- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT05739890
Sekvenování celého genomu (WGS) na embryích IVF a jednotlivých pacientech (EmbryoWGS)
Studie vlivu otcovského věku na míru mutace de Novo pomocí sekvenování celého genomu embryí IVF
Tento výzkumný projekt se bude snažit využít vývoj v celogenomovém sekvenování embryí preimplantační genetické diagnostiky ke zkoumání vlivu otcovského věku na de novo míru mutací embryí IVF.
Studie bude sekvenovat celou genomovou DNA získanou z biopsie embryí neplodných žen, aby se získal status mutační zátěže. To umožní kromě potenciálních hotspotů mutací zjistit i rychlost mutace de novo.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Tento projekt navrhuje testování kohorty výzkumných embryí ke stanovení klíčových parametrů pro amplifikovaná trofektodermální bioptická embrya s použitím minimální hloubky požadované pro sekvenování genomu (>hloubka 30X na bázi) a sekvenování celého exomu (>hloubka 500X na bázi). Analýza bude provedena pomocí vícenásobného trojitého testování každého embrya navíc k DNA od genetického rodiče.
Studie bude porovnávat 50 embryí od neplodných žen <30 let a otců 40 a více let s 50 embryi od neplodných žen <30 let a otců <30. Bioptické vzorky DNA trofektodermu z embrya budou sekvenovány genomem a exomem, přičemž sekvenování genomu bude provedeno u každého vzorku DNA rodičů.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Santiago Munné, PhD
- Telefonní číslo: +1-646-2072897
- E-mail: santiago.munne@gmail.com
Studijní místa
-
-
Okmeydani-Sisli
-
Istanbul, Okmeydani-Sisli, Krocan, 34385
- Nábor
- Preimplantation Genetic Testing Unit ART and Reproductive Genetics Unit, Memorial Sisli Hospital
-
Kontakt:
- Semra Kahraman, M.D.
- Telefonní číslo: 90 212 314 6666
-
Kontakt:
- Murat Cetinkaya, M.D., PhD
- Telefonní číslo: +90 533 266 42 24
- E-mail: muratcetinkaya01@gmail.com
-
-
-
-
New York
-
New York, New York, Spojené státy, 10024
- Zatím nenabíráme
- Neway Fertility
-
-
Oregon
-
Portland, Oregon, Spojené státy, 97205
- Zatím nenabíráme
- ORM Fertility
-
-
Washington
-
Kirkland, Washington, Spojené státy, 98034
- Zatím nenabíráme
- Poma Fertility
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Páry podstupující IVF, ve kterých je muži 40 let nebo starší
- Příbuzenské páry
- Pacienti se známou genetickou mutací
Kritéria vyloučení:
- Pacientky s nízkou ovariální rezervou (< 10 folikulů nebo FSH>10, AMH <1).
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
---|---|
Věk >18 let
Studie bude porovnávat embrya od >50 párů a jejich vzorky embryí označené jako nevhodné pro přenos od neidentifikovaných párů s požadovaným datem narození.
|
Tento projekt navrhuje testování kohorty výzkumných embryí za účelem stanovení klíčových parametrů pro amplifikovaná trofektodermální bioptická embrya s použitím minimální hloubky požadované pro sekvenování genomu (> hloubka 30x na bázi). Zbývající tkáň embrya bude sekvenována celým genomem, aby byly výsledky ověřeny biopsie.
Analýza bude provedena pomocí trojitého testování každého embrya navíc k DNA z genetického rodiče, aby se usnadnilo odvození rychlosti de novo mutací.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Míra de novo mutací
Časové okno: 6. měsíc
|
Metriky pro vyšetřování zahrnují: čistá čtení, čisté báze (Mp), rychlost mapování, jedinečná rychlost, míra duplicit, míra neshody, průměrná hloubka sekvenování, poměr Ti/Tv (přechod/přeměna), míra skutečně pozitivních výsledků, míra falešně pozitivních výsledků, falešně negativní četnost, která umožňuje odvodit četnost de novo mutací.
|
6. měsíc
|
Variantní patogenita, zygozita a způsob dědičnosti
Časové okno: 6. měsíc
|
Variantní patogenita; zygozita a způsob dědičnosti budou posouzeny a zdokumentovány pro validaci variant volání pro dědičné a nedědičné varianty.
Budou prozkoumány údaje o sekvenování z kohorty embryí s použitím rodičovských genomů jako validační reference.
Zpočátku se toto zaměří na jednonukleotidové polymorfismy (SNP) a malé inzerce/delece (Indels).
|
6. měsíc
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Nicholas Murphy, PhD, GenEmbryomics Pty. Ltd
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- RP-GE_02
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Sekvenování genomu embryí
-
Sequenom, Inc.Columbia UniversityUkončeno
-
First Affiliated Hospital Xi'an Jiaotong UniversityNábor
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie
-
Peking University First HospitalNáborRenální buněčný karcinom | VHL syndromČína
-
Shanghai Jiao Tong University School of MedicineThe First Affiliated Hospital of Nanchang University; The Affiliated Hospital... a další spolupracovníciNáborAutoimunitní gastritidaČína
-
Tianjin Medical University Second HospitalNeznámýSolidní nádor, dospělýČína
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Commissariat A L'energie Atomique; Imagine InstituteDokončeno
-
Helse-Bergen HFUniversity Hospital of North Norway; Helse FordeDokončenoVývojová dysplazie kyčle
-
Francine Behar-CohenEmory University; University of Lausanne HospitalsDokončenoRhegmatogenní oddělení sítniceŠvýcarsko