교정치료 중 타액의 마이크로바이옴과 면역원성
얼라이너와 멀티브래킷을 이용한 교정치료 시 구강내 마이크로바이옴의 변화와 타액의 면역원성 - 파일럿 연구
연구 개요
상세 설명
University Clinic of Dentistry Vienna 치과교정과의 성인 환자(18세 이상)는 동의 후 정의된 포함/제외 기준에 따라 이 파일럿 미생물 연구에 참여하도록 초대됩니다. 이 연구는 파일럿 프로젝트이므로 표본 크기 계산은 수행되지 않습니다. 20명의 환자는 Invisalign® 얼라이너로 치료를 받고 20명의 환자는 멀티브래킷 치료를 받게 됩니다. 이전의 미생물학적 연구는 설측 교정 치료가 구강 미생물총에 단기적인 영향을 미친다는 것을 보여주었습니다. 치과용 임플란트의 집락화에 대한 또 다른 미생물 연구에서도 임플란트 치료 시 세균 이동이 보고되었습니다.
모든 환자는 임상 기록이 수집되는 당일 구강 위생에 대한 지침을 받게 됩니다. 치료 계획이 환자에게 제시되는 날 플라크 지수는 숙련된 치열 교정 전문의가 평가합니다. 치료 시작을 위해 < 20%의 플라크 지수가 필요합니다. 교정치료를 시작하기 전날 T0 검체를 채취하여 치주지수를 평가하게 됩니다. 치주 탐침 깊이, 탐침 시 출혈, 플라크 지수(PI)를 포함한 임상 검사는 얼라이너 또는 브라켓 치료 시작 전(T0), 3개월 후(T1), 6개월 후에 수행됩니다. 미생물 샘플링은 프로토콜에 따라 자극된 타액 수집에 의해 수행됩니다. 타액 샘플은 -80°C의 극저온 튜브에 보관된 분취량으로 나뉩니다. 16S rDNA 유전자의 시퀀싱, 시퀀싱 분석 및 분류학 할당에 의한 미생물의 분자 검출은 비엔나 의과 대학의 진단 검사 의학과에서 수행됩니다.
16s rDNA 유전자의 시퀀싱 분석 및 타액 내 박테리아의 분류학적 할당을 통해 우리는 다양한 시점 사이에서 미생물 문/속의 가능한 이동을 밝힐 것으로 기대합니다. Metagenomic 연구는 일반적으로 길이가 약 1,500 염기쌍이고 보존된 영역 사이에 산재된 9개의 가변 영역을 포함하는 원핵생물 16S 리보솜 RNA 유전자(16S rRNA)를 분석하여 수행됩니다. 16S rRNA의 가변 영역은 다양한 미생물 집단에서 속 또는 종과 같은 계통발생학적 분류에 자주 사용됩니다.
DNA 추출:
상용 DNA 추출 키트와 비교하여 더 나은 정량 및 정성 결과로 인해 DNA는 수정된 CTAB SDS 클로로포름 기반 방법으로 분리됩니다. 기계적 분석은 proteinase K(Qiagen, Venlo, Netherlands)와 세제 SDS(sodium dodecyl sulfate) 및 CTAB(cetyltrimethylammonium bromide)를 첨가한 1mm 실리카 구체를 사용하여 수행됩니다. 추출 후 DNA 양은 dsDNA HS 키트(Life Technologies, Carlsbad, California) 및 NanoDrop 2000c 분광광도계(Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts)를 통해 Qubit® 2.0으로 결정됩니다. 또한 흡수율 A260/280 및 A260/230을 사용하여 DNA의 순도를 추정합니다.
메타게놈 분석:
샘플에 있는 박테리아 유기체의 전체 구성은 마이크로바이옴을 분석하여 평가됩니다. 따라서 MiSeq® 플랫폼(Illumina, San Diego, California)과 함께 높은 처리량 시퀀싱을 사용합니다. 16S rRNA 유전자의 가변 V3 및 V4 영역을 분석합니다. 계통발생학적 분류를 위해 세균 16S rRNA는 프라이머 27F(5'-CCT ACG GGN GGC WGC AG-3') 및 1391R(5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3')을 사용하여 증폭됩니다.
생물정보학적 분석:
Next Generation Sequencing 실행의 품질은 소프트웨어 FASTQC 0.11.4를 사용하여 평가됩니다. 품질이 낮은 베이스 제거는 Trimmomatic-0.35 소프트웨어로 수행됩니다. 시퀀스 분석 및 유사한 시퀀스를 클러스터(OTU)로 클러스터링하기 위해 UPARSE 파이프라인이 활용됩니다. 마이크로바이옴 데이터의 비교 및 통계 분석을 위해 우리는 RStudio(Team 2016)를 R 언어(R Development Core Team 2010) 및 다양한 R 패키지와 함께 플랫폼으로 사용할 것입니다.
연구 유형
등록 (예상)
단계
- 해당 없음
연락처 및 위치
연구 장소
-
-
-
Vienna, 오스트리아, 1090
- Medical University of Vienna
-
-
참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
설명
포함 기준:
- 클래스 I 골격 관계
- Normo-divergent Frankfort 하악 평면 각도
- Little's Index(Little 1975)에 따른 1~3 범위의 최소 하악 밀집
제외 기준:
- 흡연 습관
- 치은 변연 부근에 광범위한 치과 수복물의 존재
- 고정 브리지/크라운 또는 부분 의치의 존재
- 지난 1년 이내의 이전 치주 비수술적 치료(예: 전체 구강 소독, 사분면별 치료, 전체 구강 괴사 조직 제거)
- 지난 6개월 이내의 항생제, 스테로이드 또는 비스테로이드성 항염증제와 같은 약물.
- 치료 시작 전 플라크 지수 > 20% 당뇨병 임신
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 주 목적: 특수 증상
- 할당: 무작위화되지 않음
- 중재 모델: 병렬 할당
- 마스킹: 하나의
무기와 개입
참가자 그룹 / 팔 |
개입 / 치료 |
|---|---|
|
실험적: 인비절라인 치료
얼라이너 환자는 부정교합을 교정하기 위해 인비절라인® 얼라이너로 치료받게 됩니다.
|
부정교합은 교정 장치(고정식 또는 탈착식)로 치료합니다.
|
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활성 비교기: 자가 결찰 브라켓 치료
멀티 브라켓 환자는 자가 결찰 교정 브라켓으로 치료하게 됩니다.
|
부정교합은 교정 장치(고정식 또는 탈착식)로 치료합니다.
|
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
구강 마이크로바이옴의 변화
기간: 최대 6개월
|
dna sequencing을 통한 우식 유발 박테리아를 포함한 구강 미생물 군집의 박테리아
|
최대 6개월
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|
치주 매개변수의 변화
기간: 최대 6개월
|
플라크 지수
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최대 6개월
|
|
치주 매개변수의 변화
기간: 최대 6개월
|
프로빙 깊이
|
최대 6개월
|
|
치주 매개변수의 변화
기간: 최대 6개월
|
프로빙 중 출혈
|
최대 6개월
|
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
체외 구강 세포에 대한 타액의 면역원성
기간: 최대 2주
|
생존력의 변화
|
최대 2주
|
|
체외 구강 세포에 대한 타액의 면역원성
기간: 최대 2주
|
PCR을 통한 유전자 발현 변화
|
최대 2주
|
공동 작업자 및 조사자
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Klindworth A, Pruesse E, Schweer T, Peplies J, Quast C, Horn M, Glockner FO. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies. Nucleic Acids Res. 2013 Jan 7;41(1):e1. doi: 10.1093/nar/gks808. Epub 2012 Aug 28.
- Edgar RC. UPARSE: highly accurate OTU sequences from microbial amplicon reads. Nat Methods. 2013 Oct;10(10):996-8. doi: 10.1038/nmeth.2604. Epub 2013 Aug 18.
- Levrini L, Mangano A, Montanari P, Margherini S, Caprioglio A, Abbate GM. Periodontal health status in patients treated with the Invisalign((R)) system and fixed orthodontic appliances: A 3 months clinical and microbiological evaluation. Eur J Dent. 2015 Jul-Sep;9(3):404-410. doi: 10.4103/1305-7456.163218.
- Demling A, Demling C, Schwestka-Polly R, Stiesch M, Heuer W. Short-term influence of lingual orthodontic therapy on microbial parameters and periodontal status. A preliminary study. Angle Orthod. 2010 May;80(3):480-4. doi: 10.2319/061109-330.1.
- de Freitas AR, Silva TSO, Ribeiro RF, de Albuquerque Junior RF, Pedrazzi V, do Nascimento C. Oral bacterial colonization on dental implants restored with titanium or zirconia abutments: 6-month follow-up. Clin Oral Investig. 2018 Jul;22(6):2335-2343. doi: 10.1007/s00784-018-2334-0. Epub 2018 Jan 18.
- Haririan H, Andrukhov O, Bertl K, Lettner S, Kierstein S, Moritz A, Rausch-Fan X. Microbial analysis of subgingival plaque samples compared to that of whole saliva in patients with periodontitis. J Periodontol. 2014 Jun;85(6):819-28. doi: 10.1902/jop.2013.130306. Epub 2013 Oct 21.
- Ren Y, Vissink A. Cytokines in crevicular fluid and orthodontic tooth movement. Eur J Oral Sci. 2008 Apr;116(2):89-97. doi: 10.1111/j.1600-0722.2007.00511.x.
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (예상)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
기타 연구 ID 번호
- 1288/2019
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