エクソソームmiRNAを用いた液体生検により、肝内胆管癌患者における潜在的な転移のリスク層別化が可能になります。 (EXOMIC)
機械学習ベースのエクソソーム液体生検による肝内胆管癌患者の潜在転移リスクの層別化
調査の概要
詳細な説明
肝内胆管癌（ICC）の発生率は世界的に上昇しており、予後は依然として不良です。 術前画像検査で検出されない潜在的な微小転移を有する患者は、急速な再発を経験し、生存率が著しく悪化することが多いです。 腫瘍由来エクソソームは転移前ニッチの形成に寄与し、積極的な転移能を反映するマイクロRNAを運搬します。 我々は、循環エクソソームmiRNAプロファイルが、手術前に潜在転移を明らかにする非侵襲的生物マーカーとして機能し得ると仮説を立てています。
術前エクソソームは、小規模RNAシーケンシング（探索）により分析され、その後RT-qPCRによる検証と機械学習モデリングを実施し、潜在転移の予測スコアを開発します。 本研究は、診断性能（感度、特異度、精度、AUROC）、予後的関連性（全生存期間／無再発生存期間）、臨床的有用性（決定曲線分析）を評価し、ICCにおける治療層別化のための生物学的に情報化された枠組みを確立します。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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California
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Duarte、California、アメリカ、91016
- City of Hope Medical Center
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
適格基準：
- 組織学的に確認された肝内胆管癌（臨床病期I-III）。
- 治癒目的の肝切除術を受けること。
- 術前血漿または血清サンプルの入手可能（200μL以上）。
- 施設のプロトコールに基づく標準的な病期診断画像検査の完了。
- 文面によるインフォームドコンセントの取得。
除外基準：
- 肝外胆管癌または胆嚢癌。
- 同時性の非肝内胆管癌悪性腫瘍。
- 不十分な臨床経過観察。
- 承諾不能。
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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トレーニングコホート - 潜在転移を伴うICC
手術時に潜在転移が検出されたICC患者のコホート。 発見コホートで特定された候補エクソソームマイクロRNAを検証するため、術前サンプルをEXOMIC qRT-PCRアッセイを用いて解析しました。 |
候補エクソソーマルマイクロRNAの定量的逆転写PCR（qRT-PCR）による検証は、低分子RNAシーケンシングによって同定されたものです。 このアッセイは、独立した肝内胆管癌患者コホートから得られた術前血清または血漿サンプルにおいて実施され、外科的切除前の潜在転移検出に対する選択されたmiRNAの予測的価値を検証することを目的としました。 |
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トレーニングコホート - 潜在転移のないICC
手術時に潜在転移のなかったICC患者群。
潜在転移検出のための予測モデルの改良とmiRNA発現の差異評価を目的に、術前サンプルをEXOMIC qRT-PCRアッセイで解析しました。
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候補エクソソーマルマイクロRNAの定量的逆転写PCR（qRT-PCR）による検証は、低分子RNAシーケンシングによって同定されたものです。 このアッセイは、独立した肝内胆管癌患者コホートから得られた術前血清または血漿サンプルにおいて実施され、外科的切除前の潜在転移検出に対する選択されたmiRNAの予測的価値を検証することを目的としました。 |
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検証コホート - 潜在性転移を有するICC
原発腫瘍切除時に潜在転移を有するICC患者のコホート。 EXOMIC qRT-PCRアッセイを適用し、手術前に潜在転移を特定するためのエクソソームmiRNAパネルの予測的価値を確認しました。 |
候補エクソソーマルマイクロRNAの定量的逆転写PCR（qRT-PCR）による検証は、低分子RNAシーケンシングによって同定されたものです。 このアッセイは、独立した肝内胆管癌患者コホートから得られた術前血清または血漿サンプルにおいて実施され、外科的切除前の潜在転移検出に対する選択されたmiRNAの予測的価値を検証することを目的としました。 |
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検証コホート - 潜在転移のないICC
手術時に潜在転移が確認されなかったICC患者のコホート。
術前サンプルをEXOMIC qRT-PCRアッセイで分析し、miRNA発現の差異を評価し、潜在転移検出のための予測モデルを改良した。
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候補エクソソーマルマイクロRNAの定量的逆転写PCR（qRT-PCR）による検証は、低分子RNAシーケンシングによって同定されたものです。 このアッセイは、独立した肝内胆管癌患者コホートから得られた術前血清または血漿サンプルにおいて実施され、外科的切除前の潜在転移検出に対する選択されたmiRNAの予測的価値を検証することを目的としました。 |
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発見コホート - 潜伏転移を伴うICC
発見コホートにおいて、原発腫瘍切除時に潜在性転移が認められた肝内胆管癌（ICC）患者。 潜在性転移の存在に関連するエクソソーム由来マイクロRNAを同定するため、前処置サンプルをsmall RNAシーケンシングを用いて解析しました。 |
術前の血清または血漿サンプルを用いて行われたハイスループットsmall RNAシーケンシングにより、肝内胆管癌（ICC）患者における手術時の潜在転移に関連するエクソソーム由来マイクロRNAを同定しました。 発見コホートにおいて、潜在転移の有無による患者間で発現が異なるmiRNAを検出するためにシーケンシングデータを解析しました。 |
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発見コホート - 潜在転移のない肝内胆管癌
原発腫瘍切除時に潜在転移が認められなかった発見コホートのICC患者。 候補マイクロRNAを同定するため、これらの患者の術前サンプルをsmall RNAシーケンス解析し、潜在転移を有する患者のサンプルと比較しました。 |
術前の血清または血漿サンプルを用いて行われたハイスループットsmall RNAシーケンシングにより、肝内胆管癌（ICC）患者における手術時の潜在転移に関連するエクソソーム由来マイクロRNAを同定しました。 発見コホートにおいて、潜在転移の有無による患者間で発現が異なるmiRNAを検出するためにシーケンシングデータを解析しました。 |
この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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無再発生存
時間枠：3年間
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手術からICC再発までの期間
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3年間
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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全生存期間
時間枠：5年
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手術からあらゆる原因による死亡までの期間
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5年
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Ajay Goel, PhD、City of Hope Medical Center
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Doussot A, Gonen M, Wiggers JK, Groot-Koerkamp B, DeMatteo RP, Fuks D, Allen PJ, Farges O, Kingham TP, Regimbeau JM, D'Angelica MI, Azoulay D, Jarnagin WR. Recurrence Patterns and Disease-Free Survival after Resection of Intrahepatic Cholangiocarcinoma: Preoperative and Postoperative Prognostic Models. J Am Coll Surg. 2016 Sep;223(3):493-505.e2. doi: 10.1016/j.jamcollsurg.2016.05.019. Epub 2016 Jun 11.
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研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 23228/EXOMIC
個々の参加者データ (IPD) の計画
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IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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