Přenos Enterobacteriaceae produkujících ESBL
Přenos ESBL produkujících Enterobacteriaceae a jejich mobilních genetických elementů - identifikace zdrojů sekvenováním celého genomu
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Pozadí a cíl Mezi nejčastější bakteriální patogeny u lidí patří několik druhů z čeledi Enterobacteriaceae. Mnoho z nich se nyní stalo odolných vůči antibiotikům, tj. Enterobacteriaceae (PE) produkujícím beta-laktamázy s rozšířeným spektrem (ESBL). Po dlouhou dobu se mělo za to, že hlavním faktorem, který řídí jejich rychlé šíření, byl přenos v nemocnicích. V poslední době však byly ESBL-PE nalezeny také v potravinách a v odpadních vodách. Tyto zdroje budou pravděpodobně hrát důležitou roli i v zábavném přenosu.
Cílem výzkumníka je identifikovat přenosové řetězce ESBL-PE v městském regionu Basilej s využitím nejnovějších celogenomových sekvenačních metod, které umožňují určit příbuznost kmenů s nejvyšším možným rozlišením, s přihlédnutím ke zdrojům v rámci nemocnic i mimo ně.
Hypotéza Nález několika geneticky souvisejících shluků ESBL-PE s epidemiologickou vazbou na kontakty v nemocnici by naznačoval relevantní přenos v našem zdravotnickém prostředí. Naproti tomu nález mnoha geneticky odlišných shluků ESBL-PE bez epidemiologického spojení s nemocnicí by zpochybnil význam celonemocničního přenosu při udržení epidemie ESBL. Toto rozlišení je zásadní pro odvození účinných doporučení prevence a kontroly.
Návrh, nastavení a pacienti Sekvenování celého genomu bude provedeno na reprezentativních kmenech ESBL odebraných od ledna 2003 do prosince 2019 v Univerzitní nemocnici v Basileji. Budou hodnoceny epidemiologické vztahy mezi pacienty s geneticky příbuznými kmeny ESBL-PE.
Od června 2017 do prosince 2019 bude navíc sekvenování celého genomu prováděno na kmenech ESBL identifikovaných z reprezentativních vzorků ze systému odpadních vod jak nemocnice, tak města Basilej, jakož i reprezentativních vzorků potravin odebraných z nemocnice a města. z Basileje. Budou posuzovány epidemiologické vztahy mezi pacienty a také vzorky z prostředí s geneticky příbuznými kmeny ESBL-PE a případy s geneticky příbuznými plazmidy nesoucími příslušné geny ESBL.
Metody, plánovaná analýza a velikost vzorku K identifikaci přenosových událostí využijeme celogenomové sekvenování technologií Illumina, která je zavedená a akreditovaná International Standards Organization (ISO) na Oddělení klinické mikrobiologie FN. Bude stanoven podíl infekce/kolonizace geneticky příbuznými izoláty Enterobacteriaceae produkujících ESBL na celkové míře infekce/kolonizace. Všechny fylogeneze budou odvozeny pomocí BEAST v2.046 s využitím našeho dříve vyvinutého nástroje pro kvantifikaci přenosových rychlostí. Celkově bude analyzováno 2000 izolátů ze vzorků pacientů a 1000 izolátů ze vzorků potravin a odpadních vod.
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- Telefonní číslo: 6810 ++41 61 328
- E-mail: sarah.tschudin@usb.ch
Studijní místa
-
-
-
Basel, Švýcarsko, 4031
- Nábor
- University Hospital Switzerland, Division of Infecteous Disease and Hospital Epidemiology
-
Kontakt:
- Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- Telefonní číslo: 6810 +41 61 328
- E-mail: sarah.tschudin@usb.ch
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- ve věku nad 1 rok
- prokázaná přeprava ESBL-PE ze všech vzorků získaných rutinní klinickou praxí mimo a hospitalizovaných pacientů z Univerzitní nemocnice v Basileji od 1. ledna do 31. prosince 2019
Kritéria vyloučení:
- nesplňuje kritéria pro zařazení
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Podíl infekce/kolonizace
Časové okno: po dokončení studia v průměru 45 měsíců
|
Podíl infekce/kolonizace geneticky příbuznými izoláty Enterobacteriaceae produkujících ESBL (primární výsledek) na celkové míře infekce/kolonizace bude stanoven a stratifikován jak pro ambulantní, tak pro druhy a období.
|
po dokončení studia v průměru 45 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD, Division of Infectious Disease and Hopital Epidemiology, University Hospital Basle
Publikace a užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhadovaný)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 2017-00100; me18Tschudin
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Infekce získaná v nemocnici
-
NCT07386275DokončenoNemocnice doma | Pacienti přijatí do jednotky Hospital at Home
-
NCT01623986DokončenoPacienti Odeslání do Echokardiografické laboratoře v nemocnici St. Michael's Hospital
-
NCT00256659DokončenoStředně nemocní hospitalizovaní pacienti v Cornell Campus v New York-Presbyterian Hospital
-
NCT07255105NáborCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection
-
NCT07209670Zatím nenabírámeCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Periferně zavedený centrální katétr | Pupeční žilní katétr
-
NCT07053553DokončenoRegistrováno u Kelkit District State Hospital Home Health Unit | Být pacientem domácí péče
-
NCT04858165NáborHospital Foodservice Spokojenost; Spokojenost se stravováním v nemocnici; Senioři, výživa, podvýživa u seniorů, podvýživa
-
NCT05337566NáborHysterektomie | Antibiotika | Infection Post Op | Profylaktický
-
NCT03746327Dokončeno
-
NCT03898115DokončenoCentral Line-associated Bloodstream Infection (CLABSI)
Klinické studie na Enterobacteriaceae produkující ESBL
-
NCT05665036StaženoMPS I | MPS1-S | MPS1-HS
-
NCT04131569NeznámýZávažné onemocnění | Mikrobiální kolonizace | Bakteriální infekce s rozšířeným spektrem beta-laktamázou
-
NCT03477084DokončenoEnterobacteriaceae infekce | Odolnost proti bakteriím
-
NCT06305455Zatím nenabírámeAntimikrobiální odolnost
-
NCT04190316NeznámýInfekce Enterobacteriaceae produkující ESBL
-
NCT01961206Dokončeno
-
NCT00254696Dokončeno
-
NCT04699981Nábor
-
NCT01931592Ukončeno
-
NCT02743585NeznámýSepse | Fungémie | Bakteriémie | Infekce krevního proudu