Účinky eradikace H. Pylori na mikrobiom

Současné mezinárodní směrnice a expertní pracovní skupiny podporují strategii „hledej a léčí“ pro H. pylori k prevenci rakoviny žaludku1, 2. Nejvyšší výnos tohoto přístupu se očekává v zemích s vysokým výskytem rakoviny žaludku a vysokou prevalencí H. .pylori infekce. Tento přístup bude dále podpořen evropskými směrnicemi Maastricht V (připravovaný rukopis). Důvodem pro tento přístup je, že u 1–2 % infikovaných jedinců se rozvíjí rakovina žaludku; Mezinárodní agentura pro výzkum rakoviny klasifikovala infekci H. pylori jako karcinogen I. třídy3, 4. Studie na ostrově Matsu s vysokým rizikem rakoviny žaludku naznačila, že výskyt rakoviny žaludku lze touto strategií snížit o 25 %5; k omezením však patří absence kontrolní skupiny.

Tři nedávné metaanalýzy potvrdily nákladovou efektivnost takového přístupu6–8; ty jsou samozřejmě založeny na omezených v současnosti dostupných údajích o potenciálních rizicích způsobených aplikací populační strategie.

V zemích, u kterých se očekává, že budou mít ze strategie největší prospěch, by to znamenalo nabídnout eradikační léčbu většině populace, např. v Lotyšsku by to vyžadovalo léčbu antibiotiky pro 79 % populace9 a změnilo by to současný stav země s nízkou spotřebou antibiotik na zemi s průměrnou spotřebou. To by mohlo potenciálně vést k nepříznivým důsledkům nesouvisejícím s H. pylori.

V zemi s nízkou rezistencí H. pylori vůči klarithromycinu (jako je Lotyšsko) by doporučený standardní režim eradikace H. pylori 1. linie sestával z klarithromycinu v kombinaci buď s amoxicilinem nebo metronidazolem a inhibitorem protonové pumpy; doba trvání by byla minimálně 10 dní10. Oblasti s vyšší rezistencí H. pylori na klarithromycin by vyžadovaly agresivnější léčebné modality, např. zařazením levofloxacinu do režimu. Potenciální nežádoucí účinky způsobené takovými terapiemi pro mikrobiom nejsou dostatečně studovány; názor odborníků, kteří vyvíjejí pokyny, se obecně omezuje na úvahu, že 1-2 týdenní jednorázová léčba antibiotiky by byla menším a plně reverzibilním zásahem do mikrobiomu, protože podle dostupných statistik v mnoha zemích je průměrný příjem antibiotik jeden nebo několik ošetření za rok u subjektu.

Z omezených dostupných údajů však jasně vyplývá, že i týdenní léčba makrolidy (klaritromycin, azithromycin) zvyšuje u zdravých dobrovolníků rezistenci S.pneumoniae rezistentních na makrolidy v hltanu; tento rozdíl byl statisticky významný v období 180 dnů11.

Cílem tohoto návrhu projektu je tedy zhodnotit dlouhodobé účinky eradikace H. pylori na mikrobiom gastrointestinálního traktu (GIT), vyhodnotit jeho účinky na četnost a prevalenci genů kódujících beta-laktamázy (ESBL) a vyvinout náklady efektivní prototyp screeningového testu ESBL. K dosažení tohoto cíle budou v rámci tohoto projektu odebírány vzorky stolice pacientů, kteří podstupují eradikační terapii, ve dvou časových bodech: před zahájením eradikace a jeden rok po konečné léčbě. Aby se snížil počet vzorků stolice, které si pacienti musí pořídit, a standardizoval se postup odběru vzorků, měli by účastníci prozkoumat možnost použití nádob na test na okultní krvácení ve stolici. Vzhledem k tomu, že neexistují žádné jednoznačně pozitivní zprávy o použití těchto zařízení v takových analýzách v rámci tohoto výzkumu, měli by účastníci také vyvinout vhodnou metodologii extrakce DNA. Dále, za použití analýz na bázi sekvenování nové generace účastníci určí složení mikrobiální komunity v každém vzorku a prostřednictvím srovnání dat z každého časového bodu by měli být účastníci schopni odhadnout dlouhodobé účinky eradikační terapie. Po této analýze by účastníci měli provést identifikaci repertoáru ESBL v každém vzorku a také vyhodnotit jejich četnost abundance. Podobně jako v případě komunitní analýzy srovnání obou časových bodů umožní odhadnout účinky eradikační terapie. Po získání dat účastníci outsourcují vytvoření prototypu screeningového testu ESBL, který bude založen na použití technologie mikrokuliček.