Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Mikroorganismer som utløsere ved akutt alvorlig ulcerøs kolitt og deres innflytelse på medisinsk terapieffektivitet: en multiomics pilottilnærming. (ITAC)

22. mai 2020 oppdatert av: University Hospital, Bordeaux
Denne pilotprospektive studien vil undersøke rollen til mikrobiota og kjente enteropatogener i akutt alvorlig ulcerøs kolitt (ASUC). Etterforskere vil sammenligne en gruppe pasienter som er innlagt på sykehus for en ASUC med pasienter som opplever en ikke-alvorlig ulcerøs kolitt (NSUC) oppblussing ved å undersøke mikrobiom, metabolom og transkriptom og integrere disse dataene gjennom et multiomisk rammeverk. Denne systembiologiske tilnærmingen tar sikte på å forbedre vår forståelse av denne alvorlige hendelsen, definere diagnose og prognosebiomarkører for å forbedre medisinsk terapi og unngå kolektomi og/eller død.

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Ulcerøs kolitt (UC) er en av de to enhetene av inflammatorisk tarmsykdom (IBD), sammen med Crohns sykdom. En av 4 pasienter opplever en akutt alvorlig ulcerøs kolitt (ASUC) i løpet av sykdomsforløpet, definert som en alvorlig oppblussing med systemisk betennelse. ASUC er en medisinsk og kirurgisk nødsituasjon da komplikasjoner og død kan oppstå når pasienter ikke reagerer på medisinsk behandling og krever bergingskolektomi. Lite er kjent om patofysiologien og spesifikt triggerne til ASUC. Ved baseline vil etterforskerne undersøke tilstedeværelsen av en mikrobiomsignatur hos pasienter med ASUC sammenlignet med pasienter med ikke-alvorlig UC-oppbluss (NSUC). For å identifisere rollen til mikroorganismer vil etterforskerne se spesifikt etter kjente enteropatogener, dvs. Clostridium difficile og Cytomegalovirus. Etterforskere skal undersøke virkningen av mikrobiotaforstyrrende stoffer, som antibiotika, NSAIDs og kosthold på mikrobiota og pasientenes utfall. For å evaluere rollen til vertens inflammatoriske veier, vil etterforskere studere tykktarmsslimhinnetranskriptomet og vertsmetabolomet, med fokus på antimikrobielle forsvarsveier, angående den foreslåtte rollen til defekte immunforsvarsveier i IBD-patogenesen. Etterforskere vil fokusere på IL23- og Jak-veiene, siden nye medikamenter rettet mot disse molekylene nå er tilgjengelige for IBD-pasienter, men fortsatt ikke anbefalt i ASUC-innstillingen. Vår siste tilnærming vil være å evaluere forutsigbarheten av responsen på terapi i henhold til baseline og tidlige endringer av avføringsmikrobiom og vertsmetabolom.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

40

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (VOKSEN, OLDER_ADULT)

Tar imot friske frivillige

N/A

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter diagnostisert med ulcerøs kolitt i henhold til vanlige kriterier.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

Alle pasienter:

  • Voksne pasienter diagnostisert med ulcerøs kolitt i henhold til vanlige kriterier.
  • Gratis, informert og skriftlig samtykke signert av deltakeren og etterforskeren (senest på dagen for inkludering og før enhver undersøkelse som kreves av forskningen).

ASUC-gruppe:

Voksne pasienter innlagt en ASUC definert i henhold til Truelove-kriterier, dvs. ≥6 blodige daglige avføringer med ett eller flere av følgende kriterier: temperatur >37,8°C, puls >90 slag/min, hemoglobin <10,5g/dl eller C Reactive-Protein >45mg/l.

Ikke-alvorlig akutt UC-pasientgruppe (NSUC):

Voksne pasienter med symptomer på sykdomsaktivitet, tilsvarende en delvis Mayo-skåre på 4 eller mer med en subscore for rektal blødning på minst 1, uten Truelove alvorlighetskriterier.

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter med perianale lesjoner, ileale lesjoner eller endoskopiske aspekter av tykktarmslesjonene relatert til en akutt alvorlig kolitt med Crohns sykdom.
  • Pasienter under 18 år.
  • Pasienter under rettslig beskyttelse eller ute av stand til å uttrykke sitt samtykke.
  • Pasienter som ikke er tilknyttet et helseforsikringssystem.
  • Pasienter som er frihetsberøvet ved rettslig eller administrativ beslutning eller innlagt på sykehus uten samtykke eller innlagt i en sanitær eller sosial institusjon av en annen grunn enn forskning

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Akutt alvorlig ulcerøs kolitt gruppe

Ved inkludering, på dag 5, dag 42 og ved 3 måneder, vil ett 2 ml EDTA-blodrør samles inn for metabolomikk.

Polare metabolitter, lipider, frie fettsyrer og gallesyrer vil bli identifisert og kvantifisert ved hjelp av ultrahøyytelses væskekromatografi/tandem nøyaktig massespektrometrimetode.

Ved inkludering vil ett 2 ml EDTA-rør lagres som en DNA-samling.

Én avføringsprøve tas ved baseline, dag 5, dag 42 og etter 3 måneder og fryses ved -80°C og deles i 2 alikvoter.

En avføringsalikvot vil bli brukt til metabolomikk. Polare metabolitter, lipider, frie fettsyrer og gallesyrer vil bli identifisert og kvantifisert ved hjelp av ultrahøyytelses væskekromatografi/tandem nøyaktig massespektrometrimetode. Den andre vil bli brukt til mikrobiotaanalyse. Prøver vil bli sendt til McGill University (Prof. SALEHs laboratorium) for utvinning og deretter, Génome Québec Innovation Center (McGill University, Montréal, Canada) for sekvensering av V4-regionen til 16S rRNA-genet på Illumina MiSeq i paret-ende-modus.

Under rutinemessig fleksibel sigmoidoskopi vil 6 biopsier bli tatt med en 5 mm biopsitang ved baseline og etter 3 måneder. Biopsier vil bli plassert i et sterilt hetteglass som inneholder RNAlater (Qiagen, Hilden, Tyskland) og lagret ved -80 °C. To biopsier vil bli brukt til slimhinnemikrobiomanalyse på samme måte som avføringsprøven. Fire biopsier vil bli brukt for RNAseq. Prøver vil bli sendt til Prof. SALEHs laboratorium i Montréal for nukleinsyreekstraksjon. McGill University og Génome Québec Innovation Center (McGill University, Montréal, Canada) vil gi bibliotekforberedelse og neste generasjons sekvensering. Gjennomsnittlig antall unikt kartlagte avlesninger per sekvenseringskjøring vil være 30 millioner avlesninger per prøve.
Ikke-alvorlig ulcerøs kolitt gruppe

Ved inkludering, på dag 5, dag 42 og ved 3 måneder, vil ett 2 ml EDTA-blodrør samles inn for metabolomikk.

Polare metabolitter, lipider, frie fettsyrer og gallesyrer vil bli identifisert og kvantifisert ved hjelp av ultrahøyytelses væskekromatografi/tandem nøyaktig massespektrometrimetode.

Ved inkludering vil ett 2 ml EDTA-rør lagres som en DNA-samling.

Én avføringsprøve tas ved baseline, dag 5, dag 42 og etter 3 måneder og fryses ved -80°C og deles i 2 alikvoter.

En avføringsalikvot vil bli brukt til metabolomikk. Polare metabolitter, lipider, frie fettsyrer og gallesyrer vil bli identifisert og kvantifisert ved hjelp av ultrahøyytelses væskekromatografi/tandem nøyaktig massespektrometrimetode. Den andre vil bli brukt til mikrobiotaanalyse. Prøver vil bli sendt til McGill University (Prof. SALEHs laboratorium) for utvinning og deretter, Génome Québec Innovation Center (McGill University, Montréal, Canada) for sekvensering av V4-regionen til 16S rRNA-genet på Illumina MiSeq i paret-ende-modus.

Under rutinemessig fleksibel sigmoidoskopi vil 6 biopsier bli tatt med en 5 mm biopsitang ved baseline og etter 3 måneder. Biopsier vil bli plassert i et sterilt hetteglass som inneholder RNAlater (Qiagen, Hilden, Tyskland) og lagret ved -80 °C. To biopsier vil bli brukt til slimhinnemikrobiomanalyse på samme måte som avføringsprøven. Fire biopsier vil bli brukt for RNAseq. Prøver vil bli sendt til Prof. SALEHs laboratorium i Montréal for nukleinsyreekstraksjon. McGill University og Génome Québec Innovation Center (McGill University, Montréal, Canada) vil gi bibliotekforberedelse og neste generasjons sekvensering. Gjennomsnittlig antall unikt kartlagte avlesninger per sekvenseringskjøring vil være 30 millioner avlesninger per prøve.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Analyse av fekal mikrobiota i hver gruppe.
Tidsramme: Inkluderingsbesøk
Sekvensering av V4-regionen til 16S rRNA-genet ved inkludering på kolonbiopsiene tatt under rutinemessig sigmoidoskopi.
Inkluderingsbesøk

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Diagnose av Clostridium difficile-infeksjoner
Tidsramme: Inkluderingsbesøk
Etterforskere vil definere en Clostridium difficile-infeksjon som glutamat dehydrogenase positiv test assosiert med polymerase kjedereaksjon toksin positiv test i avføring eller tarmvæske.
Inkluderingsbesøk
Diagnose av Cytomegalovirus (CMV) infeksjoner
Tidsramme: grunnlinje
Etterforskere vil definere en CMV-infeksjon som tilstedeværelse av CMV-inneslutninger i Hemalum Eosine eller ImmunoHistoChemistry i tykktarmsbiopsiene tatt under grunnlinjesigmoidoskopien
grunnlinje

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (FAKTISKE)

14. mai 2020

Primær fullføring (FORVENTES)

1. februar 2021

Studiet fullført (FORVENTES)

1. februar 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

14. februar 2020

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

14. februar 2020

Først lagt ut (FAKTISKE)

17. februar 2020

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (FAKTISKE)

26. mai 2020

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

22. mai 2020

Sist bekreftet

1. februar 2020

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Inflammatoriske tarmsykdommer

Kliniske studier på Blodprøver

3
Abonnere