Подпись РНК-хозяина у детей с раком и инфекцией

Дети с онкологическими заболеваниями подвержены высокому риску инвазивных бактериальных инфекций, особенно во время нейтропении. Фебрильная нейтропения является ранним признаком потенциально смертельной инфекции, требующей эмпирической терапии антибиотиками широкого спектра действия. Однако у большинства детей нет бактериальной инфекции, но они все же получают антибиотики, так как современные тесты не могут выявить причины лихорадки. Ряд транскриптомных исследований иммунокомпетентных пациентов показывает, что образцы активированной РНК лейкоцитов хозяина могут с высокой точностью отличить бактериальную инфекцию от неинфекционного воспаления, но исследования у пациентов с ослабленным иммунитетом немногочисленны.

Методы

Проспективное неинтервенционное обсервационное многоцентровое исследование, включающее онкологических больных с лихорадкой у детей в течение 24 месяцев во всех отделениях детской онкологии Дании (университетские больницы Ригшоспиталет, Орхус, Оденсе и Ольборг). Экспрессия РНК лейкоцитов будет проанализирована в образцах цельной крови с помощью секвенирования РНК с поправкой на низкое количество РНК. Будут включены 300 лихорадочных эпизодов, а прогностические сигнатуры РНК хозяина будут идентифицированы в когорте открытия и оценены в когорте проверки. Кроме того, для изучения транскриптома у детей без лихорадки с нейтропенией мы включили контрольную группу из 15 детей с раком и без лихорадки.

Временные рамки Включение детей: с 1 июня 2019 г. по 31 мая 2021 г. Анализ образцов (секвенирование РНК): 1 июня 2021 г. - 1 декабря 2021 г.

Перспектива

Исследование создаст основу для рандомизированного исследования, касающегося применения РНК-сигнатуры по сравнению с обычной процедурой лечения детей с лихорадкой, больных раком. Это может привести к разработке целевой аналитической платформы экспрессии РНК, которая может предотвратить ненужное лечение антибиотиками у большинства детей с фебрильной нейтропенией. Это уменьшит госпитализацию, побочные эффекты, устойчивость к противомикробным препаратам и улучшит качество жизни во время лечения рака. Результаты могут быть экстраполированы на взрослых онкологических больных, которых часто лечат антибиотиками с профилактической целью, что затрудняет поиск инфекционного агента. Кроме того, тест может быть применен к другим детям с иммунодефицитом и инфекциями.