Selvprøvetagning til undersøgelse af COVID-19

3.1.1 Undersøgelsespopulation: Efterforskerne vil indskrive patienter i et større klinisk valideringsstudie af iAMP®-testen mod guldstandarden (den CDC-anbefalede test), indtil vi prospektivt har indsamlet i alt 100 positive tilfælde. Aktuel positivitet i regionen er cirka 20 %, derfor vil der være behov for cirka 500 prøver. Inklusionskriterier er som følger: Patienter ældre end 18, der præsenterer sig for COVID-19-test, i stand til at tolerere nasopharyngeale podninger og i stand til at følge instruktionerne til selvindsamling. Eksklusionskriterier er som følger: ude af stand til eller uvillig til at give informeret samtykke og/eller pålidelige kontaktoplysninger.

3.1.2 Klinisk besøg: Symptomatiske patienter vil blive kontaktet af en undersøgelsesudbyder, der bærer PPE. Undersøgelsen vil blive forklaret, og hvis patienten er enig, vil de få samtykke. Patienter vil få lov til at give samtykke til kun de to nasopharyngeale podninger eller for alle fem podninger. Efter samtykke vil hver patient gennemgå en test med samtidig anbringelse af to nasopharyngeale podninger af en kliniker til storstilet klinisk validering. En vil blive opbevaret tørt i et rør, og en vil blive placeret i viralt indsamlingsmedium. Patienter, der giver samtykke til selvprøvetagningen, vil blive ført til et privat område for indsamling af tre forskellige prøver. Efter at have modtaget skriftlige instruktioner og set en kort instruktionsvideo, vil den midterste turbinatprøve blive indsamlet af patienten under opsyn af en kliniker. Klinikeren vil derefter gå, og patienten vil selv indsamle prøver fra den forreste næse og spyt. Alle prøver vil blive opbevaret tørt. Når patienten returnerer prøverne til forskningskoordinatoren, vil de blive spurgt om eventuelle bivirkninger eller uønskede hændelser fra den midterste turbinatprøve.

3.1.3 Laboratorietest: En tør podepind vil blive indsamlet fra to af de tre iAMP®-selvprøvesteder - mid-turbinate og anterior nares - og anbragt i et hætteglas med den proprietære buffer (herefter benævnt prøvebuffer A). Til spyt vil der blive brugt en steril opsamlingsbæger til prøvetagningen, og prøvebuffer A vil blive tilføjet direkte til den sterile opsamlingsbæger. Hver af de tre prøver med tilsat prøvebuffer A vil inkubere ved stuetemperatur i 15 minutter. En proprietær multiplexblanding (masterblanding) vil blive tilberedt i et reagensglas, og 10 mikroliter af prøven fra hætteglasset (midt turbinat og nares) eller koppen (spyt) vil blive tilsat til reagensglasset. Reagensglasset placeres derefter i RT-PCR-maskinen og køres til analysen er afsluttet. Analysen vil blive resultatet som enten positiv, negativ eller ugyldig (testen skal gentages), og resultatet sammenlignes med det anonymiserede resultat af den nasopharyngeale testkørsel med den CDC anbefalede NAAT-analyse.

Instruktioner til forsøgspersoner om, hvordan man korrekt indsamler podepindene fra hvert sted. [Vatpinde bør flokkes og tilspidses].

Midt-turbinat:

• Vask og tør hænderne grundigt
• Tag en steril vatpind og hold den ved stilken i din dominerende hånd
• Åbn det tomme iAMP-opsamlingsglas, og hold det i den anden hånd
• Vip dit hoved tilbage, så hagen er nogenlunde parallel med jorden (~70º)
• Indsæt vatpinden til mærket på stilken (en tomme eller ~2 cm), og drej vatpinden helt (360º) 3 gange.
• Fjern vatpinden og gentag processen på den anden side uden at røre ved vatpinden med den samme vatpind
• Fjern vatpinden fra næsen, rør ikke ved vatspidsen, og anbring vatpinden med vatspidsen først i hætteglasset
• Bræk den øverste stilk af vatpinden af
• Sæt låget på hætteglasset, og luk det forsvarligt
• Giv det lukkede hætteglas til forskningspersonalet

Forreste nares:

• Vask og tør hænderne grundigt
• Tag en steril vatpind og hold den ved stilken i din dominerende hånd
• Åbn det tomme iAMP®-opsamlingsglas, og hold det i den anden hånd
• Indsæt vatpinden i det ene næsebor, lige indtil vatspidsen ikke længere er synlig (~0,5 tommer eller 1 cm)
• Drej det helt inde i næsen (360º) 3 gange og lad det sidde i 10-15 sekunder
• Fjern vatpinden og uden at røre vatspidsen gentag processen i det andet næsebor, indfør kun vatpinden igen indtil vatspidsen ikke længere er synlig, drej den 3 gange og lad den sidde i 10-15 sekunder
• Fjern vatpinden, rør ikke ved vatspidsen, og anbring vatpinden med vatspidsen først i hætteglasset
• Bræk den øverste stilk af vatpinden af
• Sæt låget på hætteglasset, og luk det forsvarligt
• Giv det lukkede hætteglas til forskningspersonalet

Spyt:

• Spis, drik, ryg eller tyg ikke tyggegummi inden for 30 minutter efter indsamlingen
• Tag en steril urinkop og spyt gentagne gange ned i den, indtil der er 2-3 milliliter væske (ekskl. bobler). Se billedet nedenfor for eksempel på den nødvendige mængde spyt
• Hold indersiden af ​​koppen steril ved IKKE at placere noget (fingre, genstande osv.) i koppen
• Når en tilstrækkelig mængde spyt er opsamlet, skal du placere hætten på toppen af ​​koppen og lukke den forsvarligt
• Giv en lukket kop til forskningspersonalet

3.1.4 Statistisk begrundelse Hvis det antages, at 20 % af prøverne, der er testet med NAAT-analysen, vil være COVID-19-positive, vil en undersøgelse med 500 på hinanden følgende prøver give 100 COVID-19-tilfælde, som er påvist af NAAT-analysen. Denne undersøgelse vil være i stand til at estimere 95 % konfidensintervallet (CI) for sensitivitet og specificitet angivet i tabellen nedenfor for ægte sensitivitet og specificitet i området fra 50 % til 95 %. Præcisionen forbedres, jo længere sensitiviteten og specificiteten afviger fra 50 %.

Tabel 1: 95 % konfidensintervaller til påvisning af sensitivitet og specificitet Sand Sensitivitet Sensitivitet 95 % CI Ægte specificitet Specificitet 95 % CI 50 % 39,8 % - 60,2 % 50 % 45,0 % - 55,0 % 70 % 60 % - 70 % - 70 % - 70 % - 70 %. 74,5 % 90 % 82,4 % - 95,1 % 90 % 86,6 % - 92,8 % 95 % 88,7 % - 98,4 % 95 % 92,3 % - 96,9 %

3.1.5 Risici/sikkerhed Den eneste risiko ved denne undersøgelse er den yderligere eksponering af laboratoriepersonalet, der udfører analysen. Alle involverede laboratorier er uddannet i at håndtere smitsomme stoffer såsom COVID-19. Alle standard forholdsregler vil blive brugt til håndteringen af ​​prøverne, inklusive alikvotering af prøver i en Biosafety-hætte og brug af personligt beskyttelsesudstyr. Patientfortrolighed vil blive sikret ved anonymisering af patientprøver som tidligere godkendt af MCW IRB.

3.1.6 Analyse. Sensitivitet og specificitet vil blive estimeret for hver iAMP®-test samt tilsvarende 95 % nøjagtige konfidensintervaller ved brug af NAAT-assayet som referencestandard.

3.1.7 Potentielle kliniske begrænsninger

1. Alternative anatomiske steder vil have lavere følsomhed end nasopharyngeale podninger. Det er muligt, at de selvopsamlede podninger vil have væsentlig lavere følsomhed end nasopharyngeale podninger. Dette er usandsynligt, fordi virusmængden med denne nye virus er meget høj
2. Forsøgspersoner kan nægte at få taget flere podninger. Patienter kan nægte at give 5 prøver. Da det er usandsynligt, at de selvindsamlede sider vil forårsage ubehag, forventer vi, at de fleste deltagere vil acceptere at deltage i undersøgelsen. Selvom mange patienter ikke takker ja til at deltage, er der 700 patienter om dagen, der har symptomer, som en stor pulje af potentielle deltagere vil gøre det muligt at nå vores mål. Efterforskerne skal muligvis fortsætte tilmeldingen, indtil der er 100 selvindsamlede COVID-19+-personer, hvis nogle forsøgspersoner nægter yderligere tests.

3.2 Specifikt formål 2. Evaluer forekomsten af ​​uønskede hændelser i en selvopsamlet midt-turbinatprøve. I henhold til brugsanvisningen (IFU) skal podninger med mellemturbinater indsamles under medicinsk overvågning13, hvilket CDC forstærker. Der har været adskillige undersøgelser, der har vist, at prøver med midt-turbinat er effektive til påvisning af andre luftvejssygdomme.14-17 Da mid-turbinate-indsamling kan have højere følsomhed end anterior nares eller spyttest, er det vigtigt at demonstrere, at det sikkert kan opsamles uden klinisk overvågning. Selvom nogle patienter muligvis er i stand til at udføre en mid-turbinate-indsamling via et telesundhedsbesøg, ville dette være en barriere for bred opskalering. Således vil efterforskerne give patienterne mulighed for selv at indsamle en mid-turbinate prøve med en samling podepind. Podepinden vil have en indikatorlinje, der signalerer den gennemsnitlige længde for at nå midten af ​​turbinatområdet hos voksne (ca. 1 tomme eller 2 cm). Sygeplejersken vil derefter evaluere patienten for eventuelle uønskede hændelser relateret til patientens selvindsamling, såsom smerte og/eller blødning. Hvis forekomsten af ​​uønskede hændelser er fraværende eller meget lav (mindre end 5%), og følsomheden af ​​den midterste turbinatprøve er overlegen i forhold til de forreste nares, kan patienter få lov til at prøve deres egen midt-turbinate-region uden lægeligt tilsyn. Andelen af ​​deltagere, der oplever hver type uønskede hændelser, vil blive estimeret sammen med et tilsvarende 95 % nøjagtigt konfidensinterval.

4.0 Resumé Covid-19-pandemien har skabt en global krise, som påvirker alle samfundssektorer. For at mindske de katastrofale økonomiske og sundhedsmæssige konsekvenser af denne virus, vil tilgængeligheden af ​​sikre, billige og pålidelige tests være nødvendig. Dette projekt har til formål at studere selvindsamlingen af ​​en billig, hurtig test (iAMP®) i tre anatomiske områder - midtturbinatet, næsen og spyt - som, hvis det valideres, kan hjælpe med at gøre udbredt test til en reel mulighed. Det sekundære mål er at vise, at alle disse områder sikkert kan indsamles selv uden behov for klinikerens supervision. Reducerende barrierer for Covid-19-testning og -behandling vil bidrage til at afbøde denne krise og give mulighed for en tilbagevenden til normale aktiviteter.