MRD-applikasjon hos kolorektal kreftpasienter

ctDNA er hentet fra plasma i stedet for serum, da sistnevnte inneholder mer DNA frigjort fra immunceller under koagulering. Blod bør trekkes inn i et K2EDTA- eller cellestabiliseringsrør (f.eks. Streck cfDNA-innsamlingsrør). Plasmaisolering bør utføres så snart som mulig, ikke senere enn 24 timer, ved bruk av K2EDTA (fortrinnsvis innen 4-6 timer) og, ved bruk av cellestabiliseringsrør, innen 2-7 dager, midlertidig lagret ved 4°C.

Prosedyre for avhending av prøver: samle inn helt antikoagulert blod, vend forsiktig til fullstendig antikoagulasjon, plasmafraksjonering bør utføres så snart som mulig, ikke senere enn 24 timer, lagres midlertidig ved 4°C ved bruk av K2EDTA (helst innen 4-6 timer), og oppbevares ved -80°C over lang tid. Det oppsamlede antikoagulasjonsblodet legges i en isboks som inneholder isposer og transporteres vertikalt til et sentrifugerbart laboratorium. Sentrifuger ved 3000 rpm ved 4 °C i 15 minutter, ta det øvre laget og alikvoter 0,5 mL/rør i 1,5 mL sentrifugerør. Kryokonservert ved -80 °C, 1 mL fullblod gir omtrent 0,5 mL plasma.