Preanalytiska faktorer som påverkar ctDNA-analys vid tidig och lokalt avancerad bröstcancer

Denna studie utvärderar pre-analytiska faktorer som påverkar analys av cirkulerande tumördeoxiribonukleinsyra (ctDNA) vid bröstcancer som inte sprider sig utanför bröstet och/eller lymfkörtlarna (tidigt och lokalt avancerat). ctDNA avser fritt cirkulerande tumör-DNA-fragment som finns i blodplasman. Pre-analytiska faktorer som bloduppsamlingsrör, förseningar i separation av plasma, centrifugeringshastigheter, lagringsförhållanden, frakt och DNA-extraktionsmetoder kan alla påverka ctDNA-mätningar. Olämplig bearbetning kan orsaka nedbrytning av membranet (lys) av perifera blodceller som frigör bakgrunds-DNA av vildtyp och kan också orsaka nedbrytning av cirkulerande tumörspecifika DNA-fragment. Båda mekanismerna kommer att späda ut nivåerna av ctDNA i plasma och göra det svårare att upptäcka. Att utvärdera de preanalytiska faktorerna för insamling av blod och överblivna vävnadsprover för forskning om cancer kan hjälpa forskare att utvärdera effekten av blodinsamling/bearbetning och långtidsförvaring från patienter med lokalt avancerad bröstcancer.