SARS-CoV2 (COVID-19) diagnose i menneskelig spytt av MALDI-TOF MS profilering (CoviDiagMS)

Siden mars 2020 er SARS-CoV2-virus (nCoV19; COVID-19) ansett som pandemi. Den høye sprednings- og infeksjonshastigheten i den menneskelige befolkningen og mangelen på effektiv og validert behandling har ført til at myndighetene i flere land har begrenset befolkningen for å bremse spredningen av COVID-19. Som en del av håndteringen av denne helsekrisen er screening av individer avgjørende for å isolere "infiserte tilfeller". Disse screeningtestene utføres for tiden på nasofaryngeale vattpinner ved bruk av RT-PCR for påvisning av viralt RNA. Selv om disse testene er sensitive og spesifikke, forblir de relativt lange (2-5 timer), dyre og den sterke internasjonale etterspørselen etter nukleinekstraksjonssett og enzymer er faktorer som begrenser implementeringen av omfattende screening (problem med forsyning av vattpinner, molekylærbiologiske forbruksvarer).

For å forhindre risikoen for mangel på screeningsmidler, foreslår vi å utvikle en innovativ alternativ strategi, PCR-fri, basert på påvisning av spesifikke proteinsignaturer i menneskelig spytt ved MALDI-TOF MS-profilering. MALDI-TOF MS-profilering er en metode som brukes i rutinediagnostikk av mikrobiologiske laboratorier for identifisering av mikroorganismer. MALDI-TOF MS-profilering har blitt brukt med hell for å klassifisere individer i henhold til deres infeksjonsstatus (orale patologier) basert på analysen av spytt, men også som et verktøy for identifisering av luftveisvirus fra cellekultursupernatanter. I tillegg har vi ekspertise og ferdigheter innen MALDI-TOF MS-profilering og har implementert nye strategier for å forbedre kvaliteten på profilene og deres analyse, spesielt i sammenheng med entomologiske og vektoridentifikasjonsprosjekter. Til slutt har nyere kinesiske studier rapportert at COVID-19 var påviselig i spytt ved RT-PCR.

Hovedmålet med denne studien er å utvikle en test basert på MALDI-TOF profileringsmetoden for å oppdage individer infisert med SARS-CoV2 fra spyttprøve.