Autocampionamento per lo studio di COVID-19

3.1.1 Popolazione dello studio: gli investigatori arruoleranno i pazienti in uno studio di convalida clinica più ampio del test iAMP® rispetto al gold standard (il test raccomandato dal CDC) fino a quando non avremo raccolto in modo prospettico un totale di 100 casi positivi. L'attuale positività in regione è di circa il 20%, quindi saranno necessari circa 500 prelievi. I criteri di inclusione sono i seguenti: Pazienti di età superiore ai 18 anni che si presentano per il test COVID-19, in grado di tollerare i tamponi nasofaringei e in grado di seguire le istruzioni per l'auto-raccolta. I criteri di esclusione sono i seguenti: impossibilità o non volontà di fornire il consenso informato e/o informazioni di contatto affidabili.

3.1.2 Visita clinica: i pazienti sintomatici verranno avvicinati da un fornitore dello studio che indossa DPI. Lo studio verrà spiegato e se il paziente è d'accordo, sarà acconsentito. I pazienti potranno acconsentire solo per i due tamponi rinofaringei o per tutti e cinque i tamponi. Dopo il consenso, ogni paziente verrà sottoposto a test con il posizionamento simultaneo di due tamponi rinofaringei da parte di un medico per la validazione clinica su larga scala. Uno verrà conservato asciutto in una provetta e uno verrà posto nel mezzo di raccolta virale. I pazienti che acconsentono allo studio di autocampionamento verranno portati in un'area riservata per il prelievo di tre diversi campioni. Dopo aver ricevuto istruzioni scritte e aver guardato un breve video didattico, il campione del turbinato medio verrà raccolto dal paziente sotto la supervisione di un medico. Il medico quindi se ne andrà e il paziente raccoglierà autonomamente campioni dalle narici anteriori e dalla saliva. Tutti i campioni saranno conservati asciutti. Quando il paziente restituisce i campioni al coordinatore della ricerca, gli verrà chiesto di eventuali effetti collaterali o eventi avversi dal campione a metà turbinato.

3.1.3 Test di laboratorio: un tampone asciutto verrà raccolto da due dei tre siti di autocampionamento iAMP® - turbinato medio e narici anteriori - e inserito in una fiala con il tampone proprietario (di seguito denominato Sample Buffer A). Per la saliva, verrà utilizzata una tazza di raccolta sterile per la raccolta del campione e il tampone del campione A verrà aggiunto direttamente alla tazza di raccolta sterile. Ciascuno dei tre campioni con l'aggiunta del tampone per campioni A incuberà a temperatura ambiente per 15 minuti. Una miscela multiplex brevettata (master mix) sarà preparata in una provetta e 10 microlitri del campione dalla fiala (turbinato medio e narici) o coppa (saliva) saranno aggiunti alla provetta. La provetta verrà quindi inserita nella macchina RT-PCR e fatta funzionare fino al completamento del test. Il test sarà risultato positivo, negativo o non valido (test da ripetere) e il risultato verrà confrontato con il risultato anonimo del test rinofaringeo eseguito con il test NAAT raccomandato dal CDC.

Istruzioni per i soggetti su come prelevare correttamente i tamponi da ogni sede. [I cotton fioc dovrebbero essere floccati e affusolati].

Mid-turbinato:

• Lavare e asciugare accuratamente le mani
• Prendi un batuffolo di cotone sterile e tienilo per il gambo con la mano dominante
• Apri la fiala di raccolta iAMP vuota e tienila nell'altra mano
• Inclina la testa all'indietro in modo che il mento sia più o meno parallelo al suolo (~70º)
• Inserisci il batuffolo di cotone fino al segno sullo stelo (un pollice o ~2 cm) e ruota completamente il bastoncino di cotone (360º) 3 volte.
• Rimuovi il tampone e senza toccare la punta di cotone, ripeti il ​​processo sull'altro lato con lo stesso batuffolo di cotone
• Rimuovere il tampone dal naso, non toccare la punta di cotone e inserire il tampone, prima la punta di cotone, nel flaconcino
• Rompere il gambo superiore del batuffolo di cotone
• Rimettere il tappo sul flaconcino, chiudendolo saldamente
• Consegnare la fiala chiusa al personale di ricerca

Narici anteriori:

• Lavare e asciugare accuratamente le mani
• Prendi un batuffolo di cotone sterile e tienilo per il gambo con la mano dominante
• Aprire la fiala di raccolta iAMP® vuota e tenerla nell'altra mano
• Inserisci il batuffolo di cotone in una narice fino a quando la punta di cotone non è più visibile (~ 0,5 pollici o 1 cm)
• Ruotalo completamente all'interno del naso (360º) 3 volte e lascialo in posizione per 10-15 secondi
• Rimuovere il tampone e senza toccare la punta del cotone, ripetere il processo nell'altra narice, inserendo nuovamente solo il batuffolo di cotone fino a quando la punta del cotone non è più visibile, ruotandolo 3 volte e lasciandolo in posizione per 10-15 secondi
• Rimuovere il tampone, non toccare la punta di cotone e inserire il tampone, prima la punta di cotone, nel flaconcino
• Rompere il gambo superiore del batuffolo di cotone
• Rimettere il tappo sul flaconcino, chiudendolo saldamente
• Consegnare la fiala chiusa al personale di ricerca

Saliva:

• Non mangiare, bere, fumare o masticare gomma nei 30 minuti successivi al prelievo
• Prendi una coppetta per urina sterile e sputa dentro ripetutamente finché non ci sono 2-3 millilitri di liquido (bolle escluse). Vedi l'immagine sotto per un esempio della quantità di saliva necessaria
• Mantenere sterile l'interno della coppetta NON inserendo nulla (dita, oggetti, ecc.) nella coppetta
• Una volta raccolta una quantità adeguata di saliva, posizionare il tappo sulla parte superiore della coppetta e chiuderla saldamente
• Dare la tazza chiusa al personale di ricerca

3.1.4 Giustificazione statistica Supponendo che il 20% dei campioni testati con il test NAAT sia positivo per COVID-19, uno studio di 500 campioni consecutivi produrrà 100 casi COVID-19 rilevati dal test NAAT. Questo studio sarà in grado di stimare l'intervallo di confidenza (IC) al 95% per la sensibilità e la specificità indicato nella tabella sottostante per la reale sensibilità e specificità che vanno dal 50% al 95%. La precisione migliora quanto più la sensibilità e la specificità differiscono dal 50%.

Tabella 1: Intervalli di confidenza al 95% per il rilevamento della sensibilità e della specificità Sensibilità reale Sensibilità IC 95% Specificità reale Specificità IC 95% 50% 39,8% - 60,2% 50% 45,0% - 55,0% 70% 60,0% - 78,8% 70% 65,2% - 74,5% 90% 82,4% - 95,1% 90% 86,6% - 92,8% 95% 88,7% - 98,4% 95% 92,3% - 96,9%

3.1.5 Rischi/Sicurezza L'unico rischio di questo studio è l'esposizione aggiuntiva del personale di laboratorio che esegue il test. Tutti i laboratori coinvolti sono addestrati alla manipolazione di agenti infettivi come il COVID-19. Verranno utilizzate tutte le precauzioni standard per la manipolazione dei campioni, compresa l'aliquotazione dei campioni in una cappa di biosicurezza e l'uso di dispositivi di protezione individuale. La riservatezza del paziente sarà assicurata dall'anonimizzazione dei campioni dei pazienti come precedentemente approvato dall'IRB MCW.

3.1.6 Analisi. La sensibilità e la specificità saranno stimate per ciascun test iAMP® così come i corrispondenti intervalli di confidenza esatti al 95% utilizzando il test NAAT come standard di riferimento.

3.1.7 Potenziali limitazioni cliniche

1. I siti anatomici alternativi avranno una sensibilità inferiore rispetto ai tamponi nasofaringei. È possibile che i tamponi autoprelevati abbiano una sensibilità significativamente inferiore rispetto ai tamponi nasofaringei. È improbabile che ciò accada perché la carica virale con questo nuovo virus è molto alta
2. I soggetti possono rifiutarsi di sottoporsi a più tamponi. I pazienti possono rifiutarsi di fornire 5 campioni. Poiché è improbabile che i siti raccolti autonomamente causino disagio, ci aspettiamo che la maggior parte dei partecipanti accetti di studiare la partecipazione. Anche se molti pazienti non accettano di partecipare, ci sono 700 pazienti al giorno che presentano sintomi, un ampio bacino di potenziali partecipanti che renderà possibile il raggiungimento del nostro obiettivo. Gli investigatori potrebbero dover continuare l'arruolamento fino a quando non ci saranno 100 soggetti COVID-19 + raccolti autonomamente se alcuni soggetti rifiutano ulteriori test.

3.2 Scopo specifico 2. Valutare l'incidenza di eventi avversi in un campione di turbinato medio raccolto autonomamente. Secondo le istruzioni per l'uso (IFU), i tamponi del mid-turbinate devono essere raccolti sotto controllo medico,13 che il CDC rafforza. Sono stati condotti numerosi studi che hanno dimostrato che i campioni del turbinato medio sono efficaci per il rilevamento di altre malattie respiratorie.14-17 Poiché la raccolta del turbinato medio può avere una sensibilità maggiore rispetto alle narici anteriori o al test della saliva, è importante dimostrare che può essere raccolta in modo sicuro senza supervisione clinica. Sebbene alcuni pazienti possano essere in grado di eseguire una raccolta del turbinato medio tramite una visita di telemedicina, ciò costituirebbe un ostacolo a un'ampia scalabilità. Pertanto, gli investigatori consentiranno ai pazienti di raccogliere autonomamente un campione di metà turbinato con un tampone di raccolta. Il tampone avrà una linea indicatrice che segnala la lunghezza media per raggiungere la regione del turbinato medio negli adulti (circa 1 pollice o 2 cm). L'operatore sanitario valuterà quindi il paziente per eventuali eventi avversi correlati all'autoraccolta del paziente, come dolore e/o sanguinamento. Se l'incidenza di eventi avversi è assente o molto bassa (meno del 5%) e la sensibilità del campione del turbinato medio è superiore a quella delle narici anteriori, i pazienti potrebbero essere autorizzati a campionare la propria regione del turbinato medio senza supervisione medica. La percentuale di partecipanti che hanno sperimentato ciascun tipo di evento avverso sarà stimata insieme a un corrispondente intervallo di confidenza esatto del 95%.

4.0 Sintesi La pandemia di Covid-19 ha creato una crisi globale che sta colpendo tutti i settori della società. Per ridurre i catastrofici impatti economici e sanitari di questo virus, sarà necessaria la disponibilità di test sicuri, economici e affidabili. Questo progetto mira a studiare l'auto-raccolta di un test rapido a basso costo (iAMP®) in tre aree anatomiche - il medioturbinato, le narici e la saliva - che, se validato, può aiutare a rendere il test diffuso una possibilità reale. L'obiettivo secondario è dimostrare che tutte queste aree possono essere raccolte autonomamente in sicurezza senza la necessità della supervisione del medico. La riduzione delle barriere ai test e all'elaborazione del Covid-19 contribuirà a mitigare questa crisi e consentirà il ritorno alle normali attività.