Analyse du microbiome chez les patients atteints d'un cancer de l'œsophage, du pancréas et colorectal subissant une chirurgie gastro-intestinale (MA-PPING)

Justification : Le microbiome intestinal est la composition des micro-organismes qui résident dans le tractus gastro-intestinal. Dans des circonstances normales, le microbiome est équilibré et a un effet bénéfique sur la fonction intestinale. Cependant, lorsque le microbiome est stressé, c'est-à-dire par une opération, la santé des patients ou des médicaments, la composition du microbiome peut changer rapidement et la virulence de ses micro-organismes peut augmenter rapidement. La chirurgie, en particulier la chirurgie gastro-intestinale, a un effet perturbateur sur la barrière muqueuse intestinale et peut entraîner des modifications de la composition microbienne. En outre, la maladie chirurgicale sous-jacente elle-même peut être caractérisée par des modifications du microbiome. Le cancer gastro-intestinal est associé à des altérations spécifiques du microbiome, et la présence de certains microbiotes est liée à la carcinogenèse et à l'atteinte des ganglions lymphatiques.

La fuite anastomotique est une complication grave après une chirurgie gastro-intestinale et plusieurs études animales ont lié les changements microbiens au développement de la fuite anastomotique. Seules quelques petites études exploratoires sur l'homme ont étudié le microbiome pendant la chirurgie et ont corrélé leurs résultats avec le développement de complications postopératoires. Cependant, la majorité de ces études n'ont échantillonné le microbiome qu'en peropératoire. Les changements microbiens liés à la chirurgie se manifestent également dans la phase pré- et postopératoire, par conséquent, l'échantillonnage dans ces phases est crucial. Pour mieux comprendre les changements de la composition du microbiome dus à la chirurgie gastro-intestinale et la relation avec les complications infectieuses postopératoires, des échantillons doivent être prélevés à plusieurs moments ; avant, pendant et après la chirurgie. Avec cette étude, nous visons à cartographier le microbiome buccal et intestinal des patients diagnostiqués avec un cancer du pancréas, de l'œsophage ou colorectal dans un laps de temps allant du bilan d'une opération jusqu'à la phase postopératoire pour évaluer l'évolution de la composition du microbiome au cours d'une intervention chirurgicale. parcours patient.