전신 경화증-ILD에서 고유한 병원성 대식세포 식별
높은 처리량 단일 세포 RNA-Seq를 사용하여 전신 경화증-ILD에서 고유한 병원성 대식세포 식별
연구 개요
상세 설명
최첨단 단일 세포 RNA-Seq 기술을 사용하여 이전에는 표준 RNA-Seq 및 마이크로어레이 기술을 사용하여 분석할 해상도가 부족한 폐의 SSc-ILD 신흥 병원성 세포 집단을 BAL 유체에서 식별합니다. 개별 세포의 전사체. 임상적으로 유의한 폐 섬유증이 있는 SSc 환자의 기관지폐포 세척액(BAL)에서 분리된 폐포 대식세포는 기준선과 등록 후 6개월에 연구되어 출현하는 전-섬유화 폐포 대식세포 집단의 존재와 지속성을 종단적으로 평가합니다.
SSc-ILD가 있는 피험자는 경피증 프로그램에서 모집됩니다. 우리는 2013 American College of Rheumatology(ACR) SSc 기준 및 임상적으로 관련된 SSc-간질 폐 질환을 충족하는 성인을 모집할 것입니다. 환자는 0개월과 6개월에 기관지폐포 세척으로 기관지경 검사를 받게 됩니다. 건강한 통제 과목은 건강을 보장하기 위해 인구 통계 및 기본 의료 양식을 작성합니다. 다양한 의료 시스템에서 또는 수동 차트 검토를 통해 환자 데이터를 집계 및 저장하도록 설계된 Northwestern에서 사용 중인 전자 데이터베이스인 Enterprise Data Warehouse에서 적절한 임상 데이터를 다운로드하고 이 프로젝트를 위해 특별히 생성된 RedCap 데이터베이스에 입력합니다. .
SSc 및 건강한 대조군에서 선택적 기관지경 검사 절차 동안 기관지경은 CT 스캐닝에 의해 안내되는 영향을 받는 폐 부분에 고정됩니다. 기관지경을 고정한 후 멸균된 0.09% 생리식염수 120ml를 주입합니다. 모든 후속 분취량은 풀링됩니다. 각 샘플링 동안 분석을 위해 최대 40-60mL의 BAL 유체를 얻을 수 있습니다. 폐포 대식세포는 형광 활성 세포 분류기(FACS) Aria III 기기에서 분류됩니다. 높은 처리량의 단일 세포 전사체(Drop-seq) 데이터는 Cell Ranger 파이프라인을 사용하여 Northwestern 고성능 컴퓨팅 클러스터에서 처리되고 수정된 AltAnalyze 파이프라인을 사용하여 후처리됩니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Illinois
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Chicago, Illinois, 미국, 60611
- Northwestern University
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
SSc-ILD를 가진 피험자는 Northwestern University Scleroderma 프로그램에서 모집됩니다.
노스웨스턴 커뮤니티에서 모집된 건강한 대조군 피험자.
설명
포함 기준:
- SSc 진단을 위한 2013 ACR 기준 충족
- ILD에 대한 방사선학적 증거가 있고 PFT에서 강제 폐활량 <70%
- 지난 2개월 동안 면역억제제를 복용하지 않았거나 최소 6개월 동안 10mg 이하의 안정적인 용량의 마이코페놀레이트 모페틸, 리툭시맙 또는 프레드니손을 복용했습니다.
제외 기준:
- 루푸스 또는 류마티스 관절염과 같은 중첩 증후군 진단
- 영어로 정보에 입각한 동의를 제공할 수 없음
- 현재 임신 또는 수유 중
- 현재 흡연자 또는 과거 흡연자(10갑년 이상)
- 백혈구감소증
- 빈혈증
- 조절되지 않는 울혈성 심부전, 차도가 없는 암, HIV 또는 만성 간 질환의 동반이환
- 지난 3개월 동안 알려진 또는 의심되는 감염
- BMI 30kg/m2 이상
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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SSc-ILD
SSc-ILD 피험자는 2013 American College of Rheumatology SSc 기준을 충족하고 전완 변형 Rodnan 피부 점수(mRSS) ≥1(진피 섬유증에 대한 검증된 반정량적 점수 시스템) 및 임상적으로 관련된 SSc 간질 폐를 가진 사람으로 정의됩니다. 질병(ILD).
ILD에 대한 방사선학적 증거가 있고 폐기능 검사(PFT)에서 강제 폐활량이 70% 미만인 경우 피험자는 ILD가 있는 것으로 정의됩니다.
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선택적 기관지경 검사 절차 중에 기관지경은 CT 스캐닝의 안내에 따라 영향을 받은 폐 부분에 고정됩니다.
관련된 경우 전방 세그먼트가 반환을 최대화하는 데 사용됩니다.
기관지경을 고정한 후 멸균된 0.09% 생리식염수 120ml를 주입합니다.
각 샘플링 동안 분석을 위해 최대 40-60mL의 BAL 유체를 얻을 수 있습니다.
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제어
Northwestern 지역 사회에서 모집된 건강한 통제 과목은 건강을 보장하기 위해 인구 통계 및 기본 의료 양식을 작성합니다.
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선택적 기관지경 검사 절차 중에 기관지경은 CT 스캐닝의 안내에 따라 영향을 받은 폐 부분에 고정됩니다.
관련된 경우 전방 세그먼트가 반환을 최대화하는 데 사용됩니다.
기관지경을 고정한 후 멸균된 0.09% 생리식염수 120ml를 주입합니다.
각 샘플링 동안 분석을 위해 최대 40-60mL의 BAL 유체를 얻을 수 있습니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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단일 세포 RNA-seq 분석
기간: 기준선 및 6개월
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단세포 RNA 시퀀싱으로 측정한 6개월째 폐포 대식세포 전사체의 변화
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기준선 및 6개월
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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