BioForte Technology för in Silico Identifiering av kandidater för en ny mikrobiombaserad terapi och diagnostik

Målet med projektet är att utveckla och validera BioForte-teknologin. Dess huvudsakliga funktion bör vara att in silico fastställa kandidater för nya mikrobiombaserade terapier och diagnostik. Den viktigaste utmaningen som ska lösas med hjälp av tekniken är att upptäcka skillnaderna i tarmmikrobiom mellan onkologiska patienter som svarar på immunterapier och de som inte svarar på denna behandling.

Denna teknik använder maskininlärningsmetoder för att ersätta laboratorieproceduren för att hitta värdefulla genomiska egenskaper. Sådana egenskaper kan vara avgörande för att identifiera skillnader mellan de två populationerna (t. responders vs non-responders) för att rikta in sig på specifika stammar.

Proverna och data som samlas in i denna kliniska studie kommer att användas för klinisk validering av BioForte-teknologin. För alla patienter som behandlas med immunterapi kommer avföring att utföras per patient (en avföringsuppsamling innan immunterapi påbörjas med anti-PD1/anti-PDL1 och/eller anti CTLA4 antikroppar). Prover kommer att sekvenseras med långläst sekvenseringsteknik. Parallellt kommer vi också att samla in prover av perifera blodprover (PBMC) och biopsi (FFPE).