈 증폭이 증폭되지 않은 게놈 DNA와 비교하여 GGAA-마이크로새틀라이트에 변경을 도입하는지 여부를 결정합니다.

개요: 게놈 PCR은 NR0B1 및 GSTM4 프로모터의 미소부수체를 증폭하는 데 사용됩니다. 미세부수체 크기를 결정하는 것 외에도 표준 토포이소머라제 클로닝 프로토콜을 사용하여 pCR4 벡터(Invitrogen)에 클로닝한 후 각 미세부수체를 시퀀싱합니다.