Itsenäyte COVID-19-tutkimusta varten

3.1.1 Tutkimuspopulaatio: Tutkijat ottavat potilaat mukaan laajempaan iAMP®-testin kliiniseen validointitutkimukseen kultastandardia vastaan ​​(CDC:n suosittelema testi), kunnes olemme keränneet yhteensä 100 positiivista tapausta. Tällä hetkellä alueen positiivisuus on noin 20 %, joten näytettä tarvitaan noin 500. Sisällyttämiskriteerit ovat seuraavat: Yli 18-vuotiaat potilaat, jotka saapuvat COVID-19-testaukseen, sietävät nenänielun vanupuikkoja ja pystyvät noudattamaan itsekeräämisohjeita. Poissulkemiskriteerit ovat seuraavat: ei pysty tai halua antaa tietoon perustuvaa suostumusta ja/tai luotettavia yhteystietoja.

3.1.2 Kliininen käynti: Oireisiin potilaisiin tulee henkilönsuojaimia käyttävä tutkimuksen suorittaja. Tutkimus selitetään ja jos potilas suostuu, hänelle annetaan suostumus. Potilaat voivat antaa suostumuksensa vain kahteen nenänielun vanupuikkoon tai kaikkiin viiteen vanupuikkoon. Suostumuksen jälkeen jokaiselle potilaalle tehdään testaus ja kliinikko asettaa samanaikaisesti kaksi nenänielun vanupuikkoa laajamittaista kliinistä validointia varten. Yksi säilytetään kuivana putkessa ja toinen asetetaan viruksenkeräysalustaan. Potilaat, jotka suostuvat itsenäytteenottotutkimukseen, viedään yksityiselle alueelle kolmen eri näytteen keräämistä varten. Saatuaan kirjalliset ohjeet ja katsottuaan lyhyen ohjevideon, potilas ottaa näytteen puolivälissä kliinikon valvonnassa. Lääkäri lähtee sitten ja potilas ottaa itse näytteitä anteriorisista naruista ja syljestä. Kaikki näytteet säilytetään kuivana. Kun potilas palauttaa näytteet tutkimuskoordinaattorille, häneltä kysytään mahdollisista sivuvaikutuksista tai haitallisista tapahtumista keskivaiheen näytteestä.

3.1.3 Laboratoriotestit: Kuiva vanupuikko otetaan kahdesta kolmesta iAMP®-omanäytteenottopaikasta - keskiturbina ja anteriorinen naru - ja laitetaan injektiopulloon, jossa on patentoitu puskuri (jäljempänä näytepuskuri A). Sylkeä varten käytetään steriiliä keräyskuppia näytteenottoa varten, ja näytepuskuri A lisätään suoraan steriiliin keräyskuppiin. Kutakin kolmesta näytteestä, joihin on lisätty näytepuskuri A, inkuboidaan huoneenlämpötilassa 15 minuuttia. Koeputkeen valmistetaan patentoitu multipleksiseos (master mix) ja 10 mikrolitraa näytettä injektiopullosta (turbinate ja nares) tai kupista (sylki) lisätään koeputkeen. Koeputki asetetaan sitten RT-PCR-laitteeseen ja ajetaan testin loppuun asti. Analyysi on joko positiivinen, negatiivinen tai virheellinen (testi toistetaan) ja tulosta verrataan nenänielun testiajon anonymisoituun tulokseen CDC:n suosittelemalla NAAT-määrityksellä.

Ohjeita koehenkilöille siitä, kuinka vanupuikko otetaan oikein kustakin paikasta. [Puupupuikkoja tulee parvitella ja suippentaa].

Keskiturbinaatti:

• Pese ja kuivaa kädet huolellisesti
• Ota steriili pumpulipuikko ja pidä sitä varresta hallitsevassa kädessäsi
• Avaa tyhjä iAMP-keräyspullo ja pidä sitä toisessa kädessä
• Kallista päätäsi taaksepäin niin, että leuka on suunnilleen samansuuntainen maan kanssa (~70º)
• Työnnä vanupuikko varren merkkiin (yksi tuuma tai ~2 cm) ja käännä vanupuikko kokonaan (360º) 3 kertaa.
• Poista vanupuikko ja toista prosessi toisella puolella samalla pumpulipuikolla koskettamatta pumpun kärkeä
• Poista vanupuikko nenästä, älä koske pumpulikärkeen ja aseta vanupuikko, vanupuikko edellä, injektiopulloon
• Katkaise vanupuikon ylävarsi
• Kiinnitä korkki injektiopulloon ja sulje se kunnolla
• Anna suljettu pullo tutkimushenkilöstölle

Etumaiset nenät:

• Pese ja kuivaa kädet huolellisesti
• Ota steriili pumpulipuikko ja pidä sitä varresta hallitsevassa kädessäsi
• Avaa tyhjä iAMP®-keräyspullo ja pidä sitä toisessa kädessä
• Työnnä pumpulipuikko yhteen sieraimeen, kunnes vanupuikko ei enää näy (~0,5 tuumaa tai 1 cm)
• Pyöritä sitä nenän sisällä kokonaan (360º) 3 kertaa ja jätä se paikalleen 10-15 sekunniksi
• Poista vanupuikko ja koskematta pumpun kärkeen, toista toimenpide toisessa sieraimessa, työntämällä vanupuikko uudelleen vain, kunnes vanupuikko ei ole enää näkyvissä, kiertämällä sitä 3 kertaa ja jättämällä sen paikalleen 10-15 sekunniksi.
• Poista vanupuikko, älä koske pumpulikärkeen ja aseta vanupuikko, vanupuikko ensin, injektiopulloon
• Katkaise vanupuikon ylävarsi
• Kiinnitä korkki injektiopulloon ja sulje se kunnolla
• Anna suljettu pullo tutkimushenkilöstölle

Sylki:

• Älä syö, juo, polta tai pureskele purukumia 30 minuutin kuluessa keräämisestä
• Ota steriili virtsakuppi ja sylje siihen toistuvasti, kunnes nestettä on 2-3 millilitraa (pois lukien kuplat). Katso alla olevasta kuvasta esimerkiksi tarvittava syljen määrä
• Pidä kupin sisäpuoli steriilinä ÄLÄ laita mitään (sormia, esineitä jne.) kuppiin
• Kun riittävä määrä sylkeä on kerätty, aseta korkki kupin päälle ja sulje se kunnolla
• Anna suljettu kuppi tutkimushenkilöstölle

3.1.4 Tilastollinen perustelu Olettaen, että 20 % NAAT-määrityksellä testatuista näytteistä on COVID-19-positiivisia, 500 peräkkäisen näytteen tutkimus tuottaa 100 NAAT-määrityksellä havaittua COVID-19-tapausta. Tämä tutkimus pystyy arvioimaan 95 %:n luottamusvälin (CI) herkkyydelle ja spesifisyydelle, joka on osoitettu alla olevassa taulukossa todelliselle herkkyydelle ja spesifisyydelle, joka vaihtelee välillä 50 % - 95 %. Tarkkuus paranee mitä enemmän herkkyys ja spesifisyys eroavat 50 %:sta.

Taulukko 1: 95 %:n luottamusvälit herkkyyden ja spesifisyyden havaitsemiseen Todellinen herkkyys Herkkyys 95 % CI Todellinen spesifisyys Spesifisyys 95 % CI 50 % 39,8 % - 60,2 % 50 % 45,0 % - 55,0 % 70 % 60,0 % - 7 % -8 % - .2 74,5 % 90 % 82,4 % - 95,1 % 90 % 86,6 % - 92,8 % 95 % 88,7 % - 98,4 % 95 % 92,3 % - 96,9 %

3.1.5 Riskit/Turvallisuus Tämän tutkimuksen ainoa riski on määritystä suorittavan laboratoriohenkilöstön ylimääräinen altistuminen. Kaikki mukana olevat laboratoriotyöntekijät ovat koulutettuja käsittelemään tartunnanaiheuttajia, kuten COVID-19. Kaikkia tavanomaisia ​​varotoimia noudatetaan näytteiden käsittelyssä, mukaan lukien näytteiden jakaminen alikvooteihin Biosafety-kuvussa ja henkilökohtaisten suojavarusteiden käyttö. Potilaiden luottamuksellisuus varmistetaan anonymisoimalla potilasnäytteet MCW:n IRB:n aiemmin hyväksymällä tavalla.

3.1.6 Analyysi. Herkkyys ja spesifisyys arvioidaan jokaiselle iAMP®-testille sekä vastaavat 95 %:n tarkka luottamusväli käyttämällä NAAT-määritystä vertailustandardina.

3.1.7 Mahdolliset kliiniset rajoitukset

1. Vaihtoehtoisten anatomisten kohtien herkkyys on pienempi kuin nenänielun vanupuikolla. On mahdollista, että itse kerätyillä vanupuikoilla on huomattavasti pienempi herkkyys kuin nenänielun vanupuikoilla. Tämä on epätodennäköistä, koska tämän uuden viruksen aiheuttama viruskuorma on erittäin korkea
2. Koehenkilöt voivat kieltäytyä ottamasta useita vanupuikkoja. Potilaat voivat kieltäytyä antamasta 5 näytettä. Koska itse kerätyt sivustot eivät todennäköisesti aiheuta epämukavuutta, odotamme useimpien osallistujien suostuvan tutkimukseen. Vaikka monet potilaat eivät suostu osallistumaan, on 700 potilasta päivässä, joilla on oireita, ja suuri joukko mahdollisia osallistujia mahdollistaa tavoitteemme saavuttamisen. Tutkijoiden on ehkä jatkettava ilmoittautumista, kunnes on 100 itse kerättyä COVID-19+ -potilasta, jos jotkut tutkittavat kieltäytyvät lisätesteistä.

3.2 Erityinen tavoite 2. Arvioi haittatapahtumien ilmaantuvuus itse kerätyssä keskiturbinaattinäytteessä. Käyttöohjeen (IFU) mukaan keskiturbiinipuikot on kerättävä lääkärin valvonnassa,13 mitä CDC vahvistaa. On tehty useita tutkimuksia, jotka ovat osoittaneet, että keskiturbiininäytteet ovat tehokkaita muiden hengitystiesairauksien havaitsemisessa.14-17 Koska turbinate-keräys voi olla herkempi kuin anteriorinen naru tai sylki, on tärkeää osoittaa, että se voidaan kerätä turvallisesti ilman kliinistä valvontaa. Vaikka jotkut potilaat voivat pystyä suorittamaan keskivaiheen keräyksen etäterveyskäynnin kautta, tämä olisi este laajalle laajentamiselle. Siten tutkijat antavat potilaille mahdollisuuden kerätä itse keskeltä turbinoitua näyte keräilypuikolla. Vanupuikolla on indikaattoriviiva, joka ilmaisee keskimääräisen pituuden saavuttaakseen keskimmäisen turbiinialueen aikuisilla (noin 1 tuuma tai 2 cm). Terveydenhuollon tarjoaja arvioi sitten potilaan mahdollisten potilaan itsensä keräämiseen liittyvien haittatapahtumien, kuten kivun ja/tai verenvuodon, varalta. Jos haittatapahtumien ilmaantuvuus puuttuu tai on erittäin alhainen (alle 5 %) ja keskiturbiininäytteen herkkyys on parempi kuin anterioristen narujen herkkyys, potilaiden voitaisiin sallia ottaa näytteitä omalta turbinate-alueeltaan ilman lääkärin valvontaa. Kunkin tyyppisen haittatapahtuman kokeneiden osallistujien osuus arvioidaan yhdessä vastaavan 95 %:n tarkan luottamusvälin kanssa.

4.0 Yhteenveto Covid-19-pandemia on luonut maailmanlaajuisen kriisin, joka vaikuttaa kaikkiin yhteiskunnan sektoreihin. Tämän viruksen katastrofaalisten taloudellisten ja terveysvaikutusten vähentämiseksi tarvitaan turvallisia, edullisia ja luotettavia testauksia. Tämän projektin tavoitteena on tutkia edullisen, nopean testin (iAMP®) itsekeräämistä kolmella anatomisella alueella - keskiturbina, nares ja sylki - jotka validoituna voivat auttaa tekemään laajasta testauksesta todellisen mahdollisuuden. Toissijaisena tavoitteena on osoittaa, että kaikki nämä alueet voidaan kerätä turvallisesti itse ilman kliinikon valvontaa. Covid-19-testauksen ja -käsittelyn esteiden vähentäminen auttaa lieventämään tätä kriisiä ja mahdollistaa paluuta normaaliin toimintaan.