- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT04460638
Diagnóza SARS-CoV2 (COVID-19) v lidských slinách pomocí MALDI-TOF MS Profiling (CoviDiagMS)
Od března 2020 je virus SARS-CoV2 (nCoV19; COVID-19) považován za pandemický. Jeho vysoká míra šíření a infekce v lidské populaci a nedostatek účinné a ověřené léčby vedly úřady několika zemí k omezení jejich populace, aby zpomalily šíření COVID-19. V rámci zvládání této zdravotní krize je screening jednotlivců zásadní, aby se izolovaly „infikované případy“. Tyto screeningové testy se v současnosti provádějí na výtěrech z nosohltanu pomocí RT-PCR pro detekci virové RNA. I když jsou tyto testy citlivé a specifické, zůstávají relativně dlouhé (2–5 hodin), drahé a silná mezinárodní poptávka po soupravách pro extrakci nukleových kyselin a enzymech jsou faktory omezující provádění rozsáhlého screeningu (problém s dodávkami tamponů, spotřebního materiálu pro molekulární biologii).
Abychom předešli rizikům nedostatku screeningových prostředků, navrhujeme vyvinout inovativní alternativní strategii, bez PCR, založenou na detekci specifických proteinových signatur v lidských slinách pomocí MALDI-TOF MS profilování. MALDI-TOF MS profilování je metoda používaná v rutinní diagnostice mikrobiologickými laboratořemi k identifikaci mikroorganismů. MALDI-TOF MS profilování bylo úspěšně použito pro klasifikaci jedinců podle jejich infekčního stavu (orální patologie) na základě analýzy jejich slin, ale také jako nástroj pro identifikaci respiračních virů ze supernatantů buněčných kultur. Kromě toho máme odborné znalosti a dovednosti v oblasti profilování MS MALDI-TOF a zavedli jsme nové strategie pro zlepšení kvality profilů a jejich analýzy, zejména v souvislosti s projekty entomologické a vektorové identifikace. A konečně nedávné čínské studie uvádějí, že COVID-19 byl detekovatelný ve slinách pomocí RT-PCR.
Hlavním cílem této studie je vyvinout test založený na profilovací metodě MALDI-TOF k detekci jedinců infikovaných SARS-CoV2 ze vzorku slin.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Marseille, Francie, 13013
- Hôpital d'Instruction des Armées Laveran
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- 18 let;
- screening na SARS-CoV2 pomocí RT-PCR z nasofaryngeálního výtěru během 96 hodin před zařazením.
Kritéria vyloučení:
- Pacient přijat do intenzivní péče;
- Těhotná žena.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Hospitalizační skupina Covid+
Pacienti hospitalizovaní s infekcí SARS-CoV2
|
Vzorky slin jsou pravidelně odebírány po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
Klinická data účastníka budou shromažďována pravidelně po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
|
|
Ambulantní skupina Covid+
Pacienti nebo ošetřovatelé byli ambulantně sledováni kvůli infekci SARS-CoV2
|
Vzorky slin jsou pravidelně odebírány po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
Klinická data účastníka budou shromažďována pravidelně po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
|
|
Covid- skupina
Pečovatelé nejsou infikováni SARS-CoV2
|
Vzorky slin jsou pravidelně odebírány po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
Klinická data účastníka budou shromažďována pravidelně po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
|
|
Patologická skupina bez SARS
Jedinci, kteří nejsou infikováni SARS-CoV2, ale mají jinou akutní a/nebo infekční patologii jinou než SARS
|
Vzorky slin jsou pravidelně odebírány po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
Klinická data účastníka budou shromažďována pravidelně po dobu až 30 po sobě jdoucích dnů.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vývoj testu založeného na profilovací metodě MALDI-TOF pro detekci jedinců infikovaných SARS-CoV2 ze vzorku slin.
Časové okno: Den 30
|
Vývoj tohoto testu je založen na technikách strojového učení, které zahrnují „trénink“ matematického modelu, ve kterém budou výsledky analýzy hmotnostní spektrometrie vzorků slin a klinická data použity ke stanovení informací potřebných k rozlišení vzorku slin od účastník infikovaný SARS-CoV2 ze vzorku zdravých slin.
|
Den 30
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Míra správné klasifikace testem (profilování MALDI-TOF MS) ze vzorku slin
Časové okno: Den 30
|
Pro každý vzorek slin bude určen stav („správný“ nebo „nesprávný“) klasifikace vzorku („infikovaný“ nebo „neinfikovaný“) testem (profilování MALDI-TOF MS).
Poté bude vypočtena míra správné klasifikace.
Test bude považován za účinný, když dosáhne správné klasifikace vyšší než 95 %.
|
Den 30
|
|
Míra správné klasifikace pomocí RT-PCR ze vzorku slin
Časové okno: Den 30
|
Pro každý vzorek slin bude určen stav („správný“ nebo „nesprávný“) klasifikace vzorku („infikovaný“ nebo „neinfikovaný“) pomocí RT-PCR.
Poté bude vypočtena míra správné klasifikace pomocí RT-PCR.
|
Den 30
|
|
Identifikace proteinů specifických pro infekci SARS-CoV2
Časové okno: Den 30
|
Na každém vzorku slin bude pomocí hmotnostní spektrometrie stanovena exprese proteinů.
Srovnáním vzorků slin infikovaných SARS-CoV2 a neinfikovaných vzorků slin bude stanovena přítomnost proteinů, které jsou specificky exprimovány ve vzorcích slin infikovaných SARS-CoV2.
|
Den 30
|
|
Přítomnost pozitivní anti-SARS-CoV2 protilátkové odpovědi pomocí RT-PCR
Časové okno: Den 30
|
U každého vzorku slin infikovaných SARS-CoV2 bude pomocí RT-PCR stanovena přítomnost protilátek proti SARS-CoV2.
|
Den 30
|
|
Korelace mezi identifikovanými proteinovými markery a klinickým průběhem účastníků.
Časové okno: Den 30
|
U účastníků infikovaných SARS-CoV2 (hospitalizační skupina Covid+ a ambulantní skupina Covid+) bude stanovena přítomnost korelace mezi přítomností proteinů specifických pro infekci SARS-CoV2 a klinickým vývojem pacientů.
|
Den 30
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další identifikační čísla studie
- 2020-COVID19-15
- 2020-A01249-30 (Jiný identifikátor: IDRCB)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na SARS-CoV-2
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Zhejiang Provincial Center for Disease Control and PreventionZatím nenabíráme
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical College; Ningbo Rongan Biological...Zatím nenabíráme
-
AIM Vaccine Co., Ltd.First Affiliated Hospital Bengbu Medical CollegeAktivní, ne nábor
-
AIM Vaccine Co., Ltd.Hunan Provincial Center for Disease Control and PreventionDokončeno
-
Indiana UniversityDokončeno
-
Peking UniversityCenters for Disease Control and Prevention, China; Beijing Pinggu District... a další spolupracovníciDokončeno
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisDokončeno
-
University Hospital, Montpelliersociete SkillCell - 97198 Jarry; CNRS Alcediag UMR9005 - societe Sys2Diag -...Dokončeno
-
Centre Hospitalier Universitaire DijonDokončeno
-
Generate BiomedicinesDokončeno
Klinické studie na Sběr slin
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisZatím nenabíráme
-
Acorai ABDokončenoSrdeční selháníSpojené státy, Švédsko, Spojené království, Kanada, Dánsko, Belgie
-
Northwell HealthBecton, Dickinson and CompanyPozastaveno
-
IdentigeneCRI Lifetree Clinical ResearchNeznámý
-
M.D. Anderson Cancer CenterDokončenoRakovina prsuSpojené státy
-
Rutgers, The State University of New JerseyNational Cancer Institute (NCI)PozastavenoPeritoneální karcinomatóza | Novotvar trávicího systému | Karcinom jater a intrahepatálních žlučovodů | Apendix Karcinom podle AJCC V8 Stage | Kolorektální karcinom podle AJCC V8 Stage | Karcinom jícnu podle stadia AJCC V8 | Karcinom žaludku podle stadia AJCC V8Spojené státy
-
Cliniques universitaires Saint-Luc- Université...Université de LiègeNáborCystická fibróza | BiomarkeryBelgie
-
Memorial Sloan Kettering Cancer CenterDokončenoRakovina prostatySpojené státy
-
Indiana UniversityUkončenoDiabetes Mellitus | Bakteriální infekce | Rána | Infikovaný vřed kůžeSpojené státy
-
University of MinnesotaNational Institute on Drug Abuse (NIDA)DokončenoPorucha užívání látkySpojené státy