Selvprøvetaking for studiet av COVID-19

3.1.1 Studiepopulasjon: Etterforskerne vil melde pasienter inn i en større klinisk valideringsstudie av iAMP®-testen mot gullstandarden (den CDC-anbefalte testen) inntil vi prospektivt har samlet inn totalt 100 positive tilfeller. Nåværende positivitet i regionen er omtrent 20 %, derfor vil det være behov for omtrent 500 prøver. Inklusjonskriterier er som følger: Pasienter over 18 år som presenterer for covid-19-testing, tåler nasofaryngeale vattpinner og kan følge instruksjoner for selvinnsamling. Ekskluderingskriterier er som følger: ute av stand til eller villige til å gi informert samtykke og/eller pålitelig kontaktinformasjon.

3.1.2 Klinisk besøk: Symptomatiske pasienter vil bli kontaktet av en studieleverandør som bruker PPE. Studien vil bli forklart og hvis pasienten samtykker, vil de bli samtykket. Pasienter vil få samtykke for bare de to nasofaryngeale vattpinneprøvene eller for alle fem vattpinneprøvene. Etter samtykke vil hver pasient gjennomgå testing med samtidig plassering av to nasofaryngeale vattpinner av en kliniker for storskala klinisk validering. En vil bli lagret tørt i et rør og en vil bli plassert i viralt oppsamlingsmedium. Pasienter som samtykker til selvprøvetakingsstudien vil bli ført til et privat område for innsamling av tre forskjellige prøver. Etter å ha mottatt skriftlige instruksjoner og sett en kort instruksjonsvideo, vil prøven i midten av turbinatet bli samlet inn av pasienten under tilsyn av en kliniker. Legen vil deretter forlate og pasienten vil selv samle inn prøver fra fremre nese og spytt. Alle prøver vil bli lagret tørt. Når pasienten returnerer prøvene til forskningskoordinatoren, vil de bli spurt om eventuelle bivirkninger eller uønskede hendelser fra midtturbinatprøven.

3.1.3 Laboratorietesting: En tørr vattpinne vil bli samlet inn fra to av de tre iAMP®-selvprøvestedene - mid-turbinate og anterior nares - og plassert i et hetteglass med proprietær buffer (heretter referert til som Sample Buffer A). For spytt vil en steril oppsamlingsbeger bli brukt til prøvetakingen, og prøvebuffer A tilsettes direkte til den sterile samlekoppen. Hver av de tre prøvene med tilsatt prøvebuffer A vil inkuberes ved romtemperatur i 15 minutter. En proprietær multipleksblanding (masterblanding) vil bli tilberedt i et reagensrør og 10 mikroliter av prøven fra hetteglasset (midt turbinat og nares) eller koppen (spytt) vil bli tilsatt reagensrøret. Prøverøret vil deretter plasseres i RT-PCR-maskinen og kjøres til analysen er fullført. Analysen vil bli resultatet som enten positiv, negativ eller ugyldig (testen skal gjentas), og resultatet sammenlignes med det anonymiserte resultatet av den nasofaryngeale testen med den anbefalte NAAT-analysen fra CDC.

Instruksjoner for forsøkspersoner om hvordan de skal samle vattpinnene på riktig måte fra hvert sted. [Bomullspinner bør flokkes og avsmalnes].

Midt-turbinat:

• Vask og tørk hendene grundig
• Ta en steril bomullspinne og hold den ved stilken i din dominerende hånd
• Åpne det tomme iAMP-oppsamlingsglasset og hold det i den andre hånden
• Vipp hodet bakover slik at haken er omtrent parallelt med bakken (~70º)
• Sett inn bomullspinnen til merket på stilken (en tomme eller ~2 cm) og roter bomullspinnen helt (360º) 3 ganger.
• Fjern pinnen og uten å berøre bomullspissen, gjenta prosessen på den andre siden med samme bomullspinne
• Fjern vattpinnen fra nesen, ikke berør bomullspissen, og plasser vattpinnen, bomullspissen først, inn i hetteglasset
• Bryt av den øvre stammen på bomullspinnen
• Sett lokket på hetteglasset, og lukk det godt
• Gi det lukkede hetteglasset til forskningspersonellet

Fremre nares:

• Vask og tørk hendene grundig
• Ta en steril bomullspinne og hold den ved stilken i din dominerende hånd
• Åpne det tomme iAMP®-oppsamlingsglasset og hold det i den andre hånden
• Sett bomullspinnen inn i det ene neseboret helt til bomullspissen ikke lenger er synlig (~0,5 tommer eller 1 cm)
• Roter den helt inn i nesen (360º) 3 ganger og la den ligge i 10-15 sekunder
• Fjern vattpinnen og uten å berøre bomullspissen, gjenta prosessen i det andre neseboret, sett bare inn bomullspinnen igjen til bomullspissen ikke lenger er synlig, roter den 3 ganger og la den stå på plass i 10-15 sekunder
• Fjern pinnen, ikke berør bomullspissen, og plasser pinnen, bomullspissen først, inn i hetteglasset
• Bryt av den øvre stammen på bomullspinnen
• Sett lokket på hetteglasset, og lukk det godt
• Gi det lukkede hetteglasset til forskningspersonellet

Spytt:

• Ikke spis, drikk, røyk eller tyg tyggegummi innen 30 minutter etter innsamling
• Ta en steril urinkopp og spytt gjentatte ganger i den til det er 2-3 milliliter væske (unntatt bobler). Se bildet nedenfor for eksempel på mengden spytt som trengs
• Hold innsiden av koppen steril ved IKKE å plassere noe (fingre, gjenstander osv.) i koppen
• Når tilstrekkelig mengde spytt er samlet, setter du hetten på toppen av koppen og lukker den godt
• Gi lukket kopp til forskningspersonell

3.1.4 Statistisk begrunnelse Forutsatt at 20 % av prøvene testet med NAAT-analysen vil være COVID-19-positive, vil en studie med 500 påfølgende prøver gi 100 COVID-19-tilfeller oppdaget av NAAT-analysen. Denne studien vil være i stand til å estimere 95 % konfidensintervall (CI) for sensitivitet og spesifisitet angitt i tabellen nedenfor for sann sensitivitet og spesifisitet som varierer fra 50 % til 95 %. Presisjonen forbedres jo lenger sensitiviteten og spesifisiteten avviker fra 50 %.

Tabell 1: 95 % konfidensintervaller for påvisning av sensitivitet og spesifisitet Sann sensitivitet Sensitivitet 95 % KI Sann spesifisitet spesifisitet 95 % KI 50 % 39,8 % - 60,2 % 50 % 45,0 % - 55,0 % 70 % 600 % 70 % - 700 % - 700 %. 74,5 % 90 % 82,4 % - 95,1 % 90 % 86,6 % - 92,8 % 95 % 88,7 % - 98,4 % 95 % 92,3 % - 96,9 %

3.1.5 Risikoer/sikkerhet Den eneste risikoen ved denne studien er den ekstra eksponeringen av laboratoriepersonellet som utfører analysen. Alle involverte laboratorier er opplært i å håndtere smittestoffer som COVID-19. Alle standard forholdsregler vil bli brukt for håndtering av prøvene, inkludert alikvotering av prøver i en Biosafety-hette og bruk av personlig verneutstyr. Pasientens konfidensialitet vil bli sikret ved anonymisering av pasientprøver som tidligere godkjent av MCW IRB.

3.1.6 Analyse. Sensitivitet og spesifisitet vil bli estimert for hver iAMP®-test, samt tilsvarende 95 % eksakte konfidensintervaller ved å bruke NAAT-analysen som referansestandard.

3.1.7 Potensielle kliniske begrensninger

1. Alternative anatomiske steder vil ha lavere sensitivitet enn nasofaryngeale vattpinner. Det er mulig at selvinnsamlede vattpinner vil ha betydelig lavere sensitivitet enn nasofaryngeale vattpinner. Dette er usannsynlig fordi virusmengden med dette nye viruset er veldig høy
2. Forsøkspersoner kan nekte å få tatt flere vattpinner. Pasienter kan nekte å gi 5 prøver. Siden de selvinnsamlede nettstedene neppe vil forårsake ubehag, forventer vi at de fleste deltakerne vil godta studiedeltakelse. Selv om mange pasienter ikke takker ja til å delta er det 700 pasienter per dag som har symptomer som en stor pool av potensielle deltakere som vil gjøre det mulig å nå målet vårt. Etterforskerne må kanskje fortsette påmeldingen til det er 100 selvinnhentede COVID-19+-personer hvis noen forsøkspersoner nekter ytterligere tester.

3.2 Spesifikt mål 2. Evaluere forekomsten av uønskede hendelser i en selvinnsamlet prøve med midtturbinat. I henhold til bruksanvisningen (IFU) kreves det at vattpinner med mellomturbiner samles inn under medisinsk tilsyn,13 som CDC forsterker. Det har vært flere studier som har vist at prøver i midten av turbinene er effektive for påvisning av andre luftveissykdommer.14-17 Siden mid-turbinate samling kan ha høyere sensitivitet enn anterior nares eller spytttesting, er det viktig å demonstrere at det trygt kan samles uten klinisk tilsyn. Selv om noen pasienter kan være i stand til å utføre en mid-turbinate-innsamling via et telehelsebesøk, vil dette være en barriere for bred oppskalering. Dermed vil etterforskerne tillate pasienter å selv samle inn en mid-turbinate prøve med en oppsamlingsprøve. Vaskepinnen vil ha en indikatorlinje som signaliserer gjennomsnittlig lengde for å nå midt-turbinatområdet hos voksne (omtrent 1 tomme eller 2 cm). Helsepersonell vil deretter evaluere pasienten for eventuelle uønskede hendelser knyttet til pasientens egeninnsamling, for eksempel smerte og/eller blødning. Hvis forekomsten av uønskede hendelser er fraværende eller svært lav (mindre enn 5 %) og sensitiviteten til den midt-turbinate prøven er overlegen de fremre nesene, kan pasienter få lov til å prøve sin egen midt-turbinate region uten medisinsk tilsyn. Andelen deltakere som opplever hver type uønsket hendelse vil bli estimert sammen med et tilsvarende 95 % eksakt konfidensintervall.

4.0 Oppsummering Covid-19-pandemien har skapt en global krise som påvirker alle sektorer i samfunnet. For å redusere de katastrofale økonomiske og helsemessige konsekvensene av dette viruset, vil tilgjengeligheten av trygge, rimelige og pålitelige tester være nødvendig. Dette prosjektet tar sikte på å studere selvinnsamlingen av en rimelig, rask test (iAMP®) i tre anatomiske områder - mid-turbinate, nares og spytt - som, hvis validert, kan bidra til å gjøre utbredt testing en reell mulighet. Det sekundære målet er å vise at alle disse områdene trygt kan samles inn selv uten behov for klinikertilsyn. Redusere barrierer for testing og behandling av Covid-19 vil bidra til å dempe denne krisen og gi mulighet for tilbakeføring til normale aktiviteter.