Genom-Wide Association Study a beültethető kardioverter defibrillátor implantáció genofenotípusos kockázati rétegződésének céljával (ICDGPSS)

Ezt a klinikai vizsgálatot az Európai Innovációs Tanács (EIC) finanszírozásával hajtják végre az alap támogatásának jóváhagyása után, és szervezetünk Európai Útkereső Projektjének (Ref: HORIZON-EIC-2022-PATHFINDERCHALLENGES-01) része. A projekt klinikai vizsgálati lépése retrospektív, időbeli prospektív módon indul az ICD implantációs terápián átesett betegek fenotípusos (klinikai mérőfaktorok) adatainak összegyűjtésével. A vizsgálat eset-kontroll típusként történik, amelyben azokat a betegeket, akik a beültetést követő 6 hónapban nem kaptak sokkot, a kontrollcsoportba sorolják. Az Illumina® (San Diego, Kalifornia, Egyesült Államok) egy testreszabott és rendkívül specifikus kardiogenomikai panelt tervez és rendel meg, hogy szabványos készletként gyártsa le a szív- és érrendszeri fejlődéssel összefüggésbe hozható genetikai változatok összegyűjtésére irányuló kimerítő vizsgálatot követően. Az említett készlet tartalmazza a szabványos és validált technológiát, amely a rutin genetikai tesztek része, és amelyet az Illumina® includee gyárt. Opcióként azonban a gyártó egyedi készleteket tervez kutatási célokra úgy, hogy a kívánt változatlistákat ugyanazzal a technológiával szerzi meg. Ennek megfelelően a vizsgálatba bevont betegekből prospektív mintát vesznek (non-invazív nyálminta), hogy genetikai elemzést kapjanak az Illumina® Infinium Assay Microarray platformján, teljesen testreszabott 700 000 egynukleotidos polimorfizmus készlettel. Ennek a mintavételnek az eredménye adat lesz, és statisztikailag elemzik genom-szerte asszociációs vizsgálat (GWAS) módszerrel, figyelembe véve az 5x10-8 p. értéket, és minden fenotípusos paraméterhez társítják. Ennek megfelelően a tanulmány sokkal részletesebben fogja felmérni az ICD-s betegek genetikai kockázati rétegződését. Ezt az értékelést követően genofenotípusos statisztikai elemzést végeznek, hogy a két paramétert kombinálják, és egy képletet állítsanak elő az indikátortényezők pontozására az egyes esélyhányadosok alapján. Ennek megfelelően ezt az új skálázási formulát a vizsgálatunkban szereplő populáció véletlenszerű mintavételével tovább elemezzük, ellenőrizzük és validáljuk, mielőtt kijelentjük. Ezenkívül ez a tanulmány nemcsak a genetikai polimorfizmus jelenlegi klinikailag szignifikáns státuszának (a variáns patogenitása és jelentősége) javítását segíti elő, hanem új, nagy jelentőségű markereket is társíthat, amelyek közvetlenül felhasználhatók klinikai szűrésben, diagnózisban vagy klinikai megközelítésekben.