Overførsel af ESBL-producerende Enterobacteriaceae
Transmission af ESBL-producerende Enterobacteriaceae og deres mobile genetiske elementer - identifikation af kilder ved sekvensering af hele genom
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Baggrund og formål De mest almindelige bakterielle patogener hos mennesker omfatter flere arter af familien af Enterobacteriaceae. Mange af dem er nu blevet resistente over for antibiotika, dvs. Extended-spectrum beta-lactamases (ESBL)-producerende Enterobacteriaceae (PE). I lang tid troede man, at smitte på hospitaler var hovedfaktoren bag deres hurtige spredning. For nylig er ESBL-PE dog også blevet fundet på fødevarer og i spildevand. Disse kilder vil sandsynligvis også spille en vigtig rolle i underholdende transmission.
Efterforskerens mål er at identificere transmissionskæder af ESBL-PE i byregionen i Basel ved at bruge de nyeste helgenomsekventeringsmetoder, der gør det muligt at bestemme slægtskab af stammer med den højest mulige opløsning under hensyntagen til kilder både inden for og uden for hospitaler.
Hypotese Fundet af få genetisk relaterede klynger af ESBL-PE med en epidemiologisk forbindelse til hospitalskontakter tyder på relevant overførsel i vores sundhedsmiljø. I modsætning hertil ville fundet af mange genetisk adskilte klynger af ESBL-PE uden epidemiologiske forbindelser til hospitalet sætte spørgsmålstegn ved vigtigheden af hospitalsdækkende transmission for at opretholde ESBL-epidemien. Denne sondring er afgørende for at udlede effektive forebyggelses- og kontrolanbefalinger.
Design, omgivelser og patienter Helgenomsekventering vil blive udført på repræsentative ESBL-stammer indsamlet fra januar 2003 til december 2019 på Universitetshospitalet Basel. De epidemiologiske forhold mellem patienter med genetisk beslægtede stammer af ESBL-PE vil blive vurderet.
Fra juni 2017 til december 2019 vil der desuden blive udført helgenomsekventering på ESBL-stammer identificeret fra repræsentative prøver fra spildevandssystemet på både hospitalet og byen Basel samt repræsentative fødevareprøver indsamlet fra både hospitalet og byen af Basel. De epidemiologiske relationer mellem patienter såvel som miljøprøver med genetisk beslægtede stammer af ESBL-PE og tilfælde med genetisk beslægtede plasmider, der bærer de respektive ESBL-gener, vil blive vurderet.
Metoder, planlagt analyse og prøvestørrelse For at identificere transmissionsbegivenheder vil vi anvende helgenomsekventering med Illumina-teknologi, som er etableret og International Standards Organisation (ISO)-akkrediteret på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Universitetshospitalet. Andelen af infektion/kolonisering med genetisk beslægtede isolater af ESBL-producerende Enterobacteriaceae af den samlede infektion/koloniseringshastighed vil blive bestemt. Alle fylogenier vil blive udledt ved hjælp af BEAST v2.046 ved at anvende vores tidligere udviklede værktøj til at kvantificere transmissionshastigheder. I alt vil 2000 isolater fra patientprøver og 1000 isolater fra mad- og spildevandsprøver blive analyseret.
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- Telefonnummer: 6810 ++41 61 328
- E-mail: sarah.tschudin@usb.ch
Studiesteder
-
-
-
Basel, Schweiz, 4031
- Rekruttering
- University Hospital Switzerland, Division of Infecteous Disease and Hospital Epidemiology
-
Kontakt:
- Sarah Tschudin-Sutter, PD MD
- Telefonnummer: 6810 +41 61 328
- E-mail: sarah.tschudin@usb.ch
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- i alderen over 1 år
- bevist ESBL-PE-transport fra alle prøver opnået ved rutinemæssig klinisk praksis ude og indlagte patienter fra University Hospital Basel fra 1. januar til 31. december 2019
Ekskluderingskriterier:
- ikke opfylder inklusionskriterierne
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Infektion/koloniseringsandel
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 45 måneder
|
Andelen af infektion/kolonisering med genetisk beslægtede isolater af ESBL-producerende Enterobacteriaceae (primært udfald) af den samlede infektion/koloniseringsrate vil blive bestemt og stratificeret for både, i og ambulante omgivelser for arter og tidsperioder
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 45 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Sarah Tschudin-Sutter, PD MD, Division of Infectious Disease and Hopital Epidemiology, University Hospital Basle
Publikationer og nyttige links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 2017-00100; me18Tschudin
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Hospitalserhvervet infektion
-
NCT07326540RekrutteringHospital Acquired Bacterial Pneumonia (HABP) | Ventilator Associated Bacterial Pneumonia (VABP) | Acinetobacter Baumannii-calcoaceticus kompleks | Colistin-resistent ABC
-
NCT07489092RekrutteringICU Acquired Weakness (ICUAW)
-
NCT07406074Ikke rekrutterer endnuTilfredshed, patient | Faldskade | Venøs tromboembolisme (VTE) | Opholdsvarighed | CLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Sygeplejersker | Kateterassocieret urinvejsinfektion | Tilbagetagelsessatser | Hospital erhvervet trykskade
-
NCT03032380AfsluttetHospital Acquired Pneumonia (HAP) | Healthcare-associated Pneumonia (HCAP) | Ventilator Associated Pneumonia (VAP)
-
NCT05952648RekrutteringVAP - Ventilator Associated Pneumonia | HAP - Hospital Acquired Pneumonia
-
NCT06602934RekrutteringHospital Acquired Pneumonia (HAP) | Hjerte-kar- og luftvejssygdomme
-
NCT06706843AfsluttetHæmodialyseenheder, Hospital
-
NCT03415113Afsluttet
-
NCT02621723Ukendt
-
NCT07166653Rekruttering
Kliniske forsøg med ESBL-producerende Enterobacteriaceae
-
NCT03477084AfsluttetEnterobacteriaceae infektioner | Resistens bakteriel
-
NCT04131569UkendtKritisk sygdom | Mikrobiel kolonisering | Bakterieinfektion med udvidet spektrum af beta-lactamase
-
NCT06305455Ikke rekrutterer endnu
-
NCT04190316UkendtESBL-producerende Enterobacteriaceae-infektioner
-
NCT01961206Afsluttet
-
NCT01931592Afsluttet
-
NCT04699981Rekruttering
-
NCT02743585UkendtSepsis | Fungemia | Bakteriæmi | Blodstrømsinfektion
-
NCT00167986AfsluttetKlebsiella infektioner | Escherichia coli infektioner
-
NCT00404625UkendtHudsygdomme | Lungebetændelse | Bakteriæmi | Urinvejsinfektioner | Enterobacteriaceae infektioner